VPRBP - VPRBP

DCAF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3WA0, 4CC9, 4P7I, 4PXW, 4Z8L, 5AJA
Identifikátory
Aliasy	DCAF1, VPRBP, Vpr (HIV-1) vazebný protein, DDB1 a CUL4 asociovaný faktor 1, RIP
Externí ID	OMIM: 617259 MGI: 2445220 HomoloGene: 8805 Genové karty: DCAF1
EC číslo	2.7.11.1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	51,500,002 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	106,880,992 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • kinázová aktivita; • aktivita histon kinázy (specifická pro H2A-T120); • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba na estrogenový receptor;
Buněčná složka	• cytoplazma; • COP9 signalosom; • buněčné jádro; • fibrilární centrum; • Komplex ubikvitin ligázy Cul4-RING E3;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • fosforylace; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná soutěž v mnohobuněčném organismu; • ubikvitinace bílkovin; • V (D) J rekombinace; • Diferenciace B buněk; • GO: virový proces 0022415; • fosforylace histonu H2A-T120; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9730
	321006
	ENSG00000145041
	ENSMUSG00000040325
	Q9Y4B6
	Q80TR8
NM_001171904; NM_014703; NM_001349168; NM_001349169; NM_001349170;
	NM_001349171
	NM_001015507; NM_001373930; NM_001373931
NP_001165375; NP_055518; NP_001336097; NP_001336098; NP_001336099;
	NP_001336100
	NP_001015507; NP_001360859; NP_001360860
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein VPRBP je protein že u lidí je kódován VPRBP gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že VPRBP komunikovat s Merlin.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145041 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040325 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhao LJ, Mukherjee S, Narayan O (červen 1994). "Biochemický mechanismus funkce HIV-I Vpr. Specifická interakce s buněčným proteinem". The Journal of Biological Chemistry. 269 (22): 15577–82. PMID 8195203.
^ Zhang S, Feng Y, Narayan O, Zhao LJ (leden 2001). „Cytoplazmatická retence regulačního proteinu HIV-1 Vpr interakcí protein-protein s novým lidským cytoplazmatickým proteinem VprBP“. Gen. 263 (1–2): 131–40. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00583-7. PMID 11223251.
^ „Entrez Gene: VPRBP Vpr (HIV-1) binding protein“.
^ Huang J, Chen J (červenec 2008). „VprBP cílí Merlin na ligasový komplex Roc1-Cul4A-DDB1 E3 kvůli degradaci“. Onkogen. 27 (29): 4056–64. doi:10.1038 / dne 2008.44. PMID 18332868.

Další čtení

Tan L, Ehrlich E, Yu XF (říjen 2007). „DDB1 a Cul4A jsou vyžadovány pro zástavu G2 viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr“. Journal of Virology. 81 (19): 10822–30. doi:10.1128 / JVI.01380-07. PMC 2045451. PMID 17626091.
Wen X, Duus KM, Friedrich TD, de Noronha CM (září 2007). „Protein HIV1 Vpr působí na podporu zastavení buněčného cyklu G2 zapojením komplexu ubikvitin ligázy obsahujícího DDB1 a Cullin4A s použitím VprBP / DCAF1 jako adaptéru“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (37): 27046–57. doi:10,1074 / jbc.M703955200. PMID 17620334.
Hrecka K, Gierszewska M, Srivastava S, Kozaczkiewicz L, Swanson SK, Florens L, Washburn MP, Skowronski J (červenec 2007). "Lentiviral Vpr uzurpuje Cul4-DDB1 [VprBP] E3 ubikvitin ligázu k modulaci buněčného cyklu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (28): 11778–83. Bibcode:2007PNAS..10411778H. doi:10.1073 / pnas.0702102104. PMC 1906728. PMID 17609381.
Le Rouzic E, Belaïdouni N, Estrabaud E, Morel M, Rain JC, Transy C, Margottin-Goguet F (leden 2007). „HIV1 Vpr zastavuje buněčný cyklus náborem DCAF1 / VprBP, receptoru ubikvitin ligázy Cul4-DDB1“. Buněčný cyklus. 6 (2): 182–8. doi:10,4161 / cc.6.2.3732. PMID 17314515.
Borgne-Sanchez A, Dupont S, Langonné A, Baux L, Lecoeur H, Chauvier D, Lassalle M, Déas O, Brière JJ, Brabant M, Roux P, Péchoux C, Briand JP, Hoebeke J, Deniaud A, Brenner C, Rustin P, Edelman L, Rebouillat D, Jacotot E (březen 2007). „Cílené peptidy odvozené od Vpr dosahují mitochondrií k indukci apoptózy endoteliálních buněk exprimujících alfaVbeta3“. Buněčná smrt a diferenciace. 14 (3): 422–35. doi:10.1038 / sj.cdd.4402018. PMID 16888644.
Zhao LJ, Zhang S, Chinnadurai G (2002). "Transaktivace Sox9 a exprese varlat nového lidského genu, KIAA0800". Journal of Cellular Biochemistry. 86 (2): 277–89. doi:10.1002 / jcb.10214. PMID 12111997. S2CID 36090208.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (říjen 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145041 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040325 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8195203-5] Zhao LJ, Mukherjee S, Narayan O (červen 1994). "Biochemický mechanismus funkce HIV-I Vpr. Specifická interakce s buněčným proteinem". The Journal of Biological Chemistry. 269 (22): 15577–82. PMID 8195203.

[pmid11223251-6] Zhang S, Feng Y, Narayan O, Zhao LJ (leden 2001). „Cytoplazmatická retence regulačního proteinu HIV-1 Vpr interakcí protein-protein s novým lidským cytoplazmatickým proteinem VprBP“. Gen. 263 (1–2): 131–40. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00583-7. PMID 11223251.

[entrez-7] „Entrez Gene: VPRBP Vpr (HIV-1) binding protein“.

[pmid18332868-8] Huang J, Chen J (červenec 2008). „VprBP cílí Merlin na ligasový komplex Roc1-Cul4A-DDB1 E3 kvůli degradaci“. Onkogen. 27 (29): 4056–64. doi:10.1038 / dne 2008.44. PMID 18332868.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]