USP5 - USP5 - Wikipedia

USP5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DAG, 2DAK, 2G43, 2G45, 3IHP
Identifikátory
Aliasy	USP5, ISOT, ubikvitin specifická peptidáza 5
Externí ID	OMIM: 601447 MGI: 1347343 HomoloGene: 55758 Genové karty: USP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	6,866,632 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	124,829,484 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy; • aktivita peptidázy cysteinového typu; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu; • vazba iontů zinku; • ubikvitinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • vazba kovových iontů; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita;
Buněčná složka	• lysozom; • cytosol;
Biologický proces	• deubikvitinace spojená s proteinem K48; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu závislého na proteinu závislém na ubikvitinu; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • proteolýza; • deubikvitinace bílkovin; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8078
	22225
	ENSG00000111667
	ENSMUSG00000038429
	P45974
	P56399
	NM_001098536; NM_003481
	NM_013700; NM_001326594
NP_001092006; NP_003472; NP_001369517; NP_001369518; NP_001369519;
	NP_001369520
	NP_001313523; NP_038728
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin specifická peptidáza 5 je enzym že u lidí je kódován USP5 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

USP5 bylo prokázáno komunikovat s TADA3L.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111667 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038429 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Puente XS, Sánchez LM, celkově CM, López-Otín C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Genetika hodnocení přírody. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
^ Ansari-Lari MA, Muzny DM, Lu J, Lu F, Lilley CE, Spanos S, Malley T, Gibbs RA (duben 1996). „Klastr bohatý na geny mezi geny CD4 a triosefosfát izomerázy v lidském chromozomu 12p13“. Výzkum genomu. 6 (4): 314–26. doi:10,1101 / gr. 6.4.314. PMID 8723724.
^ „Entrez Gene: USP5 ubikvitinová specifická peptidáza 5 (isopeptidáza T)“.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Další čtení

D'Andrea A, Pellman D (1999). „Deubikvitinační enzymy: nová třída biologických regulátorů“. Kritické recenze v biochemii a molekulární biologii. 33 (5): 337–52. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Falquet L, Paquet N, Frutiger S, Hughes GJ, Hoang-Van K, Jaton JC (prosinec 1995). „cDNA klonování lidského 100 kDa de-ubikvitinačního enzymu: 100 kDa lidská de-ubikvitináza patří do rodiny ubikvitinových C-terminálních hydroláz 2 (UCH2)“. FEBS Dopisy. 376 (3): 233–7. doi:10.1016/0014-5793(95)01287-7. PMID 7498549. S2CID 19521632.
Wilkinson KD, Tashayev VL, O'Connor LB, Larsen CN, Kasperek E, Pickart CM (listopad 1995). „Metabolismus signálu degradace polyubikvitinu: struktura, mechanismus a role isopeptidázy T“. Biochemie. 34 (44): 14535–46. doi:10.1021 / bi00044a032. PMID 7578059.
Falquet L, Paquet N, Frutiger S, Hughes GJ, Hoang-Van K, Jaton JC (únor 1995). "Lidský de-ubikvitinační enzym s aktivitou isopeptidázy i peptidázy in vitro". FEBS Dopisy. 359 (1): 73–7. doi:10.1016/0014-5793(94)01451-6. PMID 7851534. S2CID 39667023.
Ansari-Lari MA, Shen Y, Muzny DM, Lee W, Gibbs RA (březen 1997). "Rozsáhlé sekvenování v lidském chromozomu 12p13: experimentální a výpočetní stanovení genové struktury". Výzkum genomu. 7 (3): 268–80. doi:10,1101 / gr. 7.3268. PMID 9074930.
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S (květen 2001) . „Identifikace a charakterizace potenciálních promotorových oblastí 1031 druhů lidských genů“. Výzkum genomu. 11 (5): 677–84. doi:10,1101 / gr. Gr-1640r. PMC 311086. PMID 11337467.
Engidawork E, Juranville JF, Fountoulakis M, Dierssen M, Lubec G (2002). „Selektivní upregulace proteinů proteolytické dráhy ubikvitin-proteazomu, zeta řetězce proteazomu a isopeptidázy T u fetálního Downova syndromu“. Exprese proteinů v mozku s Downovým syndromem. Journal of Neural Transmission. Supplementum. 117–30. doi:10.1007/978-3-7091-6262-0_10. ISBN 978-3-211-83704-7. PMID 11771738.
Gabriel JM, Lacombe T, Carobbio S, Paquet N, Bisig R, Cox JA, Jaton JC (listopad 2002). „Zinek je nezbytný pro katalytickou aktivitu lidské deubikvitinační isopeptidázy T“. Biochemie. 41 (46): 13755–66. doi:10,1021 / bi026096m. PMID 12427038.
Lacombe T, Gabriel JM (listopad 2002). "Další charakterizace předpokládaného katalytického místa lidské isopeptidázy T". FEBS Dopisy. 531 (3): 469–74. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03586-X. PMID 12435595. S2CID 26832850.
Anderson NL, Polanski M, Pieper R, Gatlin T, Tirumalai RS, Conrads TP, Veenstra TD, Adkins JN, Pounds JG, Fagan R, Lobley A (duben 2004). „Lidský plazmatický proteom: neredundantní seznam vyvinutý kombinací čtyř samostatných zdrojů“. Molekulární a buněčná proteomika. 3 (4): 311–26. doi:10,1074 / mcp.M300127-MCP200. PMID 14718574.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Reyes-Turcu FE, Horton JR, Mullally JE, Heroux A, Cheng X, Wilkinson KD (březen 2006). „Ubiquitinová vazebná doména ZnF UBP rozpoznává C-koncový diglycinový motiv nezakotveného ubikvitinu“. Buňka. 124 (6): 1197–208. doi:10.1016 / j.cell.2006.02.038. PMID 16564012. S2CID 1312137.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111667 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038429 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12838346-5] Puente XS, Sánchez LM, celkově CM, López-Otín C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Genetika hodnocení přírody. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.

[pmid8723724-6] Ansari-Lari MA, Muzny DM, Lu J, Lu F, Lilley CE, Spanos S, Malley T, Gibbs RA (duben 1996). „Klastr bohatý na geny mezi geny CD4 a triosefosfát izomerázy v lidském chromozomu 12p13“. Výzkum genomu. 6 (4): 314–26. doi:10,1101 / gr. 6.4.314. PMID 8723724.

[entrez-7] „Entrez Gene: USP5 ubikvitinová specifická peptidáza 5 (isopeptidáza T)“.

[pmid16189514-8] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]