Doména C4 kolagenu typu IV - Type IV collagen C4 domain - Wikipedia
| C4 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura 1.9-a nekolagenní (nc1) domény kolagenu lidské placenty iv vykazuje stabilizaci prostřednictvím nového typu kovalentního síťování met-lys | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | C4 | ||||||||
| Pfam | PF01413 | ||||||||
| Pfam klan | CL0056 | ||||||||
| InterPro | IPR001442 | ||||||||
| CHYTRÝ | C4 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00031 | ||||||||
| MEROPS | C47 | ||||||||
| SCOP2 | 1hra / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 2.A.16 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se doména C4 kolagenu typu IV (nebo kolagenová IV NC1 doména) je duplikát doména přítomný na C-konci kolageny typu IV. Každý kolagen typu IV obsahuje dlouhou trojšroubovicovou kolagenní doménu lemovanou krátkou doménou 7S o 25 aminokyseliny a globulární nekolagenní C4 doména ~ 230 aminokyselin na N a C konci. V sestavě protomeru domény C4 tří řetězců interagují a vytvářejí trimer C4 pro výběr a registraci řetězců trojitá šroubovice formace. V síťové sestavě C4 vyžínače ze dvou protomerů interagují a tvoří hexamerovou strukturu C4, aby vybrali a připojili protomery.[1][2][3]
Kolagenová IV doména C4 obsahuje 12 cysteiny a všichni jsou zapojeni do disulfidové vazby. To záhyby do terciární struktura s převážně beta-vlákny. Kolagenová doména IV C4 se skládá ze dvou podobně složený subdomény stabilizované 3 intrařetězcovými disulfidovými vazbami zahrnujícími následující páry: C1-C6, C2-C5 a C3-C4. Každá subdoména představuje kompaktní trojúhelníkovou strukturu stabilizovanou disulfidem, ze které je podobný prst vlásenka projekty do neúplně zformovaného šestivláknového beta-list sousední subdomény stejného nebo sousedního řetězce upínající subdomény těsně k sobě.[1][2][3]
Reference
- ^ A b Than ME, Henrich S, Huber R, Ries A, Mann K, Kuhn K, Timpl R, Bourenkov GP, Bartunik HD, Bode W (květen 2002). „Krystalová struktura 1.9-A nekolagenní (NC1) domény kolagenu lidské placenty IV vykazuje stabilizaci prostřednictvím nového typu kovalentního síťování Met-Lys“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (10): 6607–12. doi:10.1073 / pnas.062183499. PMC 124450. PMID 12011424.
- ^ A b Sundaramoorthy M, Meiyappan M, Todd P, Hudson BG (srpen 2002). "Krystalová struktura domén NC1. Strukturální základ pro kolagenové složení typu IV v bazálních membránách". J. Biol. Chem. 277 (34): 31142–53. doi:10,1074 / jbc.M201740200. PMID 11970952.
- ^ A b Vanacore RM, Shanmugasundararaj S, Friedman DB, Bondar O, Hudson BG, Sundaramoorthy M (říjen 2004). „Síť kolagenu alfa1.alpha2 IV. Posílená stabilizace nekolagenní domény-1 nekovalentními silami a absence síťovacích vazeb Met-Lys“. J. Biol. Chem. 279 (43): 44723–30. doi:10,1074 / jbc.M406344200. PMID 15299013.