Trojlístek faktor 3 - Trefoil factor 3

TFF3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E9T, 1PE3
Identifikátory
Aliasy	TFF3, ITF, P1B, TFI, trojlístek faktor 3
Externí ID	OMIM: 600633 MGI: 104638 HomoloGene: 2427 Genové karty: TFF3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	42,315,651 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	31,129,646 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární; • extracelulární oblast; • sekreční granule;
Biologický proces	• hojení ran; • regulace metabolismu glukózy; • udržování gastrointestinálního epitelu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7033
	21786
	ENSG00000160180
	ENSMUSG00000024029
	Q07654
	Q62395
	NM_003226
	NM_011575
	NP_003217
	NP_035705
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trojlístek faktor 3 je protein že u lidí je kódován TFF3 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Členové rodiny trojlístků se vyznačují tím, že mají alespoň jednu kopii trojlístek motiv, 40-aminokyselinová doména, která obsahuje tři konzervované disulfidové vazby. Jsou to stabilní sekreční proteiny exprimované v gastrointestinální sliznici. Jejich funkce jsou rozmanité, včetně ochrany sliznice, zesílení hlenu a zvýšení rychlosti hojení epitelu. Tento gen je markerem sloupcového epitelu a je exprimován v různých tkáních včetně pohárové buňky střev a tlustého střeva. Tento gen a dva další příbuzné geny členů rodiny trojlístků se nacházejí v klastru na chromozomu 21.^[7]

Glykanová vazba

Všechny tři lidské trojlístkové faktory jsou lektiny které interagují specificky s disacharidem GlcNAc-α-1,4-Gal.^[8] Tento disacharid je neobvyklý glykotop, o kterém je známo, že existuje pouze na velkých, silně glykosylovaných, muciny ve sliznici. Zesíťováním muciny prostřednictvím bivalentní vazby tohoto glykotopu jsou pak trojlístkové faktory schopny reverzibilně modulovat tloušťku a viskozitu hlenu.^[8]

V mateřském mléce

Trojlístkové faktory (TFF) jsou sekreční produkty buněk produkujících mucin. Hrají klíčovou roli při udržování povrchové integrity ústní sliznice a zlepšují hojení gastrointestinální sliznice procesem nazývaným restituce. TFF zahrnuje žaludeční peptidy (TFF1 ), spasmolytický peptid (TFF2 ) a faktor střevního trojlístku (TFF3, tento protein). Mají důležitou a nezbytnou roli při restituci epitelu v gastrointestinálním traktu. V lidském mléce je přítomno významné množství TFF. Byly předloženy důkazy, že TFF3 izolovaný z mléka silně koreluje s regulací down IL-6 a IL-8 v lidských intestinálních epiteliálních buňkách. Na druhou stranu TFF3 aktivoval epiteliální buňky v kultuře za vzniku beta defensinů 2 (hBD2) a beta defensinů 4 (hBD4). Tato zjištění naznačují, že TFF může aktivovat střevní epiteliální buňky a mohl by se aktivně podílet na imunitním systému kojených dětí indukcí produkce peptidů souvisejících s vrozenou obranou, jako jsou defensiny.^[9]

Aktivace receptorů PAR-2

Byly popsány dva hlavní mechanismy aktivace PAR-2: (A) specifickým štěpením, které demaskuje peptidovou sekvenci aktivující receptor přítomnou v extracelulární N-koncové doméně každého PAR, což vede k buněčné signalizaci prostřednictvím interakce exponovaného uvázaného ligand s tělem samotného receptoru; a (B) syntetickými peptidy, jako je SLIGKV, které se vážou na receptor a napodobují působení agonistických proteáz.^[10] Během laktace může TFF3 vylučovaný do lidského mléka aktivovat intestinální epiteliální buňky prostřednictvím receptorů PAR-2, což zase indukuje expresi hBD2 a hBD4 a regulaci cytokinů.^[10]

Klinický význam

S využitím TFF3 jako markeru sloupcového epitelu byl vyvinut proces využívající požité zařízení pro odběr vzorků jícnu (Cytosponge) spolu s imunocytochemií pro trojlístkový faktor 3, aby se zlepšila přesnost a přijatelnost detekce / screeningu Barrettova jícnu.^[11]Klinická použitelnost takového testu však může být omezena častým barvením TFF3 v žaludku a následným rizikem falešně pozitivních výsledků.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160180 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024029 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Thim L, Woldike HF, Nielsen PF, Christensen M, Lynch-Devaney K, Podolsky DK (květen 1995). "Charakterizace lidského a potkaního střevního trojlístkového faktoru produkovaného v kvasinkách". Biochemie. 34 (14): 4757–64. doi:10.1021 / bi00014a033. PMID 7718582.
^ Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (květen 1997). "Lidské trojlístkové peptidy: genomová struktura v 21q22.3 a koordinovaná exprese". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TFF3 trojlístek faktor 3 (střevní)“.
^ ^A ^b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (květen 2020). „Trojlístkové faktory sdílejí aktivitu lektinu, která definuje jejich roli v hlenu“. Příroda komunikace. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038 / s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.
^ Barrera GJ, Sanchez G, Gonzalez JE (listopad 2012). „Trojlístek faktor 3 izolovaný z lidského mateřského mléka downreguluje cytokiny (IL8 a IL6) a podporuje expresi lidského beta defensinu (hBD2 a hBD4) ve střevních epiteliálních buňkách HT-29“. Bosn J Basic Med Sci. 12 (4): 256–64. doi:10.17305 / bjbms.2012.2448. PMC 4362502. PMID 23198942.
^ ^A ^b Barrera GJ, Tortolero GS (2016). „Trojlístek faktor 3 (TFF3) z lidského mateřského mléka aktivuje receptory PAR-2 střevních epiteliálních buněk HT-29, reguluje cytokiny a defensiny“. Bratislavské LekáRske Listy. 117 (6): 332–9. doi:10,4149 / bll_2016_066. PMID 27546365.
^ Kadri SR, Lao-Sirieix P, O'Donovan M, Debiram I, Das M, Blazeby JM, Emery J, Boussioutas A, Morris H, Walter FM, Pharoah P, Hardwick RH, Fitzgerald RC (2010). „Přijatelnost a přesnost neendoskopického screeningového testu na Barrettův jícen v primární péči: kohortní studie“. BMJ. 341: c4372. doi:10.1136 / bmj.c4372. PMC 2938899. PMID 20833740.
^ Peitz U, Kouznetsova I, Wex T, Gebert I, Vieth M, Roessner A, Hoffmann W, Malfertheiner P (2004). "Exprese TFF3 v esofagogastrickém spojení je zvýšena u gastroezofageální refluxní choroby (GERD)". Peptidy. 25 (5): 771–7. doi:10.1016 / j.peptides.2004.01.018. PMID 15177871. S2CID 23122603.

Další čtení

Barrera GJ, Sanchez G, Gonzalez JE (2012). „Trojlístek faktor 3 izolovaný z lidského mateřského mléka downreguluje cytokiny (IL8 a IL6) a podporuje expresi lidského beta defensinu (hBD2 a hBD4) ve střevních epiteliálních buňkách HT-29“. Bosn J Basic Med Sci. 12 (4): 256–64. doi:10.17305 / bjbms.2012.2448. PMC 4362502. PMID 23198942.
Hoffmann W, Jagla W, Wiede A (2001). "Molekulární medicína TFF-peptidů: ze střev do mozku". Histol. Histopathol. 16 (1): 319–34. PMID 11193208.
Hoffmann W, Jagla W (2002). "Specifická exprese sekrečních TFF peptidů na buněčný typ: kolokalizace s muciny a syntéza v mozku". Int. Reverend Cytol. International Review of Cytology. 213: 147–81. doi:10.1016 / S0074-7696 (02) 13014-2. ISBN 978-0-12-364617-0. PMID 11837892.
Langer G, Jagla W, Behrens-Baumann W a kol. (2003). "Oční TFF-peptidy: nové sekreční produkty spojené s hlenem spojivkových pohárkových buněk". Adv. Exp. Med. Biol. 506 (Pt A): 313–6. doi:10.1007/978-1-4615-0717-8_44. PMID 12613926.
Seib T, Dooley S, Welter C (1995). "Charakterizace genomové struktury a promotorové oblasti faktoru lidského střevního trojlístku". Biochem. Biophys. Res. Commun. 214 (1): 195–9. doi:10.1006 / bbrc.1995.2274. PMID 7669039.
Podolsky DK, Gerken G, Eyking A, Cario E (2009). „Varianta TLR2 spojená s kolitidou způsobuje zhoršenou opravu sliznice kvůli nedostatku TFF3“. Gastroenterologie. 137 (1): 209–20. doi:10.1053 / j.gastro.2009.03.007. PMC 2812790. PMID 19303021.
Hauser F, Poulsom R, Chinery R a kol. (1993). „hP1.B, lidský peptid P-domény homologní s faktorem střevního trojlístku potkana, je exprimován také v buněčné linii asociované s vředy a děloze“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (15): 6961–5. Bibcode:1993PNAS ... 90.6961H. doi:10.1073 / pnas.90.15.6961. PMC 47055. PMID 8346203.
Podolsky DK, Lynch-Devaney K, Stow JL a kol. (1993). "Identifikace faktoru lidského střevního trojlístku. Specifická exprese peptidu zaměřeného na apikální sekreci pro pohárkovou buňku". J. Biol. Chem. 268 (9): 6694–702. PMID 8454642.
Schmitt H, Wundrack I, Beck S a kol. (1996). "Třetí P-doménový peptidový gen (TFF3), lidský střevní trojlístkový faktor, se mapuje na 21q22.3". Cytogenet. Cell Genet. 72 (4): 299–302. doi:10.1159/000134208. PMID 8641134.
Chinery R, Williamson J, Poulsom R (1997). „Gen kódující lidský střevní trojlístkový faktor (TFF3) je lokalizován na chromozomu 21q22.3 seskupeném s dalšími členy rodiny trojlístkových peptidů“. Genomika. 32 (2): 281–4. doi:10.1006 / geno.1996.0117. PMID 8833157.
Probst JC, Zetzsche T, Weber M a kol. (1997). „Faktor lidského střevního trojlístku je vyjádřen v lidském hypotalamu a hypofýze: důkaz nového neuropeptidu“. FASEB J.. 10 (13): 1518–23. doi:10.1096 / fasebj.10.13.8940297. PMID 8940297. S2CID 34974159.
Seib T, Blin N, Hilgert K a kol. (1997). „Tři lidské trojlístkové geny TFF1, TFF2 a TFF3 jsou umístěny v oblasti 55 kb na chromozomu 21q22.3“. Genomika. 40 (1): 200–2. doi:10.1006 / geno.1996.4511. PMID 9070946.
Tan XD, Liu QP, Hsueh W a kol. (1999). „Faktor trojlístku střeva se váže na buňky epitelu střeva a indukuje produkci oxidu dusnatého: aktivace a zesílení účinků mucinu“. Biochem. J. 338 (3): 745–51. doi:10.1042/0264-6021:3380745. PMC 1220112. PMID 10051448.
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD a kol. (2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Berry A, Scott HS, Kudoh J a kol. (2001). „Rafinovaná lokalizace autosomálně recesivní nonsyndromické hluchoty lokusu DFNB10 pomocí 34 nových mikrosatelitních markerů, genomové struktury a vyloučení šesti známých genů v regionu“. Genomika. 68 (1): 22–9. doi:10,1006 / geno.2000.6253. PMID 10950923.
Wiede A, Hinz M, Canzler E a kol. (2001). „Syntéza a lokalizace TFF peptidů asociovaných s mucinem v lidské děloze“. Cell Tissue Res. 303 (1): 109–15. doi:10,1007 / s004410000297. PMID 11235998. S2CID 35516062.
Yamachika T, Werther JL, Bodian C a kol. (2002). "Faktor střevního trojlístku: ukazatel špatné prognózy u karcinomu žaludku". Clin. Cancer Res. 8 (5): 1092–9. PMID 12006524.
Kimura Y, Leung PS, Kenny TP a kol. (2002). "Diferenciální exprese faktoru střevního trojlístku v biliárních epiteliálních buňkách primární biliární cirhózy". Hepatologie. 36 (5): 1227–35. doi:10.1053 / jhep.2002.36157. PMID 12395334. S2CID 23931292.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q07654 (Trojlístek faktor 3) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160180 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024029 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7718582-5] Thim L, Woldike HF, Nielsen PF, Christensen M, Lynch-Devaney K, Podolsky DK (květen 1995). "Charakterizace lidského a potkaního střevního trojlístkového faktoru produkovaného v kvasinkách". Biochemie. 34 (14): 4757–64. doi:10.1021 / bi00014a033. PMID 7718582.

[pmid9043862-6] Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (květen 1997). "Lidské trojlístkové peptidy: genomová struktura v 21q22.3 a koordinovaná exprese". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TFF3 trojlístek faktor 3 (střevní)“.

[Järvå_2020-8] A ^b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (květen 2020). „Trojlístkové faktory sdílejí aktivitu lektinu, která definuje jejich roli v hlenu“. Příroda komunikace. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038 / s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.

[pmid23198942-9] Barrera GJ, Sanchez G, Gonzalez JE (listopad 2012). „Trojlístek faktor 3 izolovaný z lidského mateřského mléka downreguluje cytokiny (IL8 a IL6) a podporuje expresi lidského beta defensinu (hBD2 a hBD4) ve střevních epiteliálních buňkách HT-29“. Bosn J Basic Med Sci. 12 (4): 256–64. doi:10.17305 / bjbms.2012.2448. PMC 4362502. PMID 23198942.

[Barrera_2016-10] A ^b Barrera GJ, Tortolero GS (2016). „Trojlístek faktor 3 (TFF3) z lidského mateřského mléka aktivuje receptory PAR-2 střevních epiteliálních buněk HT-29, reguluje cytokiny a defensiny“. Bratislavské LekáRske Listy. 117 (6): 332–9. doi:10,4149 / bll_2016_066. PMID 27546365.

[pmid20833740-11] Kadri SR, Lao-Sirieix P, O'Donovan M, Debiram I, Das M, Blazeby JM, Emery J, Boussioutas A, Morris H, Walter FM, Pharoah P, Hardwick RH, Fitzgerald RC (2010). „Přijatelnost a přesnost neendoskopického screeningového testu na Barrettův jícen v primární péči: kohortní studie“. BMJ. 341: c4372. doi:10.1136 / bmj.c4372. PMC 2938899. PMID 20833740.

[pmid15177871-12] Peitz U, Kouznetsova I, Wex T, Gebert I, Vieth M, Roessner A, Hoffmann W, Malfertheiner P (2004). "Exprese TFF3 v esofagogastrickém spojení je zvýšena u gastroezofageální refluxní choroby (GERD)". Peptidy. 25 (5): 771–7. doi:10.1016 / j.peptides.2004.01.018. PMID 15177871. S2CID 23122603.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]