Transport v 1 - Transportin 1
Transportin-1 (nebo Importin-β 2) je protein že u lidí je kódován TNPO1 gen.[5][6][7]
Funkce
Tento protein je karyofherin který interaguje s sekvence nukleární lokalizace zaměřit jaderné proteiny na jádro. Klasický komplex receptoru karyoferinu, jako je komplex, který používá Importin-β1 (kódovaný genem KPNB1 ), je heterodimer alfa podjednotky, který rozpoznává signál lokalizace jader, a beta podjednotky, která dokuje komplex na nukleoporiny. Transportin-1 se však může přímo vázat na proteiny nákladu a nemusí k tomu potřebovat podjednotku importin alfa.[8]
Předpokládá se, že Transportin-1 používá stejný hlavní mechanismus k provádění jaderného transportu jako ostatní Importiny. Zprostředkovává dokování do komplex jaderných pórů prostřednictvím vazby na nukleoporin a je následně translokován póry mechanismem vyžadujícím energii. Poté se v jádře Ran váže na Transportin-1, disociuje se z nákladu a Transportin-1 se znovu exportuje z jádra do cytoplazmy, kde GTP hydrolýza uvolňuje Ran. Pak Transportin-1 může svobodně vázat nový náklad.
Transportin-1 je navíc zapojen do pomoci transportu bílkovin do primárních cilium.[9] Funkce Transportin-1 je v tomto případě považována za podobnou přenosu proteinů do jádra přes jaderný pór. Transportin-1 váže náklad a poté pomáhá tomuto nákladu projít póry ve spodní části cilium. Ran a nukleoporiny jsou také zapojeny do tohoto mechanismu.[10]
Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu kódujícím různé proteiny.[7]
Cíle
Transportin 1 (TRN1) je součástí neklasické cesty importu jaderných zbraní. Ve spojení s RanGTP hydrolýzní kaskáda TRN1 působí tak, že importuje výběr proteinů do jádra buněk. Tyto cíle typicky obsahují PY-motiv, jinak známý jako M9 jaderný lokalizační signál. Mezi dobře popsané příklady patří hnRNP A1.[11]
Typ nákladních proteinů, které Transportin 1 může nést do jádra, zahrnuje proteiny vázající RNA (jako je hnRNP Al a hnRNP F) a také ribozomální proteiny.[12]
Klinický význam
TRN1 se podílí na patogenezi dvou neurodegenerativních onemocnění, jmenovitě Amyotrofní laterální skleróza a frontotemporální demence.[13]
Interakce
Transportin 1 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000083312 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009470 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Pollard VW, Michael WM, Nakielny S, Siomi MC, Wang F, Dreyfuss G (prosinec 1996). "Nová cesta importu jaderných proteinů zprostředkovaná receptory". Buňka. 86 (6): 985–94. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80173-7. PMID 8808633. S2CID 15666255.
- ^ Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (červen 1997). „Karyopherin beta2 zprostředkovává jaderný import proteinu vázajícího mRNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (10): 5055–60. doi:10.1073 / pnas.94.10.5055. PMC 24630. PMID 9144189.
- ^ A b „Entrez Gene: transport TNPO1 v 1“.
- ^ R.A. Fridell (1997). Jaderný import hnRNP A1 je zprostředkován novým buněčným kofaktorem souvisejícím s karyoferinem-beta. Journal of Cell Science 1997 110: 1325-1331;
- ^ Toby W. Hurd (2011). Lokalizace retinitis pigmentosa 2 na řasinky je regulována importinem β2. J Cell Sci 2011 124: 718-726; doi: 10,1242 / jcs.070839
- ^ Kee HL (2012). Bariéra propustnosti pro vylučování podle velikosti a nukleoporiny charakterizují komplex řasnatých pórů, který reguluje transport do řasinek.. Nat. Cell Biol. 2012 4. března; 14 (4): 431-7. doi: 10,1038 / ncb2450.
- ^ Dormann D, Rodde R, Edbauer D, Bentmann E, Fischer I, Hruscha A, Than ME, Mackenzie IR, Capell A, Schmid B, Neumann M, Haass C (srpen 2010). „Mutace spojené s ALS v mutacích sarkomu (FUS) narušují jaderný import zprostředkovaný transportem“. EMBO J.. 29 (16): 2841–57. doi:10.1038 / emboj.2010.143. PMC 2924641. PMID 20606625.
- ^ Anne-Christine Ström (2001). Importin-beta podobné jaderné transportní receptory. Genome Biol. 2001; 2 (6): reviews3008.1 – reviews3008.9.
- ^ Brelstaff J, Lashley T, Holton JL, Lees AJ, Rossor MN, Bandopadhyay R, Revesz T (listopad 2011). "Transportin1: značka FTLD-FUS". Acta Neuropathol. 122 (5): 591–600. doi:10.1007 / s00401-011-0863-6. PMID 21847626. S2CID 5913873.
- ^ Cai Y, Miao SY, Wang LF (říjen 2001). „[Stanovení vazebného místa varlat specifického nukleoporinu BS-63 na transportin (karopherin beta 2) a důkaz jejich kombinace in vitro]“. Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao (v čínštině). 23 (5): 462–6. PMID 12905863.
- ^ Chook YM, Blobel G (květen 1999). "Struktura komplexu jaderného transportu karyopherin-beta2-Ran x GppNHp". Příroda. 399 (6733): 230–7. doi:10.1038/20375. PMID 10353245. S2CID 4413233.
- ^ Shamsher MK, Ploski J, Radu A (říjen 2002). „Karyopherin beta 2B se podílí na exportu mRNA z jádra“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (22): 14195–9. doi:10.1073 / pnas.212518199. PMC 137860. PMID 12384575.
Další čtení
- Bukrinsky MI, Haffar OK (1997). „Jaderný import HIV-1: při hledání vůdce“. Přední. Biosci. 2 (4): d578-87. doi:10.2741 / A213. PMID 9366553.
- Bukrinsky MI, Haffar OK (1998). „Jaderný import HIV-1: maticový protein je zpět v centru pozornosti, tentokrát společně s Vpr“. Mol. Med. 4 (3): 138–43. doi:10.1007 / BF03401911. PMC 2230352. PMID 9562972.
- Bukrinsky MI, Sharova N, Dempsey MP, Stanwick TL, Bukrinskaya AG, Haggerty S, Stevenson M (1992). „Aktivní jaderný import preintegračních komplexů viru lidské imunodeficience typu 1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (14): 6580–4. doi:10.1073 / pnas.89.14.6580. PMC 49545. PMID 1631159.
- Moroianu J, Hijikata M, Blobel G, Radu A (1995). "Savčí karyoferin alfa 1 beta a alfa 2 beta heterodimery: alfa 1 nebo alfa 2 podjednotka váže signál nukleární lokalizace a beta podjednotka interaguje s nukleoporiny obsahujícími peptidové opakování". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (14): 6532–6. doi:10.1073 / pnas.92.14.6532. PMC 41552. PMID 7604027.
- Bukrinsky MI, Haggerty S, Dempsey MP, Sharova N, Adzhubel A, Spitz L, Lewis P, Goldfarb D, Emerman M, Stevenson M (1993). "Signál nukleární lokalizace v proteinu matrice HIV-1, který řídí infekci nedělících se buněk". Příroda. 365 (6447): 666–9. doi:10.1038 / 365666a0. PMID 8105392. S2CID 25678.
- Michael WM, Choi M, Dreyfuss G (1995). „Signál jaderného exportu v hnRNP A1: signální cesta teploty závislá na exportu jaderného proteinu závislá na teplotě“. Buňka. 83 (3): 415–22. doi:10.1016/0092-8674(95)90119-1. PMID 8521471. S2CID 615927.
- Nakielny S, Siomi MC, Siomi H, Michael WM, Pollard V, Dreyfuss G (1996). "Transportin: jaderný transportní receptor nové cesty importu jaderných proteinů". Exp. Cell Res. 229 (2): 261–6. doi:10.1006 / excr.1996.0369. PMID 8986607.
- Fridell RA, Truant R, Thorne L, Benson RE, Cullen BR (1997). „Jaderný import hnRNP A1 je zprostředkován novým buněčným kofaktorem souvisejícím s karyoferinem-beta“. J. Cell Sci. 110 (11): 1325–31. PMID 9202393.
- Gallay P, Hope T, Chin D, Trono D (1997). „HIV-1 infekce nedělících se buněk rozpoznáním integrázy cestou importin / karyoferin“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (18): 9825–30. doi:10.1073 / pnas.94.18.9825. PMC 23276. PMID 9275210.
- Siomi MC, Eder PS, Kataoka N, Wan L, Liu Q, Dreyfuss G (1997). "Transportinem zprostředkovaný jaderný import heterogenních jaderných proteinů RNP". J. Cell Biol. 138 (6): 1181–92. doi:10.1083 / jcb.138.6.1181. PMC 2132560. PMID 9298975.
- Henderson BR, Percipalle P (1997). „Interakce mezi HIV Rev a jadernými importními a exportními faktory: signál nukleární lokalizace Rev zprostředkovává specifickou vazbu na lidský importin-beta“. J. Mol. Biol. 274 (5): 693–707. doi:10.1006 / jmbi.1997.1420. PMID 9405152.
- Efthymiadis A, Briggs LJ, Jans DA (1998). „Sekvence nukleární lokalizace HIV-1 Tat propůjčuje nové vlastnosti importu jádra“. J. Biol. Chem. 273 (3): 1623–8. doi:10.1074 / jbc.273.3.1623. PMID 9430704.
- Vodička MA, Koepp DM, Silver PA, Emerman M (1998). „HIV-1 Vpr interaguje s cestou transportu jader za účelem podpory infekce makrofágů“. Genes Dev. 12 (2): 175–85. doi:10.1101 / gad.12.2.175. PMC 316441. PMID 9436978.
- Popov S, Rexach M, Zybarth G, Reiling N, Lee MA, Ratner L, Lane CM, Moore MS, Blobel G, Bukrinsky M (1998). „Virový protein R reguluje jaderný import předintegračního komplexu HIV-1“. EMBO J.. 17 (4): 909–17. doi:10.1093 / emboj / 17.4.909. PMC 1170440. PMID 9463369.
- Popov S, Rexach M, Ratner L, Blobel G, Bukrinsky M (1998). „Virový protein R reguluje dokování preintegračního komplexu HIV-1 do komplexu jaderných pórů“. J. Biol. Chem. 273 (21): 13347–52. doi:10.1074 / jbc.273.21.13347. PMID 9582382.
- Fouchier RA, Meyer BE, Simon JH, Fischer U, Albright AV, González-Scarano F, Malim MH (1998). „Interakce proteinu Vpr viru lidské imunodeficience typu 1 s komplexem jaderných pórů“. J. Virol. 72 (7): 6004–13. doi:10.1128 / JVI.72.7.6004-6013.1998. PMC 110405. PMID 9621063.