RGPD5 - RGPD5

RGPD5
Identifikátory
Aliasy	RGPD5, BS-63, BS63, HEL161, RGP5, RANBP2 podobné a doména GRIP obsahující 5, RANBP2 podobné a doména GRIP obsahující 5
Externí ID	OMIM: 612708 MGI: 894323 HomoloGene: 87808 Genové karty: RGPD5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	109,857,705 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	58,494,356 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • Proběhla vazba GTPázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • jaderný pór; • centrosome;
Biologický proces	• intracelulární transport; • Import proteinů nesoucích NLS do jádra; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84220
	19386
	ENSG00000015568
	ENSMUSG00000003226
	Q99666
	Q9ERU9
	NM_005054; NM_032260
	NM_011240
	NP_005045; NP_115636
	NP_035370
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein podobný RANBP2 a GRIP doméně 5 je protein že u lidí je kódován RGPD5 gen.^[5]^[6]^[7]

RAN je malý protein vázající GTP z nadčeledi RAS, který je spojen s jadernou membránou a předpokládá se, že prostřednictvím interakcí s jinými proteiny řídí celou řadu buněčných funkcí. Tento gen sdílí vysoký stupeň sekvenční identity s RANBP2, velkým proteinem vázajícím RAN lokalizovaným na cytoplazmatické straně komplexu jaderných pórů. Předpokládá se, že tento člen rodiny genů RANBP2 vznikl z události duplikace 3 Mb distálně od RANBP2. U tohoto místa bylo pozorováno alternativní sestřih a jsou popsány dvě varianty. Doporučuje se další sestřih, ale úplná sekvence pro další přepisy nebyla stanovena.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že RGPD5 komunikovat s Transport v 1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000015568 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003226 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ciccarelli FD, von Mering C, Suyama M, Harrington ED, Izaurralde E, Bork P (březen 2005). „Složité genomové přesmyky vedou k nové genové funkci primátů“. Výzkum genomu. 15 (3): 343–51. doi:10,1101 / gr. 3266405. PMC 551560. PMID 15710750.
^ Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, Fulton LA, Pepin KH, Minx P a kol. (Duben 2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RGPD5 RANBP2-like a GRIP doména obsahující 5“.
^ Cai Y, Miao SY, Wang LF (říjen 2001). „[Stanovení vazebného místa varlat specifického nukleoporinu BS-63 na transportin (karopherin beta 2) a důkaz jejich kombinace in vitro]“. Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae. 23 (5): 462–6. PMID 12905863.

Další čtení

Cai Y, Miao SY, Wang LF (říjen 2001). „[Stanovení vazebného místa varlat specifického nukleoporinu BS-63 na transportin (karopherin beta 2) a důkaz jejich kombinace in vitro]“. Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae. 23 (5): 462–6. PMID 12905863.
Cai Y, Gao Y, Sheng Q, Miao S, Cui X, Wang L, Zong S, Koide SS (leden 2002). "Charakterizace a potenciální funkce nového varlat specifického nukleoporinu BS-63". Molekulární reprodukce a vývoj. 61 (1): 126–34. doi:10,1002 / mrd.1139. PMID 11774384. S2CID 23631919.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Wang LF, Zhu HD, Miao SY, Cao DF, Wu YW, Zong SD, Koide SS (1999). „Molekulární klonování a charakterizace nového genu pro nukleoporiny specifického pro varlata“. Archivy andrologie. 42 (2): 71–84. doi:10.1080/014850199262904. PMID 10101573.
Nothwang HG, Rensing C, Kübler M, Denich D, Brandl B, Stubanus M, Haaf T, Kurnit D, Hildebrandt F (únor 1998). „Identifikace nového genu Ran vázajícího se na protein 2 (RANBP2L1) a detekce genového klastru na lidském chromozomu 2q11-q12“. Genomika. 47 (3): 383–92. doi:10.1006 / geno.1997.5119. PMID 9480752.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000015568 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003226 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15710750-5] Ciccarelli FD, von Mering C, Suyama M, Harrington ED, Izaurralde E, Bork P (březen 2005). „Složité genomové přesmyky vedou k nové genové funkci primátů“. Výzkum genomu. 15 (3): 343–51. doi:10,1101 / gr. 3266405. PMC 551560. PMID 15710750.

[pmid15815621-6] Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, Fulton LA, Pepin KH, Minx P a kol. (Duben 2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RGPD5 RANBP2-like a GRIP doména obsahující 5“.

[pmid12905863-8] Cai Y, Miao SY, Wang LF (říjen 2001). „[Stanovení vazebného místa varlat specifického nukleoporinu BS-63 na transportin (karopherin beta 2) a důkaz jejich kombinace in vitro]“. Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae. 23 (5): 462–6. PMID 12905863.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]