Transmembránový protein 134 - Transmembrane protein 134 - Wikipedia

tento článek potřebuje další citace pro ověření. Prosím pomozte vylepšit tento článek podle přidávání citací ke spolehlivým zdrojům. Zdroj bez zdroje může být napaden a odstraněn. Najít zdroje: „Transmembránový protein 134“  – zprávy  · noviny  · knihy  · učenec  · JSTOR (Listopad 2015) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)

TMEM134
Identifikátory
Aliasy	TMEM134, 2410001H17Rik, AI463452, transmembránový protein 134
Externí ID	MGI: 1914240 HomoloGene: 11837 Genové karty: TMEM134
Umístění genu (člověk) Chr. Chromozom 11 (lidský)[1] Kapela 11q13.2 Start 67,461,710 bp[1] Konec 67,469,272 bp[1]
Ortology
Druh	Člověk	Myš
Entrez	80194	66990
Ensembl	ENSG00000172663	ENSMUSG00000024845
UniProt	Q9H6X4	Q8R0J4
RefSeq (mRNA)	NM_001078650 NM_001078651 NM_025124	NM_001078649 NM_025889
RefSeq (protein)	NP_001072118 NP_001072119 NP_079400	NP_001072117 NP_080165
Místo (UCSC)	Chr 11: 67,46 - 67,47 Mb	n / a
PubMed Vyhledávání	[2]	[3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka Zobrazit / upravit myš

Transmembránový protein 134 je protein kódovaný TMEM134 gen. TMEM134 nemá žádné další známé aliasy. Existují dvě transmembránové domény a doména neznámé funkce (DUF872).^[4] Evoluční, většina organismů, které mají tento gen, jsou primáti a savci, i když existují některé organismy sahající až do Drosphila a C. elegans. Prostřednictvím současného výzkumu nebyla potvrzena žádná funkce TMEM134.

Genová struktura

Gen se skládá ze 6 exonů, které se rozprostírají od 67464348 do 67469277 kilobází. Nachází se na chromozomu 11q13.2, který je mínusovým vláknem chromozomu. Gen má tři izoformy; a, bac.

Protein

Struktura bílkovin

Protein je kódován genem TMEM134 a je dlouhý 195 aminokyselin. Protein obsahuje dvě transmembránové domény, ale neobsahuje signální peptid. To naznačuje, že před translační částí proteinu je vnitřní signální peptid. Protein vzhledem ke svému obsahu aminokyselin celkově považuje za normální, ale má dvě oblasti s vysokou hydrofobicitou, které se vyskytují během transmembránových oblastí proteinu. To dává proteinu izoelektrický bod 6,08. Celková hmotnost proteinu je 21,6 kilodaltonů, která je zachována v různých ortologech. Protein také obsahuje doménu neznámé funkce 872 (DUF872). V současné době není uvažováno o možné funkci této domény.

Toto je proteinový konstrukt TMEM134 obsahující dvě transmembránové domény a DUF872.

Regulace a překlady

TMEM134 je regulován promotorem GXP50275.^[5] V promotoru je 870 aminokyselin a jeho 15 transkriptových variant. U savců je promotor dobře konzervován. V promotoru jsou některé konzervované vazebné oblasti, včetně EGR / nervového faktoru a regulační oblasti genu Huntingtonovy choroby.

Umístění

Předpokládá se, že konečný protein je v endoplazmatickém retikulu a jaderné membráně.^[6] Protein je ukotven ve dvou různých oblastech, od 123-145 a 155-177. Část proteinu, která sahá do cytosolu, je silně fosforylována. Tato fosforylační místa jsou konzervována do kostnatých ryb.

Posttranslační úprava

Jediný posttranslační modifikace dochází k fosforylaci. Neexistují žádná místa glykosylace, sulfinace nebo sumoylace.

Interakce

TMEM134 má jednu interakci s jiným proteinem, ELAVL1. Tento protein se váže na prvky bohaté na AU v mRNA FOS a IL3 / interleukin-3.^[7]

Výraz

Byla provedena mikročipová analýza profilů GEO a ukázalo se, že TMEM134 je všudypřítomně exprimován ve většině lidských tkání.^[8] I když je v lidských tkáních všudypřítomná exprese, existují i ​​jiné tkáně, které mají vyšší hladiny exprese, například srdce, tkáň prsu a tkáň prostaty.

Homologie

Jak již bylo zmíněno dříve, u primátů a savců existuje značná ochrana, ale existují určité vzdálené ortology zebrafish a Drosphilaa homolog z C. elegans.

Reference