Prvek odezvy na trans-aktivaci (TAR) - Trans-activation response element (TAR)

Prvek odezvy na trans-aktivaci (TAR)
RF00250.jpg
Identifikátory
Symbolmir-TAR
Alt. SymbolyDEHET
RfamRF00250
Další údaje
RNA typGen; miRNA
DoményViry
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000233 SO: 0001244
PDB strukturPDBe

The HIV prvek trans-aktivační odezvy (TAR) je RNA element o kterém je známo, že je vyžadován pro transaktivaci viru promotér a pro replikaci virů. TAR sponka do vlasů je dynamická struktura[1] který funguje jako závazné místo pro Tat protein a tato interakce stimuluje aktivitu dlouhé opakování terminálu promotér.[2]

Další analýza ukázala, že TAR je a pre-mikroRNA který produkuje zralé mikroRNA z obou řetězců kmenové smyčky TAR.[3]Předpokládá se, že tyto miRNA zabraňují podrobení infikovaných buněk apoptóza podle downregulační geny ERCC1, IER3,[4] CDK9, a Bim.[5]

Reference

  1. ^ Lu, Jia; Kadakkuzha, Beena M .; Zhao, Liang; et al. (2011). „Dynamic Ensemble View of the Conformational Landscape of HIV-1 TAR RNA and Allosteric Recognition“. Biochemie. 50 (22): 5042–5057. doi:10.1021 / bi200495d. PMID  21553929.
  2. ^ Kulinski, T; Olejniczak M; Huthoff H; Bielecki L; Pachulska-Wieczorek K; Das AT; Berkhout B; Adamiak RW (2003). „Apikální smyčka vlásenky HIV-1 TAR RNA je stabilizována párem bází mezi smyčkami“. J Biol Chem. 278 (40): 38892–38901. doi:10,1074 / jbc.M301939200. PMID  12882959.
  3. ^ Ouellet DL, Plante I, Landry P a kol. (Duben 2008). "Identifikace funkčních mikroRNA uvolněných asymetrickým zpracováním prvku HIV-1 TAR". Nucleic Acids Res. 36 (7): 2353–2365. doi:10.1093 / nar / gkn076. PMC  2367715. PMID  18299284.
  4. ^ Klase Z, Winograd R, Davis J a kol. (2009). „HIV-1 TAR miRNA chrání před apoptózou změnou buněčné genové exprese“. Retrovirologie. 6: 18. doi:10.1186/1742-4690-6-18. PMC  2654423. PMID  19220914.
  5. ^ Narayanan, A; Iordanskiy, S; Das, R; Van Duyne, R; Santos, S; Jaworski, E; Guendel, I; Sampey, G; Dalby, E; Iglesias-Ussel, M; Popratiloff, A; Hakami, R; Kehn-Hall, K; Young, M; Subra, C; Gilbert, C; Bailey, C; Romerio, F; Kashanchi, F (5. července 2013). „Exozomy odvozené z buněk infikovaných HIV-1 obsahují prvek RNA aktivační odpovědi“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (27): 20014–20033. doi:10,1074 / jbc.m112.438895. PMC  3707700. PMID  23661700.

externí odkazy