Thymidinkináza 1 - Thymidine kinase 1

TK1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1W4R, 1XBT, 2ORV, 2WVJ
Identifikátory
Aliasy	TK1, TK2, thymidinkináza 1
Externí ID	OMIM: 188300 MGI: 98763 HomoloGene: 37749 Genové karty: TK1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	78,187,233 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	117,826,092 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita nukleosid kinázy; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • ATP vazba; • thymidinkináza; • aktivita thymidinkinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• Proces biosyntézy DNA; • fosforylace; • pyrimidinová nukleosidová záchrana; • metabolický proces složený z nukleobáze; • homotetramerizace bílkovin; • proces biosyntézy deoxyribonukleosidmonofosfátu; • Proces metabolismu DNA; • proces biosyntézy nukleotidů; • metabolický proces thymidinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7083
	21877
	ENSG00000167900
	ENSMUSG00000025574
	P04183
	P04184
	NM_003258; NM_001346663; NM_001363848
	NM_001271729; NM_009387
	NP_001333592; NP_003249; NP_001350777
	NP_001258658; NP_033413
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Thymidinkináza 1, rozpustná (název genu TK1), je člověk thymidinkináza.^[5]

Ve zvířecích buňkách byly identifikovány dvě formy tohoto proteinu, jedna v cytosolu a jedna v mitochondrie. Aktivita cytosolického enzymu je vysoká v proliferujících buňkách a vrcholí během S-fáze z buněčný cyklus; v klidových buňkách je velmi nízký.

Interakce

Ukázalo se, že thymidinkináza 1 komunikovat s P21.^[6]

Interaktivní mapa cest

Kliknutím na geny, proteiny a metabolity níže můžete odkazovat na příslušné články.^{[§ 1]}

[[Soubor:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{{bSize}}} px | alt = Aktivita fluorouracilu (5-FU) Upravit ]]

Aktivita fluorouracilu (5-FU) Upravit

^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „FluoropyrimidinActivity_WP1601“.

Thymidinkináza 1 u rakoviny

Thymidinkináza má v komunitě pro výzkum rakoviny stále větší vliv. Bylo zjištěno, že zvýšené hladiny TK-1 v krevním séru jsou spojeny s přítomností mnoha typů malignit, dále bylo zjištěno, že TK-1 je zvýšený v séru ještě předtím, než se objeví klinické příznaky.^[7] To nabízí potenciál pro dřívější terapii. Bylo zjištěno, že zvýšení sérového TK-1 koreluje s návratem prsu a jinými formami rakoviny^[8] TK-1 lze použít k detekci rakoviny dříve, k určení, v jaké fázi se nachází, a k detekci recidivy. Thymidinkinázu 1 lze měřit na základě její enzymové aktivity^[9] nebo pomocí imunotestu.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167900 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025574 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: Thymidinkináza 1, rozpustný".
^ Huang DY, Chang ZF (červen 2001). "Interakce lidské thymidinkinázy 1 s p21 (Waf1)". Biochem. J. 356 (Pt 3): 829–34. doi:10.1042/0264-6021:3560829. PMC 1221910. PMID 11389691.
^ Alegre MM, Robison RA, O'Neill KL (květen 2013). „Thymidinkináza 1: Univerzální marker pro rakovinu“. Rakovina a klinická onkologie. 2 (1). doi:10,5539 / cco.v2n1p159.
^ Alegre MM, Robison RA, O'Neill KL (2012). „Regulace tymidinkinázy 1 je časná událost při tvorbě nádoru prsu“. Journal of Oncology. 2012: 575647. doi:10.1155/2012/575647. PMC 3388419. PMID 22778736.
^ Munch-Petersen B (2005). „Rozdíly v kinetických vlastnostech izoenzymů thymidinkinázy v nestimulovaných a fytohemaglutininem stimulovaných lidských lymfocytech“. Mol. Buňka. Biochem. 64 (2): 1013–19. doi:10.1007 / BF00224774. PMID 6504022. S2CID 11326439.
^ He Q, Zhang P, Zou L a kol. (2005). „Koncentrace thymidinkinázy 1 v séru (S-TK1) je citlivějším markerem proliferace v lidských pevných nádorech než jeho aktivita“. Oncol. Rep. 14 (4): 1013–19. PMID 16142366.

Další čtení

Kim YK, Lee AS (1992). "Identifikace vazebného místa pro protein v promotoru genu pro lidskou thymidinkinázu požadovaného pro transkripci regulovanou G1-S". J. Biol. Chem. 267 (4): 2723–7. PMID 1370831.
Barik S, Banerjee AK (1991). „Klonování a exprese genu fosfoproteinu viru vezikulární stomatitidy v Escherichia coli: analýza stavu fosforylace versus transkripční aktivita“. J. Virol. 65 (4): 1719–26. doi:10.1128 / JVI.65.4.1719-1726.1991. PMC 239976. PMID 1848304.
Sadava D, Bernard B (1990). "Přechod z cytosolické na mitochondriální thymidinkinázu během vývoje v lidských fetálních tkáních". Life Sci. 47 (25): 2359–64. doi:10.1016 / 0024-3205 (90) 90275-V. PMID 2263164.
Tamiya N, Yusa T, Yamaguchi Y, Tsukifuji R, Kuroiwa N, Moriyama Y, Fujimura S (1989). "Společné čištění thymidylátkinázy a cytosolické thymidinkinázy z lidského termínu placenta afinitní chromatografií". Biochim. Biophys. Acta. 995 (1): 28–35. doi:10.1016 / 0167-4838 (89) 90229-X. PMID 2538159.
Slagel V, Flemington E, Traina-Dorge V, Bradshaw H, Deininger P (1987). "Shlukování a podčeledské vztahy rodiny Alu v lidském genomu". Mol. Biol. Evol. 4 (1): 19–29. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040422. PMID 3128713.
Flemington E, Bradshaw HD, Traina-Dorge V, Slagel V, Deininger PL (1987). "Sekvence, struktura a charakterizace promotoru genu pro lidskou thymidinkinázu". Gen. 52 (2–3): 267–77. doi:10.1016/0378-1119(87)90053-9. PMID 3301530.
Sherley JL, Kelly TJ (1988). "Lidská cytosolická thymidinkináza. Čištění a fyzikální charakterizace enzymu z buněk HeLa". J. Biol. Chem. 263 (1): 375–82. PMID 3335503.
Kreidberg JA, Kelly TJ (1986). "Genetická analýza promotoru genu lidské thymidinkinázy". Mol. Buňka. Biol. 6 (8): 2903–9. doi:10,1128 / mcb. 6.8.2903. PMC 367858. PMID 3785218.
Bradshaw HD, Deininger PL (1984). „Gen lidské thymidinkinázy: molekulární klonování a nukleotidová sekvence cDNA exprimovatelná v savčích buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 4 (11): 2316–20. doi:10.1128 / mcb.4.11.2316. PMC 369060. PMID 6549046.
Kuo WL, Hirschhorn R, Huie ML, Hirschhorn K (1996). "Lokalizace a uspořádání kyselé alfa-glukosidázy (GAA) a thymidinkinázy (TK1) pomocí fluorescenční hybridizace in situ". Hučení. Genet. 97 (3): 404–6. doi:10.1007 / BF02185782. PMID 8786092. S2CID 9056186.
Chang ZF, Huang DY, Chi LM (1998). „Serin 13 je místem mitotické fosforylace lidské thymidinkinázy“. J. Biol. Chem. 273 (20): 12095–100. doi:10.1074 / jbc.273.20.12095. PMID 9575153.
Berenstein D, Christensen JF, Kristensen T, Hofbauer R, Munch-Petersen B (2000). „Valin, nikoli methionin, je aminokyselina 106 v lidské cytosolické thymidinkináze (TK1). Dopad na oligomerizaci, stabilitu a kinetické vlastnosti“. J. Biol. Chem. 275 (41): 32187–92. doi:10,1074 / jbc.M005325200. PMID 10924519.
Huang DY, Chang ZF (2001). "Interakce lidské thymidinkinázy 1 s p21 (Waf1)". Biochem. J. 356 (Pt 3): 829–34. doi:10.1042/0264-6021:3560829. PMC 1221910. PMID 11389691.
Fujiwaki R, Hata K, Moriyama M, Iwanari O, Katabuchi H, Okamura H, Miyazaki K (2001). "Klinická hodnota thymidinkinázy u pacientů s karcinomem děložního čípku". Onkologie. 61 (1): 47–54. doi:10.1159/000055352. PMID 11474248. S2CID 9006108.
Fujiwaki R, Hata K, Nakayama K, Moriyama M, Iwanari O, Katabuchi H, Okamura H, Sakai E, Miyazaki K (2002). „Thymidinkináza u epiteliálního karcinomu vaječníků: vztah k dalším enzymům pyrimidinové dráhy“. Int. J. Cancer. 99 (3): 328–35. doi:10.1002 / ijc.10319. PMID 11992400. S2CID 23856606.
Mao Y, Wu J, Wang N, He L, Wu C, He Q, Skog S (2002). „Srovnávací studie: imunohistochemická detekce cytosolické thymidinkinázy a nukleárního antigenu proliferujících buněk u rakoviny prsu“. Cancer Invest. 20 (7–8): 922–31. doi:10.1081 / CNV-120005905. PMID 12449723. S2CID 23072666.
Gilles SI, Romain S, Casellas P, Ouafik L, Fina F, Combes T, Vuaroquaux V, Seitz JF, Bonnier P, Galiègue S, Carayon P, Martin PM (2003). "Mutační analýza v kódující sekvenci thymidinkinázy 1 u rakoviny prsu a kolorektálního karcinomu". Int. J. Biol. markery. 18 (1): 1–6. doi:10.5301 / jbm.2008.2452. PMID 12699056.
Han T, Fernandez M, Sarkar M, Agarwal RP (2004). „2 ', 3'-Dideoxycytidin potlačuje expresi thymidinkináz 1 a 2 v T-lymfoidních buňkách“. Life Sci. 74 (7): 835–42. doi:10.1016 / j.lfs.2003.07.023. PMID 14659972.
Li CL, Lu CY, Ke PY, Chang ZF (2004). „Porucha ATP-indukované tetramerizace lidské cytosolické thymidinkinázy substitucí serinu-13 kyselinou asparagovou v místě mitotické fosforylace“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313 (3): 587–93. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.11.147. PMID 14697231.
ONeill KL, Buckwalter M, Murray BK (2001). "Thymidinkináza: diagnostický a prognostický potenciál". Expert Rev. Mol. Diagn. 1 (4): 428–33. doi:10.1586/14737159.1.4.428. PMID 11901857. S2CID 12790327.
Topolcan O, Holubec Jr L (2008). "Úloha thymidinkinázy při rakovinových onemocněních". Znalecký posudek. Med. Diagn. 2 (2): 129–41. doi:10.1517/17530059.2.2.129. PMID 23485133.
Jagarlamudi KK, Shaw M (2018). „Thymidinkináza 1 jako biomarker tumoru: Technické pokroky nabízejí nový potenciál pro starý biomarker“. Biomark. Med. 12 (9): 1035–48. doi:10,2217 / bmm-2018-0157. PMID 30039979.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[WikiPathways-7] Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „FluoropyrimidinActivity_WP1601“.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167900 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025574 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] "Entrez Gene: Thymidinkináza 1, rozpustný".

[pmid11389691-6] Huang DY, Chang ZF (červen 2001). "Interakce lidské thymidinkinázy 1 s p21 (Waf1)". Biochem. J. 356 (Pt 3): 829–34. doi:10.1042/0264-6021:3560829. PMC 1221910. PMID 11389691.

[8] Alegre MM, Robison RA, O'Neill KL (květen 2013). „Thymidinkináza 1: Univerzální marker pro rakovinu“. Rakovina a klinická onkologie. 2 (1). doi:10,5539 / cco.v2n1p159.

[pmid22778736-9] Alegre MM, Robison RA, O'Neill KL (2012). „Regulace tymidinkinázy 1 je časná událost při tvorbě nádoru prsu“. Journal of Oncology. 2012: 575647. doi:10.1155/2012/575647. PMC 3388419. PMID 22778736.

[Munch-Petersen_2005-10] Munch-Petersen B (2005). „Rozdíly v kinetických vlastnostech izoenzymů thymidinkinázy v nestimulovaných a fytohemaglutininem stimulovaných lidských lymfocytech“. Mol. Buňka. Biochem. 64 (2): 1013–19. doi:10.1007 / BF00224774. PMID 6504022. S2CID 11326439.

[He_2005-11] He Q, Zhang P, Zou L a kol. (2005). „Koncentrace thymidinkinázy 1 v séru (S-TK1) je citlivějším markerem proliferace v lidských pevných nádorech než jeho aktivita“. Oncol. Rep. 14 (4): 1013–19. PMID 16142366.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[§ 1]

[7]

[8]

[9]

[10]