TRIP6 - TRIP6 - Wikipedia

TRIP6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X61, 2DLO
Identifikátory
Aliasy	TRIP6, OIP-1, OIP1, TRIP-6, TRIP6i2, ZRP-1, interakce receptoru hormonu štítné žlázy 6
Externí ID	OMIM: 602933 MGI: 1343458 HomoloGene: 37757 Genové karty: TRIP6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	100,873,454 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na interleukin-1 receptor; • vazba kovových iontů; • vazba na receptory hormonů štítné žlázy; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné spojení; • buněčná membrána; • komplex receptoru interleukinu-1; • cytoskelet; • buněčné jádro; • ohnisková adheze; • cytoplazma; • cytosol; • stresové vlákno;
Biologický proces	• sestava ohniskové adheze; • buněčná adheze; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace buněčné migrace; • pozitivní regulace signalizace NIK / NF-kappaB; • signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7205
	22051
	ENSG00000087077
	ENSMUSG00000023348
	Q15654
	Q9Z1Y4
	NM_003302
	NM_011639
	NP_003293
	NP_035769
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein interagující s receptory štítné žlázy 6 je protein že u lidí je kódován TRIP6 gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je členem rodiny zyxinů a kóduje protein se třemi doménami vázajícími zinek LIM. Tento protein se lokalizuje do ohniskových adhezních míst a podél aktinových stresových vláken. Nábor tohoto proteinu na plazmatickou membránu probíhá způsobem závislým na kyselině lysofosfatidové (LPA) a reguluje migraci buněk indukovanou LPA. Alternativně byly popsány sestřihané varianty, které kódují různé proteinové izoformy; ne všechny varianty však byly plně charakterizovány.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že TRIP6 komunikovat s LPAR2,^[7] BCAR1^[7]^[8] a HOXA9.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000087077 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yi J, Beckerle MC (duben 1998). „Lidský gen TRIP6 kóduje protein domény LIM a mapuje se na chromozom 7q22, oblast spojenou s tumorigenezí.“ Genomika. 49 (2): 314–6. doi:10.1006 / geno.1998.5248. PMID 9598321.
^ Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (únor 1995). "Dvě třídy proteinů závislé buď na přítomnosti nebo nepřítomnosti hormonu štítné žlázy pro interakci s receptorem hormonu štítné žlázy". Molekulární endokrinologie. 9 (2): 243–54. doi:10.1210 / me.9.2.243. PMID 7776974.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TRIP6 receptor pro hormon štítné žlázy 6".
^ ^A ^b Xu J, Lai YJ, Lin WC, Lin FT (březen 2004). „TRIP6 zvyšuje migraci buněk indukovanou kyselinou lysofosfatidovou interakcí s receptorem 2 kyseliny lysofosfatidové“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (11): 10459–68. doi:10,1074 / jbc.M311891200. PMC 3904432. PMID 14688263.
^ Yi J, Kloeker S, Jensen CC, Bockholt S, Honda H, Hirai H, Beckerle MC (březen 2002). „Členové rodiny proteinů LIM zyxinu interagují s členy rodiny signálních převodníků p130Cas“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 9580–9. doi:10,1074 / jbc.M106922200. PMID 11782456.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Další čtení

Williams JM, Chen GC, Zhu L, Rest RF (leden 1998). „Použití kvasinkového dvouhybridního systému k identifikaci proteinů lidských epiteliálních buněk, které vážou gonokokové proteiny Opa: intracelulární gonokoky váží pyruvátkinázu prostřednictvím svých proteinů Opa a pro růst vyžadují hostitelský pyruvát.“ Molekulární mikrobiologie. 27 (1): 171–86. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.00670.x. PMID 9466265. S2CID 36570024.
Murthy KK, Clark K, Fortin Y, Shen SH, Banville D (červenec 1999). „ZRP-1, protein související se zyxinem, interaguje s druhou doménou PDZ cytosolického proteinu tyrosin fosfatázy hPTP1E“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (29): 20679–87. doi:10.1074 / jbc.274.29.20679. PMID 10400701.
Zhao MK, Wang Y, Murphy K, Yi J, Beckerle MC, Gilmore TD (2000). „Protein trip6 obsahující LIM doménu může působit jako koaktivátor transkripčního faktoru v-Rel“. Genový výraz. 8 (4): 207–17. PMC 6157364. PMID 10794523.
Cuppen E, van Ham M, Wansink DG, de Leeuw A, Wieringa B, Hendriks W (duben 2000). „Protein TRIP6 související se zyxinem interaguje s motivy PDZ v adaptorovém proteinu RIL a proteinové tyrosin fosfatáze PTP-BL.“ European Journal of Cell Biology. 79 (4): 283–93. doi:10.1078 / S0171-9335 (04) 70031-X. PMID 10826496.
Wilson MD, Riemer C, Martindale DW, Schnupf P, Boright AP, Cheung TL, Hardy DM, Schwartz S, Scherer SW, Tsui LC, Miller W, Koop BF (březen 2001). „Srovnávací analýza genově husté oblasti ACHE / TFR2 na lidském chromozomu 7q22 s ortologní oblastí na myším chromozomu 5“. Výzkum nukleových kyselin. 29 (6): 1352–65. doi:10.1093 / nar / 29.6.1352. PMC 29746. PMID 11239002.
Wang Y, Gilmore TD (duben 2001). „Protein LIM6 domény Trip6 má konzervovaný jaderný exportní signál, nukleární cílené sekvence a několik transaktivačních domén“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1538 (2–3): 260–72. doi:10.1016 / S0167-4889 (01) 00077-5. PMID 11336797.
Yi J, Kloeker S, Jensen CC, Bockholt S, Honda H, Hirai H, Beckerle MC (březen 2002). „Členové rodiny proteinů LIM zyxinu interagují s členy rodiny signálních převodníků p130Cas“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 9580–9. doi:10,1074 / jbc.M106922200. PMID 11782456.
Zarsky HA, Tarnasky HA, Cheng M, van der Hoorn FA (únor 2003). "Nový prstenový prstenový prsten OIP1 se váže na konzervované aminokyselinové repetice v spermatickém ocasním proteinu ODF1". Biologie reprodukce. 68 (2): 543–52. doi:10.1095 / biolreprod.102.009076. PMC 3158802. PMID 12533418.
Xu J, Lai YJ, Lin WC, Lin FT (březen 2004). „TRIP6 zvyšuje migraci buněk indukovanou kyselinou lysofosfatidovou interakcí s receptorem 2 kyseliny lysofosfatidové“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (11): 10459–68. doi:10,1074 / jbc.M311891200. PMC 3904432. PMID 14688263.
Sanz-Rodriguez F, Guerrero-Esteo M, Botella LM, Banville D, Vary CP, Bernabéu C (červenec 2004). „Endoglin reguluje cytoskeletální organizaci prostřednictvím vazby na ZRP-1, člena rodiny proteinů Lim“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (31): 32858–68. doi:10,1074 / jbc.M400843200. PMID 15148318.
Kassel O, Schneider S, Heilbock C, Litfin M, Göttlicher M, Herrlich P (říjen 2004). „Jaderná izoforma proteinu fokální adheze LIM-domény Trip6 integruje aktivační a represivní signály na promotorech regulovaných AP-1- a NF-kappaB“. Geny a vývoj. 18 (20): 2518–28. doi:10,1101 / gad.322404. PMC 529539. PMID 15489293.
Li L, Bin LH, Li F, Liu Y, Chen D, Zhai Z, Shu HB (únor 2005). „TRIP6 je společná signalizační složka sdružená s RIP2 více aktivačních drah NF-kappaB“ (PDF). Journal of Cell Science. 118 (Pt 3): 555–63. doi:10.1242 / jcs.01641. PMID 15657077. S2CID 21632160.
Petit MM, Crombez KR, Vervenne HB, Weyns N, Van de Ven WJ (září 2005). „Nádorový supresor Scrib selektivně interaguje se specifickými členy rodiny proteinů zyxinu“. FEBS Dopisy. 579 (22): 5061–8. doi:10.1016 / j.febslet.2005.08.012. PMID 16137684. S2CID 43629118.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q15654 (Protein 6 ovlivňující receptor štítné žlázy) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000087077 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9598321-4] Yi J, Beckerle MC (duben 1998). „Lidský gen TRIP6 kóduje protein domény LIM a mapuje se na chromozom 7q22, oblast spojenou s tumorigenezí.“ Genomika. 49 (2): 314–6. doi:10.1006 / geno.1998.5248. PMID 9598321.

[pmid7776974-5] Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (únor 1995). "Dvě třídy proteinů závislé buď na přítomnosti nebo nepřítomnosti hormonu štítné žlázy pro interakci s receptorem hormonu štítné žlázy". Molekulární endokrinologie. 9 (2): 243–54. doi:10.1210 / me.9.2.243. PMID 7776974.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: TRIP6 receptor pro hormon štítné žlázy 6".

[pmid14688263-7] A ^b Xu J, Lai YJ, Lin WC, Lin FT (březen 2004). „TRIP6 zvyšuje migraci buněk indukovanou kyselinou lysofosfatidovou interakcí s receptorem 2 kyseliny lysofosfatidové“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (11): 10459–68. doi:10,1074 / jbc.M311891200. PMC 3904432. PMID 14688263.

[pmid11782456-8] Yi J, Kloeker S, Jensen CC, Bockholt S, Honda H, Hirai H, Beckerle MC (březen 2002). „Členové rodiny proteinů LIM zyxinu interagují s členy rodiny signálních převodníků p130Cas“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 9580–9. doi:10,1074 / jbc.M106922200. PMID 11782456.

[pmid16189514-9] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]