TRIP10 - TRIP10

TRIP10

Protein TRIP10 PDB 2ct4.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2CT4, 2EFK, 2KE4

Identifikátory

TRIP10, CIP4, HSTP, STOT, STP, TRIP-10, interakce receptoru hormonu štítné žlázy 10

Externí ID

OMIM: 604504 MGI: 2146901 HomoloGene: 99728 Genové karty: TRIP10

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 19 (lidský)^[1]

Kapela	19p13.3	Start	6,737,925 bp^[1]
Kapela	19p13.3	Konec	6,751,530 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 17 (myš)^[2]

Kapela	17 \| 17 D	Start	57,249,455 bp^[2]
Kapela	17 \| 17 D	Konec	57,263,665 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • identická vazba na protein • vazba lipidů • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy
Buněčná složka	• cytoplazma • cytosol • Golgiho aparát • buněčná projekce • intracelulární membránou vázaná organela • membrána • buněčná membrána • nukleoplazma • buněčná kůra • perinukleární oblast cytoplazmy • lysozom • fagocytární pohár • cytoskelet • extracelulární exosom
Biologický proces	• endocytóza • buněčná komunikace • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou • signální transdukce • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy • organizace aktinového cytoskeletu • membránová organizace
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


9322


106628


ENSG00000125733


ENSMUSG00000019487


Q15642


Q8CJ53

RefSeq (mRNA)


NM_001288962 NM_001288963 NM_004240


NM_001242389 NM_001242390 NM_001242391 NM_134125

RefSeq (protein)


NP_001275891 NP_001275892 NP_004231


NP_001229318 NP_001229319 NP_001229320 NP_598886

Místo (UCSC)

Chr 19: 6,74 - 6,75 Mb

Chr 17: 57,25 - 57,26 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Cdc42 interagující protein 4 je protein že u lidí je kódován TRIP10 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že TRIP10 komunikovat s STAT3,^[9] Protein Wiskott-Aldrichova syndromu,^[10] Huntingtin,^[11] CDC42,^[6]^[10] AKAP9^[12] a RHOQ.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125733 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019487 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (červenec 1995). "Dvě třídy proteinů závislé buď na přítomnosti nebo nepřítomnosti hormonu štítné žlázy pro interakci s receptorem hormonu štítné žlázy". Mol Endocrinol. 9 (2): 243–54. doi:10.1210 / me.9.2.243. PMID 7776974.
^ ^A ^b Aspenstrom P (srpen 1997). „Cílový protein Cdc42 s homologií s nekinázovou doménou FER má potenciální roli při regulaci aktinového cytoskeletu.“ Curr Biol. 7 (7): 479–87. doi:10.1016 / S0960-9822 (06) 00219-3. PMID 9210375. S2CID 14268690.
^ Tsuji E, Tsuji Y (duben 2001). "Molekulární klonování a chromozomální lokalizace proteinu tolerantního vůči lidské soli". Genetica. 108 (3): 259–62. doi:10.1023 / A: 1004132919896. PMID 11294612. S2CID 22725257.
^ "Entrez Gene: TRIP10 interakce receptoru hormonu štítné žlázy 10".
^ Chung, Young-Hwa; Cho Nam-hyuk; Garcia Maria Ines; Lee Sun-Hwa; Feng Pinghui; Jung Jae U (červen 2004). "Aktivace transkripčního faktoru Stat3 pomocí onkoproteinu Herpesvirus saimiri STP-A". J. Virol. Spojené státy. 78 (12): 6489–97. doi:10.1128 / JVI.78.12.6489-6497.2004. ISSN 0022-538X. PMC 416526. PMID 15163742.
^ ^A ^b Tian, L; Nelson DL; Stewart D M (březen 2000). „Cdc42 interagující protein 4 zprostředkovává vazbu proteinu Wiskott-Aldrichova syndromu na mikrotubuly“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 275 (11): 7854–61. doi:10.1074 / jbc.275.11.7854. ISSN 0021-9258. PMID 10713100.
^ Holbert, Sébastien; Dedeoglu Alpaslan; Humbert Sandrine; Saudou Frédéric; Ferrante Robert J; Néri Christian (březen 2003). „Cdc42 interagující protein 4 se váže na huntingtin: neuropatologické a biologické důkazy o roli při Huntingtonově nemoci“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 100 (5): 2712–7. Bibcode:2003PNAS..100.2712H. doi:10.1073 / pnas.0437967100. ISSN 0027-8424. PMC 151406. PMID 12604778.
^ Larocca, M Cecilia; Shanks Ryan A; Tian Lan; Nelson David L; Stewart Donn M; Goldenring James R (červen 2004). „AKAP350 interakce s cdc42 interagujícím proteinem 4 na Golgiho aparátu“. Mol. Biol. Buňka. Spojené státy. 15 (6): 2771–81. doi:10,1091 / mbc.E03-10-0757. ISSN 1059-1524. PMC 420101. PMID 15047863.
^ Chang, Louise; Adams Rachael D; Saltiel Alan R (říjen 2002). „Protein CIP4 / 2 interagující s TC10 je nutný pro translokaci glut4 stimulovanou inzulínem v adipocytech 3T3L1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 99 (20): 12835–40. Bibcode:2002PNAS ... 9912835C. doi:10.1073 / pnas.202495599. ISSN 0027-8424. PMC 130546. PMID 12242347.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Tian L, Nelson DL, Stewart DM (2000). „Cdc42 interagující protein 4 zprostředkovává vazbu proteinu Wiskott-Aldrichova syndromu na mikrotubuly“. J. Biol. Chem. 275 (11): 7854–61. doi:10.1074 / jbc.275.11.7854. PMID 10713100.
Linder S, Hüfner K, Wintergerst U, Aepfelbacher M (2001). "Tvorba podosomálních adhezivních struktur v primárních lidských makrofágech závislá na mikrotubulech". J. Cell Sci. 113 Pt 23: 4165–76. PMID 11069762.
Richnau N, Aspenström P (2001). „Bohatý, protein obsahující doménu RTP aktivující proteinovou doménu zapojený do signalizace pomocí Cdc42 a Rac1“. J. Biol. Chem. 276 (37): 35060–70. doi:10,1074 / jbc.M103540200. PMID 11431473.
Yuan R, Fan S, Achary M a kol. (2001). „Změněný vzor genové exprese v kultivovaných lidských buňkách rakoviny prsu ošetřených růstovým faktorem hepatocytů / faktorem rozptylu v prostředí poškození DNA“. Cancer Res. 61 (21): 8022–31. PMID 11691828.
Wang L, Rudert WA, Grishin A a kol. (2002). „Identifikace a genetická analýza lidských a myších aktivovaných izoforem proteinu-4 interagujících s Cdc42“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (5): 1426–30. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00398-4. PMID 12054674.
Chang L, Adams RD, Saltiel AR (2002). „Protein CIP4 / 2 interagující s TC10 je nutný pro translokaci glut4 stimulovanou inzulínem v adipocytech 3T3L1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (20): 12835–40. Bibcode:2002PNAS ... 9912835C. doi:10.1073 / pnas.202495599. PMC 130546. PMID 12242347.
Dombrosky-Ferlan P, Grishin A, Botelho RJ, et al. (2003). „Felic (CIP4b), nový vazebný partner s Src kinázou Lyn a Cdc42, se lokalizuje do fagocytárního kalichu“. Krev. 101 (7): 2804–9. doi:10.1182 / krev-2002-03-0851. PMID 12456510.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Holbert S, Dedeoglu A, Humbert S a kol. (2003). „Cdc42 interagující protein 4 se váže na huntingtin: neuropatologické a biologické důkazy o roli při Huntingtonově nemoci“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (5): 2712–7. Bibcode:2003PNAS..100.2712H. doi:10.1073 / pnas.0437967100. PMC 151406. PMID 12604778.
Katoh M, Katoh M (2004). „Gen FNBP2 na lidském chromozomu 1q32.1 kóduje protein rodiny ARHGAP s doménami FCH, FBH, RhoGAP a SH3“. Int. J. Mol. Med. 11 (6): 791–7. doi:10,3892 / ijmm.11.6.791. PMID 12736724.
Morin F, Vannier B, Houdart F a kol. (2003). „Doména bohatá na prolin v gama podjednotce fosfodiesterázy 6 zprostředkovává interakci s proteiny obsahujícími SH3“. Mol. Vis. 9: 449–59. PMID 14502124.
Larocca MC, Shanks RA, Tian L a kol. (2004). „AKAP350 interakce s cdc42 interagujícím proteinem 4 na Golgiho aparátu“. Mol. Biol. Buňka. 15 (6): 2771–81. doi:10,1091 / mbc.E03-10-0757. PMC 420101. PMID 15047863.
Chung YH, Cho NH, Garcia MI a kol. (2004). "Aktivace transkripčního faktoru Stat3 pomocí onkoproteinu Herpesvirus saimiri STP-A". J. Virol. 78 (12): 6489–97. doi:10.1128 / JVI.78.12.6489-6497.2004. PMC 416526. PMID 15163742.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Yin X, Warner DR, Roberts EA a kol. (2005). "Identifikace nových proteinů interagujících s CBP v embryonální orofaciální tkáni". Biochem. Biophys. Res. Commun. 329 (3): 1010–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.02.075. PMID 15752756.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.