GMEB1 - GMEB1

GMEB1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1OQJ
Identifikátory
Aliasy	GMEB1, P96PIF, PIF96, glukokortikoidový modulační prvek vázající protein 1
Externí ID	OMIM: 604409 MGI: 2135604 HomoloGene: 10647 Genové karty: GMEB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	28,719,353 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	132,261,602 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba kovových iontů; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10691
	56809
	ENSG00000162419
	ENSMUSG00000028901
	Q9Y692
	Q9JL60
	NM_006582; NM_024482; NM_001319674
	NM_001122992; NM_020273
	NP_001306603; NP_006573; NP_077808
	NP_001116464; NP_064669
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Glukokortikoidový modulační prvek vázající protein 1 je protein že u lidí je kódován GMEB1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen je členem rodiny genů KDWK. Produkt tohoto genu se asociuje s proteinem GMEB2 a komplex je nezbytný pro replikaci parvovirové DNA. Studie krysího homologu implikuje roli tohoto genu v modulaci transaktivace glukokortikoidovým receptorem navázaným na glukokortikoidové reakční prvky. Existují dvě alternativní sestřihové varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

GMEB1 bylo prokázáno komunikovat s TRIM63.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162419 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028901 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Thériault JR, Charette SJ, Lambert H, Landry J (červenec 1999). "Klonování a charakterizace hGMEB1, nového glukokortikoidového modulárního prvku vázajícího protein". FEBS Lett. 452 (3): 170–176. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00634-1. PMID 10386584.
^ Christensen J, Cotmore SF, Tattersall P (listopad 1999). „Dva noví členové nově vznikající rodiny KDWK kombinatorických transkripčních modulátorů se váží jako heterodimer na flexibilně rozmístěné poloviční weby PuCGPy“. Mol Cell Biol. 19 (11): 7741–50. doi:10.1128 / MCB.19.11.7741. PMC 84824. PMID 10523663.
^ ^A ^b „Entrez Gene: GMEB1 glukokortikoidový modulační prvek vázající protein 1“.
^ McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (2002). „Svalově specifický prsten RING-1 interaguje s titinem, aby reguloval sarkomickou M-linii a strukturu tlustého vlákna a může mít jaderné funkce prostřednictvím své interakce s glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím protein-1“. J Cell Biol. 157 (1): 125–136. doi:10.1083 / jcb.20010808989. PMC 2173255. PMID 11927605.

Další čtení

Jimenez-Lara AM, Heine MJ, Gronemeyer H (2000). „Klonování myšího proteinu vázajícího modulační glukokortikoidový prvek, nový člen rodiny KDWK“. FEBS Lett. 468 (2–3): 203–210. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01209-6. PMID 10692587.
Zeng H, Kaul S, Simons SS (2000). „Genomická organizace lidského GMEB-1 a GMEB-2 potkana: strukturální ochrana dvou multifunkčních proteinů“. Nucleic Acids Res. 28 (8): 1819–1829. doi:10.1093 / nar / 28.8.1819. PMC 102812. PMID 10734202.
Kaul S, Blackford JA, Chen J, Ogryzko VV, Simons SS (2000). "Vlastnosti glukokortikoidových modulačních prvků vázajících proteiny GMEB-1 a -2: potenciální nové modifikátory transaktivace glukokortikoidových receptorů a členové rodiny proteinů KDWK". Mol. Endokrinol. 14 (7): 1010–1027. doi:10.1210 / me.14.7.1010. PMID 10894151.
Burnett E, Christensen J, Tattersall P (2002). „Konsenzuální motiv rozpoznávání DNA pro dva transkripční faktory KDWK identifikuje příbuzná vazebná místa citlivá na flexibilní délku CpG-methylace u většiny lidských promotorů“. J. Mol. Biol. 314 (5): 1029–1039. doi:10,1006 / jmbi.2000.5198. PMID 11743720.
Kaul S, Blackford JA, Cho S, Simons SS (2002). „Ubc9 je nový modulátor indukčních vlastností glukokortikoidových receptorů“. J. Biol. Chem. 277 (15): 12541–12549. doi:10,1074 / jbc.M112330200. PMID 11812797.
Surdo PL, Bottomley MJ, Sattler M, Scheffzek K (2004). „Krystalová struktura a analýza nukleární magnetické rezonance SAND domény z glukokortikoidového modulačního prvku vázajícího protein-1 odhaluje oblasti vázající deoxyribonukleovou kyselinu a zinek“. Mol. Endokrinol. 17 (7): 1283–1295. doi:10.1210 / me.2002-0409. PMID 12702733.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–1332. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Tsuruma K, Nakagawa T, Shirakura H, Hayashi N, Uehara T, Nomura Y (2005). „Regulace prokaspázy-2 glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím proteinem 1 prostřednictvím interakce s doménou náboru kaspázy“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 325 (4): 1246–1251. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.10.145. PMID 15555560.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–1178. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Tsuruma K, Nakagawa T, Morimoto N, Minami M, Hara H, Uehara T, Nomura Y (2006). „Protein 1 vázající se na modulační prvek glukokortikoidů se váže na prokaspázy iniciátoru a inhibuje apoptózu vyvolanou ischemií a poškození neuronů“. J. Biol. Chem. 281 (16): 11397–11404. doi:10,1074 / jbc.M510597200. PMID 16497673.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–1292. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162419 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028901 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10386584-5] Thériault JR, Charette SJ, Lambert H, Landry J (červenec 1999). "Klonování a charakterizace hGMEB1, nového glukokortikoidového modulárního prvku vázajícího protein". FEBS Lett. 452 (3): 170–176. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00634-1. PMID 10386584.

[pmid10523663-6] Christensen J, Cotmore SF, Tattersall P (listopad 1999). „Dva noví členové nově vznikající rodiny KDWK kombinatorických transkripčních modulátorů se váží jako heterodimer na flexibilně rozmístěné poloviční weby PuCGPy“. Mol Cell Biol. 19 (11): 7741–50. doi:10.1128 / MCB.19.11.7741. PMC 84824. PMID 10523663.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: GMEB1 glukokortikoidový modulační prvek vázající protein 1“.

[pmid11927605-8] McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (2002). „Svalově specifický prsten RING-1 interaguje s titinem, aby reguloval sarkomickou M-linii a strukturu tlustého vlákna a může mít jaderné funkce prostřednictvím své interakce s glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím protein-1“. J Cell Biol. 157 (1): 125–136. doi:10.1083 / jcb.20010808989. PMC 2173255. PMID 11927605.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]