TREX2 - TREX2

TREX2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1Y97
Identifikátory
Aliasy	TREX2exonukleáza se třemi primární opravy 2
Externí ID	OMIM: 300370 MGI: 1346343 HomoloGene: 8046 Genové karty: TREX2
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	153,470,587 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	73,435,344 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita nukleázy; • aktivita exodeoxyribonukleázy III; • aktivita exonukleázy; • aktivita hydrolázy; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba iontů hořčíku; • Aktivita 3'-5'-exodeoxyribonukleázy; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • Aktivita 3'-5 'exonukleázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• Oprava DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • Proces metabolismu DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11219
	24102
	ENSG00000183479
	ENSMUSG00000031372
	Q9BQ50
	Q9R1A9
	NM_080701; NM_080699; NM_080700
	NM_011907
	NP_542432
	NP_036037
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exonukleáza se třemi hlavními opravami 2 je enzym že u lidí je kódován TREX2 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje protein s 3 'exonukleáza aktivita. Enzymy s touto aktivitou jsou zapojeny do replikace DNA, oprava a rekombinace. Podobnost s E-coli protein naznačuje, že tento enzym může být podjednotkou DNA polymeráza III, který nemá vlastní aktivitu exonukleázy.^[6]

Mutace v tomto genu mohou vést k Aicardi-Goutieresův syndrom

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183479 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031372 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Mazur DJ, Perrino FW (srpen 1999). "Identifikace a exprese cDNA sekvencí TREX1 a TREX2 kódujících savčí 3 '-> 5' exonukleázy". J Biol Chem. 274 (28): 19655–60. doi:10.1074 / jbc.274.28.19655. PMID 10391904.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TREX2 three prime repair exonuclease 2“.

Další čtení

Shevelev IV, Hübscher U (2002). "3 '5' exonukleázy". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 3 (5): 364–76. doi:10.1038 / nrm804. PMID 11988770.
Esposito T, Ciccodicola A, Flagiello L a kol. (1997). "Expresní STS a transkripce lidského Xq28". Gen. 187 (2): 185–91. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00772-X. PMID 9099879.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Li T, Duan W, Yang H a kol. (2001). "Identifikace dvou proteinů, S14 a UIP1, které interagují s UCH37". FEBS Lett. 488 (3): 201–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02436-4. hdl:10536 / DRO / DU: 30009147. PMID 11163772.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Mazur DJ, Perrino FW (2001). "Struktura a exprese exonukleázových genů TREX1 a TREX2 3 '-> 5'". J. Biol. Chem. 276 (18): 14718–27. doi:10,1074 / jbc.M010051200. PMID 11278605.
Mazur DJ, Perrino FW (2001). "Vyříznutí 3 'konců exonukleázami Trex1 a TREX2 3' -> 5 '. Charakterizace rekombinantních proteinů". J. Biol. Chem. 276 (20): 17022–9. doi:10,1074 / jbc.M100623200. PMID 11279105.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Shevelev IV, Beliakova NV, Kravetskaia TP, Krutiakov VM (2003). "[Korekční role autonomních 3 '-> 5' exonukleáz v komplexech savčích multienzymových DNA polymeráz]". Mol. Biol. (Mosk.). 36 (6): 1055–61. PMID 12500544.
Shevelev IV, Ramadan K, Hübscher U (2004). „Exonukleáza TREX2 3 '-> 5' fyzicky interaguje s deltou DNA polymerázy a zvyšuje její přesnost“. ScientificWorldJournal. 2: 275–81. doi:10.1100 / tsw.2002.99. PMC 6009725. PMID 12806015.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Perrino FW, Krol A, Harvey S a kol. (2005). "Varianty sekvence v 3 '-> 5' deoxyribonukleáze TREX2: identifikace v genetickém screeningu a účinky na katalýzu rekombinantními proteiny". Adv. Enzyme Regul. 44: 37–49. doi:10.1016 / j.advenzreg.2003.11.010. PMID 15581481.
Perrino FW, Harvey S, McMillin S, Hollis T (2005). „Struktura lidské TREX2 3 '-> 5'-exonukleázy naznačuje mechanismus pro efektivní neprocesivní katalýzu DNA“. J. Biol. Chem. 280 (15): 15212–8. doi:10,1074 / jbc.M500108200. PMID 15661738.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Hahn Y, Lee B (2007). „Humánně specifické nesmyslové mutace identifikované porovnáním sekvencí genomu“. Hučení. Genet. 119 (1–2): 169–78. doi:10.1007 / s00439-005-0125-6. PMID 16395595.
Chen MJ, Ma SM, Dumitrache LC, Hasty P (2007). "Biochemické a buněčné vlastnosti 3 '-> 5' exonukleázy TREX2". Nucleic Acids Res. 35 (8): 2682–94. doi:10.1093 / nar / gkm151. PMC 1885668. PMID 17426129.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9BQ50 (Exonukleáza 2 lidské hlavní opravy 2) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9R1A9 (Exonukleáza 2 se třemi hlavními opravami) na PDBe-KB.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183479 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031372 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10391904-5] Mazur DJ, Perrino FW (srpen 1999). "Identifikace a exprese cDNA sekvencí TREX1 a TREX2 kódujících savčí 3 '-> 5' exonukleázy". J Biol Chem. 274 (28): 19655–60. doi:10.1074 / jbc.274.28.19655. PMID 10391904.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TREX2 three prime repair exonuclease 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]