TREML1 - TREML1

TREML1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2FRG
Identifikátory
Aliasy	TREML1, GLTL1825, PRO3438, TLT-1, TLT1, dJ238O23.3, spouštěcí receptor exprimovaný na myeloidních buňkách jako 1
Externí ID	OMIM: 609714 MGI: 1918576 HomoloGene: 52257 Genové karty: TREML1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	41,154,337 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	48,367,176 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • buněčná membrána; • membrána; • povrch buňky; • destičkový alfa granulát;
Biologický proces	• vrozený imunitní systém; • vápníkem zprostředkovaná signalizace; • regulace imunitní odpovědi; • aktivace krevních destiček;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	340205
	71326
	ENSG00000161911
	ENSMUSG00000023993
	Q86YW5
	Q8K558
	NM_178174; NM_001271807; NM_001271808
	NM_001289451; NM_001289457; NM_027763
	NP_001258736; NP_001258737; NP_835468
	NP_001276380; NP_001276386; NP_082039
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trem podobný protein transkriptu 1 je protein že u lidí je kódován TREML1 gen.^[5]^[6]^[7]

TREML1 se nachází v genovém klastru chromozom 6 s receptory aktivujícími jednu variabilní Ig (IgV) doménu TREM1 (MIM 605085) a TREM2 (MIM 605086), ale má odlišné strukturální a funkční vlastnosti.

TREML1 zvyšuje signalizace vápníku v SHP2 (PTPN11; MIM 176876) - způsobem závislým (Allcock a kol., 2003; Barrow a kol., 2004). [Dodáváno společností OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161911 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023993 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Washington AV, Quigley L, McVicar DW (listopad 2002). „Počáteční charakterizace transkriptu podobného TREM (TLT) -1: domnělý inhibiční receptor v klastru TREM“. Krev. 100 (10): 3822–4. doi:10.1182 / krev-2002-02-0523. PMID 12393607.
^ Allcock RJ, Barrow AD, Forbes S, Beck S, Trowsdale J (březen 2003). „Klastr lidského genu TREM na 6p21.1 kóduje aktivační i inhibiční receptory jediné domény IgV a zahrnuje NKp44.“ Eur J Immunol. 33 (2): 567–77. doi:10.1002 / imu.200310033. PMID 12645956. S2CID 27147251.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TREML1 spouštěcí receptor exprimovaný na myeloidních buňkách jako 1".

Další čtení

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). "Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů". Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Washington AV, Schubert RL, Quigley L a kol. (2005). „Člen rodiny TREM, TLT-1, se nachází výhradně v alfa-granulích megakaryocytů a krevních destiček.“. Krev. 104 (4): 1042–7. doi:10.1182 / krev-2004-01-0315. PMID 15100151.
Barrow AD, Astoul E, Floto A a kol. (2004). „Špička: TREM-podobný transkript-1, destičkový imunoreceptorový tyrosinový inhibiční motiv kódující kostimulační imunoreceptor, který spíše než inhibuje signalizaci vápníku prostřednictvím SHP-2“. J. Immunol. 172 (10): 5838–42. doi:10,4049 / jimmunol.172.10.5838. PMID 15128762.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Gattis JL, Washington AV, Chisholm MM a kol. (2006). „Struktura extracelulární domény spouštěcího receptoru exprimovaná na myeloidních buňkách, jako je transkript-1, a důkaz přirozeně se vyskytujícího rozpustného fragmentu“. J. Biol. Chem. 281 (19): 13396–403. doi:10,1074 / jbc.M600489200. PMID 16505478.
Giomarelli B, Washington VA, Chisholm MM a kol. (2007). „Inhibice agregace trombocytů indukované trombiny pomocí lidských jednořetězcových Fv protilátek specifických pro transkript-1 podobný TREM“. Tromb. Haemost. 97 (6): 955–63. doi:10.1160 / th06-08-0456. PMID 17549298.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161911 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023993 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12393607-5] Washington AV, Quigley L, McVicar DW (listopad 2002). „Počáteční charakterizace transkriptu podobného TREM (TLT) -1: domnělý inhibiční receptor v klastru TREM“. Krev. 100 (10): 3822–4. doi:10.1182 / krev-2002-02-0523. PMID 12393607.

[pmid12645956-6] Allcock RJ, Barrow AD, Forbes S, Beck S, Trowsdale J (březen 2003). „Klastr lidského genu TREM na 6p21.1 kóduje aktivační i inhibiční receptory jediné domény IgV a zahrnuje NKp44.“ Eur J Immunol. 33 (2): 567–77. doi:10.1002 / imu.200310033. PMID 12645956. S2CID 27147251.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: TREML1 spouštěcí receptor exprimovaný na myeloidních buňkách jako 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]