TNIK - TNIK

TNIK
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2X7F, 5CWZ, 5AX9
Identifikátory
Aliasy	TNIK, TRAF2 a NCK interagující kináza, MRT54
Externí ID	OMIM: 610005 MGI: 1916264 HomoloGene: 77943 Genové karty: TNIK
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	171,460,408 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	28,675,858 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita proteinkinázy; • vazba nukleotidů; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • Aktivita kinázy kinázy MAP kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • recyklace endosomu; • endosom; • nukleoplazma; • apikální plazmatická membrána; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • buněčné jádro; • cytosol; • presynapse; • glutamátergická synapse; • postsynaptická hustota, intracelulární složka;
Biologický proces	• reorganizace aktinového cytoskeletu; • sestava microvillus; • pozitivní regulace fosforylace bílkovin; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • fosforylace; • aktivace aktivity JNKK; • Wnt signální cesta; • vývoj nervového systému; • regulace morfogeneze dendritů; • fosforylace bílkovin; • organizace cytoskeletu; • autofosforylace; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • aktivace aktivity MAPKKK; • regulace mitotického buněčného cyklu; • regulace apoptotického procesu; • Kaskáda MAPK; • signální transdukce fosforylací proteinů; • stresem aktivovaná signální kaskáda protein kinázy; • aktivace aktivity proteinkinázy; • morfogeneze projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23043
	665113
	ENSG00000154310
	ENSMUSG00000027692
	Q9UKE5
	P83510
NM_001161560; NM_001161561; NM_001161562; NM_001161563; NM_001161564;
	NM_001161565; NM_001161566; NM_015028
	NM_001163007; NM_001163008; NM_001163009; NM_026910
NP_001155032; NP_001155033; NP_001155034; NP_001155035; NP_001155036;
	NP_001155037; NP_001155038; NP_055843
	NP_001156479; NP_001156480; NP_001156481; NP_081186
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

TRAF2 a NCK interagující protein kináza je enzym že u lidí je kódován TNIK gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Kinázy germinálních center (GCK), jako je TNIK, jsou charakterizovány an N-terminál kináza doména a C-terminál GCK doména, která plní regulační funkci.^[6]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že TNIK interaguje s KIAA0090,^[8] ačkoli význam je nejasný. Bylo prokázáno, že TNIK fosforyluje Gelsolin, protein podílející se na depolymeraci F-aktinu, čímž indukuje cytoskeletální změny.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154310 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027692 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (srpen 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (1): 31–9. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.
^ ^A ^b ^C Fu CA, Shen M, Huang BC, Lasaga J, Payan DG, Luo Y (listopad 1999). „TNIK, nový člen rodiny kináz germinálního centra, který aktivuje dráhu N-terminální kinázy c-Jun a reguluje cytoskelet“. J Biol Chem. 274 (43): 30729–37. doi:10.1074 / jbc.274.43.30729. PMID 10521462.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TNIK TRAF2 a NCK interagující kináza“.
^ Prieto C, De Las Rivas J (červenec 2006). „APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzer“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s webovým serverem): W298–302. doi:10.1093 / nar / gkl128. PMC 1538863. PMID 16845013. Archivovány od originál dne 2010-04-09.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Yonekura H, Migita H, Sakurai S a kol. (1999). „Antisense display - metoda pro funkční screening genů: hodnocení v bezbuněčném systému a izolace genů souvisejících s angiogenezí“. Nucleic Acids Res. 27 (13): 2591–600. doi:10.1093 / nar / 27.13.2591. PMC 148466. PMID 10373574.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB a kol. (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Taira K, Umikawa M, Takei K a kol. (2005). „Kináza interagující s Traf2 a Nck jako domnělý efektor Rap2 k regulaci aktinového cytoskeletu“. J. Biol. Chem. 279 (47): 49488–96. doi:10,1074 / jbc.M406370200. PMID 15342639.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wissing J, Jänsch L, Nimtz M a kol. (2007). „Proteomická analýza proteinových kináz metodou selektivní prefrakce cílové třídy a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Mol. Buňka. Proteomika. 6 (3): 537–47. doi:10,1074 / mcp. T600062-MCP200. PMID 17192257.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154310 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027692 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9628581-5] Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (srpen 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (1): 31–9. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.

[pmid10521462-6] A ^b ^C Fu CA, Shen M, Huang BC, Lasaga J, Payan DG, Luo Y (listopad 1999). „TNIK, nový člen rodiny kináz germinálního centra, který aktivuje dráhu N-terminální kinázy c-Jun a reguluje cytoskelet“. J Biol Chem. 274 (43): 30729–37. doi:10.1074 / jbc.274.43.30729. PMID 10521462.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TNIK TRAF2 a NCK interagující kináza“.

[pmid16845013-8] Prieto C, De Las Rivas J (červenec 2006). „APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzer“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s webovým serverem): W298–302. doi:10.1093 / nar / gkl128. PMC 1538863. PMID 16845013. Archivovány od originál dne 2010-04-09.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]