TMLHE - TMLHE
TMLHE | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | TMLHE, AUTSX6, BBOX2, TMLD, TMLH, TMLHED, XAP130, D430017M14Rik, trimethyllysinhydroxyláza, epsilon | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 300777 MGI: 2180203 HomoloGene: 21853 Genové karty: TMLHE | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr X: 155,49 - 155,67 Mb | n / a | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Trimethyllysindioxygenáza, mitochondriální je enzym že u lidí je kódován TMLHE gen v chromozom X.[4][5][6] Mutace v TMLHE gen vedoucí k biosyntéza karnitinu narušení bylo spojeno s příznaky autismu.[7]
Struktura
The TMHLE gen se nachází na extrémním konci oblasti Xq28 s vysokou genomovou nestabilitou,[8] a kóduje proteinovou trimethyllysindioxygenázu, a, Fe2 + a 2-oxoglytarát závislou nehemovou železnou hydrolázu lokalizovanou na mitochondriální matice.[9]
Funkce
Enzym trimethyllysin dioxygenázy katalyzuje první krok v karnitin biosyntetická cesta,[9] který je součástí biosyntézy aminu. Karnitin je molekula, která hraje zásadní roli v transportu aktivovaného mastné kyseliny přes vnitřní mitochondriální membrána kde jsou metabolizovány. Kódovaný protein se převádí trimethyllysin do hydroxytrimethyllysin s reakcí (EC 1.14.11.8):
N6, N6, N (6) -trimethyl-L-lysin + 2-oxoglutarát + O2 = 3-hydroxy-N6, N6, N (6) -trimethyl-L-lysin + sukcinát + CO2.
a vyžaduje žehlička a L-askorbát tak jako kofaktory.
Klinický význam
Mutace v THLHE genové příčiny Nedostatek epsilon-trimethyllysin hydroxylázy (TMLHED),[10][11] an vrozená chyba metabolismu v biosyntéza karnitinu, což může zvýšit riziko vývoje neurodevelopmentální poruchy, autismus související chování a Poruchy autistického spektra.[12][7]
Interakce
Bylo prokázáno, že THLHE má 14 binárních interakce protein-protein včetně 12 společných interakcí. Zdá se, že THLHE interaguje s SUGCT.[13]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185973 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Rogner UC, Heiss NS, Kioschis P, Wiemann S, Korn B, Poustka A (říjen 1996). „Transkripční analýza kandidátské oblasti pro inkontinentní pigmenti (IP2) v Xq28“. Výzkum genomu. 6 (10): 922–34. doi:10,1101 / gr. 6.10.922. PMID 8908511.
- ^ Vaz FM, Ofman R, Westinga K, Back JW, Wanders RJ (září 2001). "Molekulární a biochemická charakterizace krysí epsilon-N-trimethyllysinhydroxylázy, prvního enzymu biosyntézy karnitinu". The Journal of Biological Chemistry. 276 (36): 33512–7. doi:10,1074 / jbc.M105929200. PMID 11431483.
- ^ „Entrez Gene: TMLHE trimethyllysine hydroxylase, epsilon“.
- ^ A b Ziats MN, Comeaux MS, Yang Y, Scaglia F, Elsea SH, Sun Q, Beaudet AL, Schaaf CP (září 2015). "Zlepšení příznaků regresivního autismu u dítěte s nedostatkem TMLHE po suplementaci karnitinem". American Journal of Medical Genetics. Část A. 167A (9): 2162–7. doi:10,1002 / ajmg.a.37144. PMID 25943046.
- ^ Monfregola J, Napolitano G, Conte I, Cevenini A, Migliaccio C, D'Urso M, Ursini MV (2007). "Funkční charakterizace genu TMLH: analýza promotoru, hybridizace in situ, identifikace a mapování alternativních sestřihových variant". Gen. 395 (1–2): 86–97. doi:10.1016 / j.gene.2007.02.012. PMID 17408883.
- ^ A b Monfregola J, Cevenini A, Terracciano A, van Vlies N, Arbucci S, Wanders RJ, D'Urso M, Vaz FM, Ursini MV (2005). "Funkční analýza variant TMLH a definice domén potřebných pro katalytickou aktivitu a mitochondriální cílení". J. Cell. Physiol. 204 (3): 839–47. doi:10.1002 / jcp.20332. PMID 15754339.
- ^ Celestino-Soper PB, Shaw CA, Sanders SJ, Li J, Murtha MT, Ercan-Sencicek AG, Davis L, Thomson S, Gambin T, Chinault AC, Ou Z, German JR, Milosavljevic A, Sutcliffe JS, Cook EH, Stankiewicz P, State MW, Beaudet AL (2011). „Použití pole CGH k detekci variant exonového počtu kopií v celém genomu v rodinách autismu detekuje novou deleci v TMLHE“. Hučení. Mol. Genet. 20 (22): 4360–70. doi:10,1093 / hmg / ddr363. PMC 3196886. PMID 21865298.
- ^ Nava C, Lamari F, Héron D, Mignot C, Rastetter A, Keren B, Cohen D, Faudet A, Bouteiller D, Gilleron M, Jacquette A, Whalen S, Afenjar A, Périsse D, Laurent C, Dupuits C, Gautier C , Gérard M, Huguet G, Caillet S, Leheup B, Leboyer M, Gillberg C, Delorme R, Bourgeron T, Brice A, Depienne C (2012). „Analýza chromozomu X exome u pacientů s poruchami autistického spektra identifikovala nové kandidátské geny, včetně TMLHE“. Transl Psychiatrie. 2: e179. doi:10.1038 / tp.2012.102. PMC 3565810. PMID 23092983.
- ^ http://www.omim.org/entry/300872
- ^ „Pro hledaný výraz TMLHE bylo nalezeno 14 binárních interakcí“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-25.
Další čtení
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Monfregola J, Cevenini A, Terracciano A, van Vlies N, Arbucci S, Wanders RJ, D'Urso M, Vaz FM, Ursini MV (září 2005). "Funkční analýza variant TMLH a definice domén potřebných pro katalytickou aktivitu a mitochondriální cílení". Journal of Cellular Physiology. 204 (3): 839–47. doi:10.1002 / jcp.20332. PMID 15754339.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
- Monfregola J, Napolitano G, Conte I, Cevenini A, Migliaccio C, D'Urso M, Ursini MV (červen 2007). „Funkční charakterizace genu TMLH: analýza promotoru, hybridizace in situ, identifikace a mapování alternativních sestřihových variant“. Gen. 395 (1–2): 86–97. doi:10.1016 / j.gene.2007.02.012. PMID 17408883.
![]() | Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |