THOC5 - THOC5
THO komplexní podjednotka 5 homolog je protein že u lidí je kódován THOC5 gen. THOCs je členem komplexu THO, který je subkomplexem transkripčního / exportního komplexu (TREX).
THOC5 je evolučně konzervován ve vyšších eukaryoty, nicméně přesné role THOC5 v transkripci a mRNA vývoz stále nejasný. THOC5 je fosforylovaný několik proteinové kinázy na více zbytcích po extracelulárních podnětech. Patří mezi ně stimulace růstovými faktory / cytokiny /chemokiny nebo činidla pro poškození DNA. Kromě toho je THOC5 substrátem pro několik onkogenní tyrosinkinázy, což naznačuje, že THOC5 může být zapojen do vývoje rakoviny.
Nedávná data myši s knockoutem THOC5 ukazují, že THOC5 je základním prvkem při údržbě kmenové buňky a růstový faktor / diferenciace / proliferace zprostředkovaná cytokiny. Kromě toho deplece THOC5 ovlivňuje méně než 1% celkového exportu mRNA v ustáleném stavu, ovlivňuje však více než 90% genů indukovaných růstovým faktorem / cytokiny. THOC5, čímž přispívá k 3 'zpracování a / nebo exportu bezprostředně časných genů vyvolaných extracelulárními stimuly. Tyto studie přinášejí nový pohled na souvislost mezi exportním komplexem mRNA a okamžitou časnou genovou odpovědí. T
Údaje z těchto studií také naznačují, že THOC5 může být užitečným nástrojem pro studium biologie kmenových buněk, pro úpravu procesů diferenciace a pro léčba rakoviny.[5][6][7][8][9][10][11][12][13][14][15][16]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100296 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034274 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Tran DDH, Koch A a Tamura T. THOC5, člen exportního komplexu mRNA: nová vazba mezi stroji pro export mRNA a signálními transdukčními cestami v buněčné proliferaci a diferenciaci. Mobilní komunikace a signalizace 2014, 12: 3
- ^ Tran DD, Saran S, Dittrich-Breiholz O, Williamson AJ, Klebba-Farber S, Koch A, Kracht M, Whetton AD, Tamura T (2013) Transkripční regulace okamžité časné genové odpovědi THOC5, člen exportního komplexu mRNA , přispívá k diferenciaci makrofágů vyvolané M-CSF. Buněčná smrt a nemoc 4: e879
- ^ Saran S, Tran DD, Klebba-Farber S, Moran-Losada P, Wiehlmann L, Koch A, Chopra H, Pabst O, Hoffmann A, Klopfleisch R, Tamura T (2013) THOC5, člen exportního komplexu mRNA, přispívá zpracování podskupiny bezkřídlých / integrovaných (Wnt) cílových mRNA a integrity střevní bariéry. BMC Cell Biol 14: 51
- ^ Griaud, F., Pierce, A., Gonzalez Sanchez, M.B., Scott, M., Abraham, S.A., Holyoake, T.L., Tran, D.D., Tamura, T. a Whetton, A.D. (2013). Cesta od leukemogenních onkogenů a chemokinů kmenových buněk k zpracování RNA pomocí THOC5. Leukemia 27, 932-940.
- ^ Katahira J, Okuzaki D, Inoue H, Yoneda Y, Maehara K, Ohkawa Y (2013) Lidská složka TREX Thoc5 ovlivňuje alternativní výběr polyadenylačního místa náborem savčího štěpného faktoru I. Nucleic Acids Research 41: 7060-7072
- ^ Katahira J, Inoue H, Hurt E, Yoneda Y (2009) Adapter Aly a koadaptér Thoc5 fungují v jaderném exportu HSP70 mRNA zprostředkovaném Tap-p15. EMBO Journal 28: 556-567
- ^ Ramachandran S., Tran DD., Klebba-Faerber S., Kardinal C., Whetton AD., Tamura T. Odezva zprostředkovaná ataxií-teleaniektázií (ATM) kinázou na poškození DNA down-reguluje potenciál THOC5 vázat mRNA. . RNA 17 (11): 1957-66, 2011
- ^ Guria A., Tran DDH, Ramachandran S., Koch A., Bounkari O., Dutta P, Hauser H, Tamura T. Identifikace mRNA, které jsou spojeny, ale nejsou exportovány do cytoplazmy v nepřítomnosti THOC5 ve fibroblastech myších embryí, RNA, 2011 17: 00-00.
- ^ Mancini, A., Niemann-Seyde, SC, Pankow, R., El Bounkari, O., Klebba-Färber, S., Koch, A., EJaworska, E., Spooncer, E., Gruber, AD, Whetton, AD, Tamura, T. (2010) THOC5 / FMIP, protein komplexu TREX pro export mRNA, je nezbytný pro přežití primitivních buněk krvetvorby in vivo. BMC Biology 8, 1.
- ^ Mancini, A., El Bounkari, O., Norrenbrock, AF., Scherr, M., Schaefer, D., Eder M., Banham, AH, Pulford, K., Lyne, L., Whetton AD a Tamura, T. (2007) FMIP řídí závazek adipocytové linie buněk C2C12 down-modulací C / EBPalpha. Oncogene 26, 1020-1027.
- ^ Mancini A., Koch A., Whetton AD a Tamura T. (2004) Substrát receptoru M-CSF a interagující protein FMIP se řídí v jeho subcelulární lokalizaci fosforylací zprostředkovanou proteinkinázou C, a tím zesiluje diferenciaci zprostředkovanou M-CSF. . Oncogene, 23, 6581-9.
- ^ Tamura, T., Mancini, A., Joos, H., Koch, A., Hakim, C., Dumanski, J., Weidner, KM a Niemann, H. (1999) FMIP, nový protein interagující s Fms , ovlivňuje granulocyty / makrofágy. Oncogene, 18, 6488-6495.
- ^ Strasser K, Masuda S, Mason P, Pfannstiel J, Oppizzi M, Rodriguez-Navarro S, Rondon AG, Aguilera A, Struhl K, Reed R, Hurt E (květen 2002). „TREX je konzervovaná složitá vazebná transkripce s exportem messengerové RNA“. Příroda. 417 (6886): 304–8. doi:10.1038 / příroda746. PMID 11979277.
- ^ Xie YG, Han FY, Peyrard M, Ruttledge MH, Fransson I, DeJong P, Collins J, Dunham I, Nordenskjold M, Dumanski JP (prosinec 1993). „Klonování nového, anonymního genu z megacázového rozsahu YAC a kosmidu v oblasti neurofibromatózy typu 2 / meningiomu na lidský chromozom 22q12“. Hum Mol Genet. 2 (9): 1361–8. doi:10,1093 / hmg / 2,9,1361. PMID 8242058.
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červenec 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
- ^ Carney L, Pierce A, Rijnen M, Gonzalez Sanchez MB, Hamzah HG, Zhang L, Tamura T, Whetton AD (prosinec 2008). "THOC5 spojuje signalizaci M-CSF receptoru s expresí transkripčního faktoru". Signál buňky. 21 (2): 309–16. doi:10.1016 / j.cellsig.2008.10.018. PMID 19015024.
- ^ Pierce A, Carney L, Hamza HG, Griffiths JR, Zhang L, Whetton BA, Gonzalez Sanchez MB, Tamura T, Sternberg D, Whetton AD (květen 2008). „Protein spliceosomu THOC5: cíl leukaemogenních tyrosin kináz, který ovlivňuje obrat lipidů inositolu“. Br J Haematol. 141 (5): 641–50. doi:10.1111 / j.1365-2141.2008.07090.x. PMID 18373705.
- ^ „Entrez Gene: THOC5 THO komplex 5“.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Tamura T, Mancini A, Joos H a kol. (2000). „FMIP, nový protein interagující s Fms, ovlivňuje diferenciaci granulocytů / makrofágů“. Onkogen. 18 (47): 6488–95. doi:10.1038 / sj.onc.1203062. PMID 10597251.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Mancini A, Koch A, Whetton AD, Tamura T (2004). „Substrát receptoru M-CSF a interagující protein FMIP se řídí v jeho subcelulární lokalizaci fosforylací zprostředkovanou proteinkinázou C, a tím zesiluje diferenciaci zprostředkovanou M-CSF“. Onkogen. 23 (39): 6581–9. doi:10.1038 / sj.onc.1207841. PMID 15221008.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Carroll JS, Liu XS, Brodsky AS a kol. (2005). „Mapování vazby estrogenových receptorů v celém chromozomu odhaluje regulaci dlouhého dosahu vyžadující protein forkhead FoxA1“. Buňka. 122 (1): 33–43. doi:10.1016 / j.cell.2005.05.008. PMID 16009131.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.