TFIP11 - TFIP11

TFIP11

Identifikátory

TFIP11, NTR1, Spp382, TIP39, bK445C9.6, hNtr1, protein interagující s tuftelinem 11, STIP, STIP-1

Externí ID

OMIM: 612747 MGI: 1930075 HomoloGene: 40813 Genové karty: TFIP11

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 22 (lidský)^[1]

Kapela	22q12.1	Start	26,491,225 bp^[1]
Kapela	22q12.1	Konec	26,512,505 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 5 (myš)^[2]

Kapela	5 \| 5 F.	Start	112,326,358 bp^[2]
Kapela	5 \| 5 F.	Konec	112,338,073 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba nukleové kyseliny
Buněčná složka	• cytoplazma • jaderná skvrna • katalytický krok 2 spliceosom • Spliceozomální komplex uvolňující post-mRNA typu U2 • jádro • spliceosomální komplex • jaderný chromozom, telomerická oblast • buněčné jádro • nukleoplazma • extracelulární matrix
Biologický proces	• Zpracování RNA • ochrana před nehomologním spojením konců u telomer • negativní regulace sestavy proteinového komplexu • vývoj biominerální tkáně • Zpracování mRNA • demontáž spliceozomálního komplexu • negativní regulace vazby na bílkoviny • negativní regulace opravy dvouvláknových zlomů spojením nehomologickým koncem • Sestřih RNA • negativní regulace aktivity DNA ligázy • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


24144


54723


ENSG00000100109


ENSMUSG00000029345


Q9UBB9


Q9ERA6

RefSeq (mRNA)

NM_001008697 NM_001346857 NM_001346858 NM_001346859 NM_001346861
NM_001346862 NM_012143


NM_018783

RefSeq (protein)

NP_001008697 NP_001333786 NP_001333787 NP_001333788 NP_001333790
NP_001333791 NP_036275


NP_061253

Místo (UCSC)

Chr 22: 26,49 - 26,51 Mb

Chr 5: 112,33 - 112,34 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Tuftelin interagující protein 11 je protein že u lidí je kódován TFIP11 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Ukázalo se, že TFIP11 komunikovat s Tuftelin.^[5]{

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100109 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029345 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Paine CT, Paine ML, Luo W, Okamoto CT, Lyngstadaas SP, Snead ML (srpen 2000). „Protein interagující s tuftelinem (TIP39) se lokalizuje na apikálním sekrečním pólu myších ameloblastů“. J Biol Chem. 275 (29): 22284–92. doi:10,1074 / jbc.M000118200. PMID 10806191.
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
^ "Entrez Gene: TFIP11 tuftelin interagující protein 11".

Další čtení

Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Collins JE, Goward ME, Cole CG a kol. (2003). „Přehodnocení anotace lidského genu: analýza druhé generace chromozomu 22“. Genome Res. 13 (1): 27–36. doi:10,1101 / gr. 695703. PMC 430954. PMID 12529303.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Wen X, Lei YP, Zhou YL a kol. (2005). "Strukturální organizace a buněčná lokalizace tuftelin interagujícího proteinu 11 (TFIP11)". Buňka. Mol. Life Sci. 62 (9): 1038–46. doi:10.1007 / s00018-005-4547-z. PMID 15868102.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.