TEF (gen) - TEF (gene)

TEF
Identifikátory
Aliasy	TEF, Transkripční faktor PAR bZIP, transkripční faktor TEF, člen rodiny PAR bZIP
Externí ID	OMIM: 188595 MGI: 98663 HomoloGene: 31140 Genové karty: TEF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	41,399,326 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	81,826,863 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • dvouřetězcová vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • rytmický proces; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj mnohobuněčných organismů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7008
	21685
	ENSG00000167074
	ENSMUSG00000022389
	Q10587
	Q9JLC6
	NM_003216; NM_001145398
	NM_017376; NM_153484
	NP_001138870; NP_003207
	NP_059072; NP_705617
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Thyrotrofní embryonální faktor je protein že u lidí je kódován TEF gen.^[5]^[6]^[7]

Thyrotrofický embryonální faktor (TEF), transkripční faktor, je členem PAR (prolin a bohaté na kyselé aminokyseliny) podrodina transkripčních faktorů bazické oblasti / leucinového zipu (bZIP). Je exprimován v široké škále buněk a tkání u dospělých zvířat, nicméně během embryonální vývoj, výraz TEF se zdá být omezen na vývoj přední hypofýza, shodný s výskytem Štítná žláza -stimulační hormon, beta (TSHB ). TEF se skutečně může vázat na a transaktivovat promotor TSHB.

Ukazuje homologie (ve funkčních doménách) s dalšími členy podrodiny PAR-bZIP transkripčních faktorů, které zahrnují protein vázající se na albumin D box (DBP), lidský faktor jaterní leukémie (HLF ) a kuře vitellogenin gen vázající protein (VBP); VBP je považován za kuře homolog TEF. Mohou snadno vzniknout různí členové podčeledi heterodimery a sdílet DNA vazebné a transkripční regulační vlastnosti.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167074 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022389 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Khatib ZA, Inaba T, Valentine M, Podívejte se na (únor 1995). "Chromozomální lokalizace a klonování cDNA lidských genů DBP a TEF". Genomika. 23 (2): 344–51. doi:10.1006 / geno.1994.1510. PMID 7835883.
^ Inukai T, Inaba T, Dang J, Kuribara R, Ozawa K, Miyajima A, Wu W, Look AT, Arinobu Y, Iwasaki H, Akashi K, Kagami K, Goi K, Sugita K, Nakazawa S (květen 2005). „TEF, antiapoptotický transkripční faktor bZIP vztahující se k onkogenní chiméře E2A-HLF, inhibuje růst buněk down-regulující expresí běžného beta řetězce cytokinových receptorů“. Krev. 105 (11): 4437–44. doi:10.1182 / krev-2004-08-2976. PMID 15665112.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TEF tyreotropní embryonální faktor“.

Další čtení

Drolet DW, Scully KM, Simmons DM a kol. (1991). „TEF, transkripční faktor exprimovaný specificky v přední hypofýze během embryogeneze, definuje novou třídu proteinů leucinového zipu“. Genes Dev. 5 (10): 1739–53. doi:10.1101 / gad. 5. 10. 1739. PMID 1916262.
Hunger SP, Li S, Fall MZ a kol. (1996). „Protononkogen HLF a související základní protein leucinového zipu TEF vykazují velmi podobné vazebné a transkripční regulační vlastnosti DNA“. Krev. 87 (11): 4607–17. PMID 8639829.
Ossipow V, Fonjallaz P, Schibler U (1999). „Komplex RNA polymerázy II obsahující všechny základní iniciační faktory se váže na aktivační doménu transkripčního faktoru PAR leucinového zipu a štítné žlázy“.. Mol. Buňka. Biol. 19 (2): 1242–50. doi:10.1128 / mcb.19.2.1242. PMC 116053. PMID 9891058.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Krueger DA, Warner EA, Dowd DR (2000). „Podíl thyrotrofního embryonálního faktoru na regulaci genové exprese zprostředkované vápníkem“. J. Biol. Chem. 275 (19): 14524–31. doi:10.1074 / jbc.275.19.14524. PMID 10799536.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Newman JR, Keating AE (2003). "Komplexní identifikace interakcí lidského bZIP s poli vinutých cívek". Věda. 300 (5628): 2097–101. Bibcode:2003Sci ... 300.2097N. doi:10.1126 / science.1084648. PMID 12805554.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167074 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022389 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7835883-5] Khatib ZA, Inaba T, Valentine M, Podívejte se na (únor 1995). "Chromozomální lokalizace a klonování cDNA lidských genů DBP a TEF". Genomika. 23 (2): 344–51. doi:10.1006 / geno.1994.1510. PMID 7835883.

[pmid15665112-6] Inukai T, Inaba T, Dang J, Kuribara R, Ozawa K, Miyajima A, Wu W, Look AT, Arinobu Y, Iwasaki H, Akashi K, Kagami K, Goi K, Sugita K, Nakazawa S (květen 2005). „TEF, antiapoptotický transkripční faktor bZIP vztahující se k onkogenní chiméře E2A-HLF, inhibuje růst buněk down-regulující expresí běžného beta řetězce cytokinových receptorů“. Krev. 105 (11): 4437–44. doi:10.1182 / krev-2004-08-2976. PMID 15665112.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TEF tyreotropní embryonální faktor“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]