TBC1D1 - TBC1D1

TBC1D1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3QYE
Identifikátory
Aliasy	TBC1D1Člen rodiny domény TBC, TBC1, TBC1 1
Externí ID	OMIM: 609850 MGI: 1889508 HomoloGene: 56856 Genové karty: TBC1D1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	38,139,175 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	64,351,486 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • Vazba Rab GTPázy;
Buněčná složka	• cytosol; • buněčné jádro; • endomembránový systém; • intracelulární;
Biologický proces	• regulace sestavy cilium; • membránová organizace; • regulace lokalizace proteinů; • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 aktivace aktivity GTPázy; • regulace fúze vezikul; • transport intracelulárních proteinů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23216
	57915
	ENSG00000065882
	ENSMUSG00000029174
	Q86TI0
	Q60949
	NM_001253912; NM_001253913; NM_001253914; NM_001253915; NM_015173
	NM_001289514; NM_019636; NM_001310611
	NP_001240841; NP_001240842; NP_001240843; NP_001240844; NP_055988
	NP_001276443; NP_001297540; NP_062610
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Člen rodiny TBC1 domény 1 je protein že u lidí je kódován TBC1D1 gen.^[5]^[6]

TBC1D1 je zakládajícím členem rodiny proteinů sdílejících 180- až 200-aminokyselina TBC doména předpokládá se, že bude mít roli v regulaci růst buněk a diferenciace buněk. Tyto proteiny mají významný podíl homologie s TRE2 (USP6; MIM 604334), droždí Bub2 a CDC16 (MIM 603461) (White et al., 2000). [Dodáváno společností OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000065882 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000029174 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ White RA, Pasztor LM, Richardson PM, Zon LI (září 2000). „Gen kódující TBC1D1 s homologií s tre-2 / USP6 onkogenem, BUB2 a cdc16 se mapuje na myší chromozom 5 a lidský chromozom 4“. Cytogenet Cell Genet. 89 (3–4): 272–5. doi:10.1159/000015632. PMID 10965142. S2CID 22255963.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TBC1D1 TBC1 (tre-2 / USP6, BUB2, cdc16) doménová rodina, člen 1“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Roach WG, Chavez JA, Mîinea CP, Lienhard GE (2007). "Specifičnost substrátu a účinek na GLUT4 translokaci proteinu Tbc1d1 aktivujícího Rab GTPázu". Biochem. J. 403 (2): 353–8. doi:10.1042 / BJ20061798. PMC 1874243. PMID 17274760.
Stone S, Abkevich V, Russell DL a kol. (2006). „TBC1D1 je kandidátem na gen těžké obezity a důkazem interakce gen / gen v predispozici k obezitě“. Hučení. Mol. Genet. 15 (18): 2709–20. doi:10,1093 / hmg / ddl204. PMID 16893906.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000065882 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000029174 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10965142-5] White RA, Pasztor LM, Richardson PM, Zon LI (září 2000). „Gen kódující TBC1D1 s homologií s tre-2 / USP6 onkogenem, BUB2 a cdc16 se mapuje na myší chromozom 5 a lidský chromozom 4“. Cytogenet Cell Genet. 89 (3–4): 272–5. doi:10.1159/000015632. PMID 10965142. S2CID 22255963.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TBC1D1 TBC1 (tre-2 / USP6, BUB2, cdc16) doménová rodina, člen 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]