TADA2L - TADA2L

TADA2A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X41
Identifikátory
Aliasy	TADA2A, ADA2, ADA2A, TADA2L, hADA2, KL04P, transkripční adaptér 2A
Externí ID	OMIM: 602276 MGI: 2144471 HomoloGene: 38834 Genové karty: TADA2A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	37,479,725 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	84,129,600 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita histon acetyltransferázy; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • vazba chromatinu; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • PCAF komplex; • chromozóm; • Komplex typu SAGA;
Biologický proces	• pozitivní regulace acetylace histonů; • acetylace histonu H3; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • remodelace chromatinu; • regulace acetylace histonů; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6871
	217031
	ENSG00000276234; ENSG00000277104
	ENSMUSG00000018651
	O75478
	Q8CHV6
	NM_001166105; NM_001291918; NM_001488; NM_133439
	NM_172562
	NP_001159577; NP_001278847; NP_001479; NP_597683
	NP_766150
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Přepisovací adaptér 2-alfa je protein že u lidí je kódován TADA2A gen.^[5]^[6]

Funkce

Mnoho transkripčních aktivátorových proteinů vázajících DNA zvyšuje rychlost iniciace transkripce genu zprostředkované RNA polymerázou II tím, že funkčně interaguje s obecným transkripčním mechanizmem vázaným na bazální promotor. Pro tuto aktivaci jsou obvykle potřebné adaptorové proteiny, případně pro acetylaci a destabilizaci nukleosomů, čímž se zmírní omezení chromatinu na promotoru. Protein kódovaný tímto genem je adaptér transkripčního aktivátoru a bylo zjištěno, že je součástí komplexu PCAF histonacetylázy. Pro tento gen byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

TADA2L bylo prokázáno komunikovat s GCN5L2,^[7]^[8] TADA3L^[9]^[10] a Moje C.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000277104 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018651 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Candau R, Moore PA, Wang L, Barlev N, Ying CY, Rosen CA, Berger SL (únor 1996). "Identifikace lidských proteinů funkčně konzervovaných kvasinkovými domnělými adaptéry ADA2 a GCN5". Molekulární a buněčná biologie. 16 (2): 593–602. doi:10,1128 / mcb.16.2.593. PMC 231038. PMID 8552087.
^ ^A ^b „Entrez Gene: transkripční adaptér TADA2L 2 (homolog ADA2, kvasinky)“.
^ Barlev NA, Poltoratsky V, Owen-Hughes T, Ying C, Liu L, Workman JL, Berger SL (březen 1998). „Represe aktivity GCN5 histon-acetyltransferázy prostřednictvím vazby zprostředkované bromodoménou a fosforylace komplexem protein-kinázy závislé na Ku-DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (3): 1349–58. doi:10.1128 / mcb.18.3.1349. PMC 108848. PMID 9488450.
^ Wang L, Mizzen C, Ying C, Candau R, Barlev N, Brownell J, Allis CD, Berger SL (leden 1997). „Aktivita histon acetyltransferázy je mezi kvasinkami a lidským GCN5 zachována a je nutná pro doplnění růstu a transkripční aktivaci.“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (1): 519–27. doi:10,1128 / mcb.17.1.519. PMC 231776. PMID 8972232.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Wang T, Kobayashi T, Takimoto R, Denes AE, Snyder EL, el-Deiry WS, Brachmann RK (listopad 2001). "hADA3 je vyžadován pro aktivitu p53". Časopis EMBO. 20 (22): 6404–13. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6404. PMC 125723. PMID 11707411.
^ Liu X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (květen 2003). „Transformační doména c-Myc získává lidský komplex STAGA a pro aktivaci transkripce vyžaduje aktivitu acetylázy TRRAP a GCN5.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (22): 20405–12. doi:10,1074 / jbc.M211795200. PMC 4031917. PMID 12660246.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Wang L, Mizzen C, Ying C, Candau R, Barlev N, Brownell J, Allis CD, Berger SL (leden 1997). „Aktivita histon acetyltransferázy je mezi kvasinkami a lidským GCN5 zachována a je nutná pro doplnění růstu a transkripční aktivaci.“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (1): 519–27. doi:10,1128 / mcb.17.1.519. PMC 231776. PMID 8972232.
Carter KC, Wang L, Shell BK, Zamir I, Berger SL, Moore PA (březen 1997). "Lidské transkripční adaptorové geny TADA2L a GCN5L2 se kolokalizují na chromozom 17q12-q21 a vykazují podobný vzor tkáňové exprese". Genomika. 40 (3): 497–500. doi:10.1006 / geno.1996.4605. PMID 9073520.
Henriksson A, Almlöf T, Ford J, McEwan IJ, Gustafsson JA, Wright AP (červen 1997). „Role komplexu Ada adaptor v aktivaci genů glukokortikoidním receptorem“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (6): 3065–73. doi:10,1128 / mcb.17.6.3065. PMC 232159. PMID 9154805.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (červenec 1998). „Histony podobné TAF v komplexu PCAF histon acetylázy“. Buňka. 94 (1): 35–44. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2. PMID 9674425. S2CID 18942972.
Vassilev A, Yamauchi J, Kotani T, Prives C, Avantaggiati ML, Qin J, Nakatani Y (prosinec 1998). „400 kDa podjednotka komplexu PCAF histonacetylázy patří do nadčeledi ATM“. Molekulární buňka. 2 (6): 869–75. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80301-9. PMID 9885574.
Wang T, Kobayashi T, Takimoto R, Denes AE, Snyder EL, el-Deiry WS, Brachmann RK (listopad 2001). "hADA3 je vyžadován pro aktivitu p53". Časopis EMBO. 20 (22): 6404–13. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6404. PMC 125723. PMID 11707411.
Barlev NA, Emelyanov AV, Castagnino P, Zegerman P, Bannister AJ, Sepulveda MA, Robert F, Tora L, Kouzarides T, Birshtein BK, Berger SL (říjen 2003). „Nový lidský homolog Ada2 funguje s Gcn5 nebo Brg1 pro koaktivaci transkripce“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (19): 6944–57. doi:10.1128 / MCB.23.19.6944-6957.2003. PMC 193946. PMID 12972612.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Qian C, Zhang Q, Li S, Zeng L, Walsh MJ, Zhou MM (prosinec 2005). "Struktura a vazba chromozomální DNA domény SWIRM". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 12 (12): 1078–85. doi:10.1038 / nsmb1022. PMID 16299514. S2CID 23215862.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000277104 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018651 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8552087-5] Candau R, Moore PA, Wang L, Barlev N, Ying CY, Rosen CA, Berger SL (únor 1996). "Identifikace lidských proteinů funkčně konzervovaných kvasinkovými domnělými adaptéry ADA2 a GCN5". Molekulární a buněčná biologie. 16 (2): 593–602. doi:10,1128 / mcb.16.2.593. PMC 231038. PMID 8552087.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: transkripční adaptér TADA2L 2 (homolog ADA2, kvasinky)“.

[pmid9488450-7] Barlev NA, Poltoratsky V, Owen-Hughes T, Ying C, Liu L, Workman JL, Berger SL (březen 1998). „Represe aktivity GCN5 histon-acetyltransferázy prostřednictvím vazby zprostředkované bromodoménou a fosforylace komplexem protein-kinázy závislé na Ku-DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (3): 1349–58. doi:10.1128 / mcb.18.3.1349. PMC 108848. PMID 9488450.

[pmid8972232-8] Wang L, Mizzen C, Ying C, Candau R, Barlev N, Brownell J, Allis CD, Berger SL (leden 1997). „Aktivita histon acetyltransferázy je mezi kvasinkami a lidským GCN5 zachována a je nutná pro doplnění růstu a transkripční aktivaci.“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (1): 519–27. doi:10,1128 / mcb.17.1.519. PMC 231776. PMID 8972232.

[pmid16189514-9] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid11707411-10] Wang T, Kobayashi T, Takimoto R, Denes AE, Snyder EL, el-Deiry WS, Brachmann RK (listopad 2001). "hADA3 je vyžadován pro aktivitu p53". Časopis EMBO. 20 (22): 6404–13. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6404. PMC 125723. PMID 11707411.

[pmid12660246-11] Liu X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (květen 2003). „Transformační doména c-Myc získává lidský komplex STAGA a pro aktivaci transkripce vyžaduje aktivitu acetylázy TRRAP a GCN5.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (22): 20405–12. doi:10,1074 / jbc.M211795200. PMC 4031917. PMID 12660246.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]