Syncytin-2 - Syncytin-2

ERVFRD-1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1R4M
Identifikátory
Aliasy	ERVFRD-1, ERVFRDE1, GLLL6191, HERV-FRD, HERV-W / FRD, UNQ6191, envFRD, člen FRD skupiny endogenní retroviru 1, člen FRD skupiny 1 endogenní retroviru, obálka
Externí ID	OMIM: 610524 MGI: 3045308 HomoloGene: 86779 Genové karty: ERVFRD-1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	11,111,725 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	69,294,299 bp
Ortology
	405754
	239167
	ENSG00000244476
	ENSMUSG00000047977
	P60508
	Q8BI41
	NM_207582
	NM_173420
	NP_997465
	NP_775596
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Syncytin-2 také známý jako člen FRD endogenní retrovirové skupiny 1 je protein, který je u lidí kódován ERVFRD-1 gen.^[5] Tento protein hraje klíčovou roli při implantaci lidských embryí do dělohy.^[6]

Tento gen je konzervován u všech primátů s odhadovaným věkem 45 milionů let. Receptor pro tuto fuzogenní látku env protein je MFSD2. Myší syncytiny nejsou skutečné ortology.^[7]

Virus spolu s několika velmi podobnými inzercemi patří do skupiny pod doménou Gammaretrovirus- jako ERV třídy I. Podobné ERV se nacházejí v artiodaktyly, výsledek nezávislé integrační události.^[8] Navrhovaná nomenklatura navrhuje umístit všechny takové prvky „třídy I“ do taxonu na úrovni rodu odděleně od Gammaretrovirus.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000244476 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000047977 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: HERV-FRD HERV-FRD provirusový předek Env polyprotein".
^ Vargas A, Moreau J, Landry S, LeBellego F, Toufaily C, Rassart E, Lafond J, Barbeau B (2009). „Syncytin-2 hraje důležitou roli při fúzi lidských trofoblastových buněk“. Journal of Molecular Biology. 392 (2): 301–18. doi:10.1016 / j.jmb.2009.07.025. PMID 19616006.
^ Lavialle C, Cornelis G, Dupressoir A, Esnault C, Heidmann O, Vernochet C, Heidmann T (září 2013). "Paleovirologie" syncytinů ", retrovirové env geny vyzařovaly roli v placentaci". Filozofické transakce Královské společnosti v Londýně. Série B, Biologické vědy. 368 (1626): 20120507. doi:10.1098 / rstb.2012.0507. PMC 3758191. PMID 23938756.
^ Vargiu, L; Rodriguez-Tomé, P; Sperber, GO; Cadeddu, M; Grandi, N; Blikstad, V; Tramontano, E; Blomberg, J (22. ledna 2016). „Klasifikace a charakterizace lidských endogenních retrovirů; mozaikové formy jsou běžné“. Retrovirologie. 13: 7. doi:10.1186 / s12977-015-0232-r. PMC 4724089. PMID 26800882.
^ Gifford, RJ; Blomberg, J; Coffin, JM; Fan, H; Heidmann, T; Mayer, J; Stoye, J; Tristem, M; Johnson, WE (28. srpna 2018). „Nomenklatura pro lokusy endogenního retroviru (ERV)“. Retrovirologie. 15 (1): 59. doi:10.1186 / s12977-018-0442-1. PMC 6114882. PMID 30153831.

Další čtení

de Parseval N, Lazar V, Casella JF, Benit L, Heidmann T (říjen 2003). „Průzkum lidských genů retrovirového původu: identifikace a transkriptom genů s kódovací kapacitou pro kompletní obalové proteiny“. Journal of Virology. 77 (19): 10414–22. doi:10.1128 / JVI.77.19.10414-10422.2003. PMC 228468. PMID 12970426.
Blaise S, de Parseval N, Bénit L, Heidmann T (říjen 2003). „Celogenomový screening fusogenních lidských endogenních retrovirových obalů identifikuje syncytin 2, gen konzervovaný při vývoji primátů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (22): 13013–8. Bibcode:2003PNAS..10013013B. doi:10.1073 / pnas.2132646100. PMC 240736. PMID 14557543.
Blaise S, Ruggieri A, Dewannieux M, Cosset FL, Heidmann T (leden 2004). „Identifikace obalového proteinu z rodiny FRD lidských endogenních retrovirů (HERV-FRD) propůjčujících infekci a funkční konzervaci u opic“. Journal of Virology. 78 (2): 1050–4. doi:10.1128 / JVI.78.2.1050-1054.2004. PMC 368808. PMID 14694139.
Renard M, Varela PF, Letzelter C, Duquerroy S, Rey FA, Heidmann T (říjen 2005). „Krystalová struktura klíčové domény lidského syncytinu-2, 40 milionů let starého genu pro fuzogenní obálku endogenního retroviru zachyceného primáty“. Journal of Molecular Biology. 352 (5): 1029–34. doi:10.1016 / j.jmb.2005.07.058. PMID 16140326.
Malassiné A, Blaise S, Handschuh K, Lalucque H, Dupressoir A, Evain-Brion D, Heidmann T (2007). „Exprese fusogenního HERV-FRD Env glykoproteinu (syncytin 2) v lidské placentě je omezena na vilózní cytotrofoblastické buňky“. Placenta. 28 (2–3): 185–91. doi:10.1016 / j.placenta.2006.03.001. PMID 16714059.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000244476 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000047977 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: HERV-FRD HERV-FRD provirusový předek Env polyprotein".

[pmid19616006-6] Vargas A, Moreau J, Landry S, LeBellego F, Toufaily C, Rassart E, Lafond J, Barbeau B (2009). „Syncytin-2 hraje důležitou roli při fúzi lidských trofoblastových buněk“. Journal of Molecular Biology. 392 (2): 301–18. doi:10.1016 / j.jmb.2009.07.025. PMID 19616006.

[pmid23938756-7] Lavialle C, Cornelis G, Dupressoir A, Esnault C, Heidmann O, Vernochet C, Heidmann T (září 2013). "Paleovirologie" syncytinů ", retrovirové env geny vyzařovaly roli v placentaci". Filozofické transakce Královské společnosti v Londýně. Série B, Biologické vědy. 368 (1626): 20120507. doi:10.1098 / rstb.2012.0507. PMC 3758191. PMID 23938756.

[pmid26800882-8] Vargiu, L; Rodriguez-Tomé, P; Sperber, GO; Cadeddu, M; Grandi, N; Blikstad, V; Tramontano, E; Blomberg, J (22. ledna 2016). „Klasifikace a charakterizace lidských endogenních retrovirů; mozaikové formy jsou běžné“. Retrovirologie. 13: 7. doi:10.1186 / s12977-015-0232-r. PMC 4724089. PMID 26800882.

[9] Gifford, RJ; Blomberg, J; Coffin, JM; Fan, H; Heidmann, T; Mayer, J; Stoye, J; Tristem, M; Johnson, WE (28. srpna 2018). „Nomenklatura pro lokusy endogenního retroviru (ERV)“. Retrovirologie. 15 (1): 59. doi:10.1186 / s12977-018-0442-1. PMC 6114882. PMID 30153831.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]