Stephen Altschul - Stephen Altschul

Stephen Altschul
narozený
Stephen Frank Altschul

(1957-02-28) 28. února 1957 (věk 63)
Státní občanstvíSpojené státy
Alma materHarvardská Univerzita (AB, matematika)
Massachusetts Institute of Technology (Ph.D., matematika)
Známý jakoVÝBUCH
Manžel (y)Caroline Kershaw James (m. 1994)
Vědecká kariéra
PoleBioinformatika
InstituceNCBI
TezeAspekty srovnání biologické sekvence  (1987)
Doktorský poradceDaniel Kleitman[1]
webová stránkawww.ncbi.nlm.NIH.gov/výzkum/personál/ altschul

Stephen Frank Altschul (narozený 28. února 1957) je Američan matematik kdo navrhl algoritmy které se používají v oblasti bioinformatika (Karlin-Altschulův algoritmus[2] a jeho nástupci[3]). Altschul je spoluautorem VÝBUCH použitý algoritmus pro sekvenční analýza z bílkoviny a nukleotidy.[4][5]

Vzdělávání

Altschul absolvoval summa cum laude[6] z Harvardská Univerzita, kde byl zvolen Phi Beta Kappa v matematika a má Ph.D. ve stejném poli od Massachusetts Institute of Technology.[7]

Výzkum

Jeho výzkumný zájem je zaměřen na algoritmy zarovnání sekvencí, statistiku srovnání sekvencí a měření podobnosti sekvencí.[4][5]

Pozadí

On je syn Stephanie Rosemary (rozená Wagner) a Arthur Altschul, bývalý partner v Goldman Sachs.[8][9] V roce 1994 se oženil s Caroline Kershaw James, dcerou Caroline James-Pritz z Cincinnati a Harry Keithan James z Dayton, Ohio. Reverend Luther D. Miller Jr. provedl obřad v biskupském kostele sv. Davida ve Washingtonu.[6]

Jeho nevlastní sestra je novinářka Serena Altschul známá svým působením v MTV. Z otcovy strany je členem Lehmanova rodina.

Má dva syny, Jamese a Williama Altschula. William Altschul je bývalý vysokoškolský hráč na Washingtonské univerzitě v St. Louis. [10]

Od matematiky k bioinformatice

Během svých vysokoškolských let se Altschul začal zajímat o biologii. V důsledku toho začal číst knihy o DNA. Jedna z knih, které četl, byla Dvojitá šroubovice Watson.[Citace je zapotřebí ] Dále absolvoval kurz Evoluční biologie.[Citace je zapotřebí ] Altschul také strávil dvě léta prací v laboratořích na Rockfellerově univerzitě, kde pomáhal psát počítačové kódy pro rentgenový krystalografický projekt.[Citace je zapotřebí ]

Kvůli jeho zájmu Altschul uvažoval o pokusu o postgraduální studium biologie.[Citace je zapotřebí ] Místo toho se rozhodl aplikovat na programy v aplikované matematice s nadějí, že najde nějaké aplikace matematiky v biologii, na kterých by mohl pracovat.

Pozoruhodné jmenované funkce / pozice

Po absolutoriu pracoval Stephen Frank Altschul v oboru matematického výzkumu Národního ústavu pro diabetes a nemoci trávicího ústrojí a ledvin jako postgraduální stáž IRTA. Od roku 1990 do současnosti pracoval v oboru výpočetní biologie NCBI a zastával pozici vedoucího vyšetřovatele.

Reference

  1. ^ Stephen Altschul na Matematický genealogický projekt
  2. ^ Altschul, S.; Gish, W.; Miller, W.; Myers, E.; Lipman, D. (1990). "Základní vyhledávací nástroj pro místní zarovnání". Journal of Molecular Biology. 215 (3): 403–410. doi:10.1016 / S0022-2836 (05) 80360-2. PMID  2231712.
  3. ^ Altschul, S.; Madden, T. L .; Schäffer, A. A .; Zhang, J .; Zhang, Z .; Miller, W.; Lipman, D. J. (1997). „Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (17): 3389–3402. doi:10.1093 / nar / 25.17.3389. PMC  146917. PMID  9254694.
  4. ^ A b Seznam publikací z Microsoft Academic
  5. ^ A b Stephen F. Altschul na DBLP Bibliografický server Upravte to na Wikidata
  6. ^ A b New York Times: „Svatby; Caroline James, Stephen Altschul“ 17.dubna 1994
  7. ^ Altschul, Stephen Frank (1987). Aspekty srovnání biologické sekvence (Disertační práce). Massachusetts Institute of Technology.
  8. ^ Oznámení o smrti Arthura Goodharta Altschula
  9. ^ https://www.nytimes.com/1956/03/18/archives/trota-announced-of-miss-wagner-to-be-wed-in-may.html
  10. ^ https://play.usaultimate.org/teams/events/Eventteam/?TeamId=x%2f0V5EX9wIVnzxDyk7NGO5XjowKF%2boMV0pElxx1dgY8%3d

externí odkazy