Spondin 1 - Spondin 1 - Wikipedia

SPON1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2ZOT, 2ZOU, 3COO, 3Q13
Identifikátory
Aliasy	SPON1, VSGP / F-spondin, f-spondin, Spondin 1
Externí ID	OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 Genové karty: SPON1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	14,268,133 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	114,043,370 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • strukturní složka extracelulární matrice; • Vazba domény LBD;
Buněčná složka	• extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • lumen endoplazmatického retikula; • extracelulární; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• buněčná adheze; • fukosylace spojená s O proteinem; • pozitivní regulace zpracování bílkovin; • pozitivní regulace vazby na bílkoviny; • negativní regulace tvorby amyloidu-beta; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu prekurzoru amyloidu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10418
	233744
	ENSG00000262655
	ENSMUSG00000038156
	Q9HCB6
	Q8VCC9
	NM_006108
	NM_145584
	NP_006099
	NP_663559
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Spondin-1 (také známý jako F-spondin) je a protein že u lidí je kódován SPON1 gen.^[5] Je vylučován buňkami podlahovou desku a může být zapojen do axonové vedení^[6] Protein obsahuje 807 aminokyselin a je strukturně složen ze šesti trombospondin domény, jedna navinout doména a jedna doména spondin.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000262655 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038156 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
^ „Entrez Gene: SPON1 spondin 1, protein extracelulární matrix“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Klar A, Baldassare M, Jessell TM (1992). „F-spondin: gen exprimovaný ve vysokých hladinách v podlahové desce kóduje vylučovaný protein, který podporuje adhezi nervových buněk a prodloužení neuritů“. Buňka. 69 (1): 95–110. doi:10.1016 / 0092-8674 (92) 90121-R. PMID 1555244. S2CID 14880785.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Miyamoto K, Morishita Y, Yamazaki M (2001). „Izolace a charakterizace faktoru podporujícího růst buněk hladkého svalstva cév z ovčí folikulární tekutiny a její cDNA klonování z hovězího a lidského vaječníku“. Oblouk. Biochem. Biophys. 390 (1): 93–100. doi:10.1006 / abbi.2001.2367. PMID 11368520.
Gonzalez de Peredo A, Klein D, Macek B (2002). „Opakování C-mannosylace a o-fukosylace trombospondinu typu 1“. Mol. Buňka. Proteomika. 1 (1): 11–8. doi:10,1074 / mcp.M100011-MCP200. PMID 12096136.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Ho A, Südhof TC (2004). „Vazba F-spondinu na prekurzorový protein amyloid-beta: kandidátní ligand prekurzorového proteinu amyloid-beta, který moduluje štěpení prekurzorového proteinu amyloid-beta“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (8): 2548–53. doi:10.1073 / pnas.0308655100. PMC 356987. PMID 14983046.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Pyle-Chenault RA, Stolk JA, Molesh DA (2005). „VSGP / F-spondin: nový marker rakoviny vaječníků“. Tumor Biol. 26 (5): 245–57. doi:10.1159/000087379. PMID 16103746. S2CID 13409234.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Kitagawa M, Kudo Y, Iizuka S (2006). "Vliv F-spondinu na cementoblastickou diferenciaci lidských periodontálních vazových buněk" (PDF). Biochem. Biophys. Res. Commun. 349 (3): 1050–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.08.142. PMID 16965763.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9HCB6 (Spondin-1) u PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000262655 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038156 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9872452-5] Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.

[entrez-6] „Entrez Gene: SPON1 spondin 1, protein extracelulární matrix“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]