SciCrunch - SciCrunch - Wikipedia

SciCrunch je společně upravován znalostní báze o vědeckých zdrojích, a komunitní portál pro výzkumné pracovníky a systém pro správu obsahu pro data a databáze. Účelem je poskytnout společný zdroj dat výzkumné komunitě a údaje o identifikátorech zdrojů výzkumu (RRID ), které lze použít v vědecké publikace. V určitém ohledu je to pro vědu a vědecké publikace, podobné tomu, co Wikidata je pro Wikimedia Foundation projekty. S hostitelem University of California, San Diego, SciCrunch byl také navržen tak, aby pomohl komunitám výzkumných pracovníků vytvářet vlastní portály, aby poskytovaly přístup ke zdrojům, databáze a nástroje relevantní pro jejich výzkumné oblasti [1]

Identifikujte zdroje výzkumu

Identifikujte zdroje výzkumu (RRID) mají být identifikátory prostředků, které jsou globálně jedinečné a trvalé.[2]Byly zavedeny a jsou propagovány Iniciativa pro identifikaci zdrojů.[2]Zdroje v této souvislosti jsou zdroje výzkumu, jako jsou činidla, nástroje nebo materiály.[2][3]Příkladem takového zdroje může být a buněčná linie použitý v experimentu nebo softwarový nástroj použitý ve výpočetní analýze.The Portál pro identifikaci zdrojů (https://scicrunch.org/resources ) byl vytvořen na podporu této iniciativy a je ústřední službou, kde lze tyto identifikátory vyhledávat a vytvářet.[2][4] Tyto identifikátory by měly být plně prohledávatelné pomocí dolování dat na rozdíl od doplňkových souborů a lze je aktualizovat na nové verze, jak se postupem času mění základní metodologie.

Formát citací RRID

Doporučení pro citování výzkumných zdrojů je uvedeno níže pro klíčové biologické zdroje:

  • Protilátka: Millipore Cat # MAB377 (šarže) RRID: AB_2298772
  • Modelový organismus: NXR Cat # 1.0049, RRID: NXR_1.0049
  • Buněčná linie: Coriell Cat # GM03745, RRID: CVCL_1H60
  • Nástroje: Software pro analýzu obrazu CellProfiler (verze nebo datum) RRID: SCR_007358

The Portál pro identifikaci zdrojů uvádí seznam existujících RRID a pokyny pro vytvoření nového, pokud RRID odpovídající zdroji ještě neexistuje.

Instituce a vydavatelé doporučující použití RRID

Celý seznam naleznete na seznamu rrids.org: https://www.rrids.org/journals

Řada vydavatelství, iniciativ a výzkumné instituce podpořit používání RRID SciCrunch:

Viz také

externí odkazy

Reference

  1. ^ Jeffrey, Grethe; Anita, Bandrowski; Davis, banky; Christopher, Condit; Amarnath, Gupta; Stephen, Larson; Yueling, Li; Ibrahim, Ozyurt; Andrea, Stagg; Patricia, Whetzel; Luis, Marenco; Perry, Miller; Rixin, Wang; Gordon, Shepherd; Maryann, Martone (2014). „SciCrunch: Platforma pro spolupráci a vyhledávání dat a zdrojů pro vědecké komunity“. Hranice v neuroinformatice. 8. doi:10.3389 / konf.fninf.2014.18.00069.
  2. ^ A b C d Bandrowski, Anita; Kartáč, Matthew; Grethe, Jeffery S .; Haendel, Melissa A.; Kennedy, David N .; Hill, Sean; Hof, Patrick R .; Martone, Maryann E .; Pols, Maaike; Tan, Serena; Washington, Nicole; Zudilova-Seinstra, Elena; Vasilevskij, Nicole; dalšími autory jsou členové Iniciativa pro identifikaci zdrojů (https://www.force11.org/node/4463/members ) (19. listopadu 2015). „Iniciativa pro identifikaci zdrojů: kulturní posun ve vydávání“. F1000Výzkum. 2. 4 (134): 134. doi:10.12688 / f1000 výzkum.6555.2. PMC  4648211. PMID  26594330.
  3. ^ „Co je to zdroj?“. scicrunch.org. SciCrunch. Citováno 7. ledna 2018.
  4. ^ „Portál identifikace zdrojů“. scicrunch.org. SciCrunch. Citováno 7. ledna 2018.
  5. ^ Singh Chawla, Dalmeet (2015). „Vědci argumentují společným formátem“. Příroda. doi:10.1038 / příroda.2015.17652. S2CID  211730637.
  6. ^ „Cell Press: Neuron“. www.cell.com.
  7. ^ „eLife se připojuje k iniciativě Resource Identification Initiative“. 2016-07-07.
  8. ^ „Iniciativa pro identifikaci zdrojů“. SÍLA 11. 2013-08-14. Citováno 18. dubna 2016.
  9. ^ „Pokyny pro autora hranic“. Hranice. Citováno 19. dubna 2016.
  10. ^ "Technická poznámka | GigaScience | Oxford Academic". acad.oup.com. Citováno 2019-07-15.
  11. ^ „identifiers.org“. Sběr dat: RRID. Citováno 18. dubna 2016.
  12. ^ „NIDA podporuje SciCrunch a RRID při zviditelňování zdrojů výzkumu ve vědě“. SÍLA 11. 2016-03-07. Citováno 18. dubna 2016.
  13. ^ „Představujeme iniciativu Research Resource Identification Initiative v PLOS Biology & PLOS Genetics“. PLOS Biolog. 2015-01-29. Citováno 18. dubna 2016.

Více informací o SciCrunch a RRID: Rozhovor s Dr. Anitou Bandrowski