Sytost (genetická) - Saturation (genetic)

Genetická saturace je výsledkem násobku substituce - na stejném místě v pořadí, nebo identické substituce v jiném pořadí, tak, aby to bylo zřejmé sekvenční divergence míra je nižší než skutečná divergence, ke které došlo.[1] Ve fylogenetice vedou účinky nasycení k přitažlivost dlouhé větve, kde nejvzdálenější linie mají zavádějící krátké délky větví. Snižuje také fylogenetickou informaci obsaženou v sekvencích.[2]

Genetická saturace nastává nejrychleji na rychle se vyvíjejících sekvencích, jako je hypervariabilní oblast mitochondriální DNA, nebo v Krátký tandemový opakování například na Y-chromozomu.[3][4]

Viz také

Reference

  1. ^ Philippe H, Brinkmann H, Lavrov DV, Littlewood DT, Manuel M, Wörheide G, Baurain D (březen 2011). „Řešení obtížných fylogenetických otázek: proč nestačí více sekvencí“. Biologie PLoS. 9 (3): e1000602. doi:10.1371 / journal.pbio.1000602. PMC  3057953. PMID  21423652.
  2. ^ Abylgazieva NA (01.01.2003). "[Případ" renálního diabetu "]". Zdravookhranenie Kirgizii. 26 (3): 49–51. doi:10.1016 / S1055-7903 (02) 00326-3. PMID  7903.
  3. ^ Henn BM, Gignoux CR, Feldman MW, Mountain JL (leden 2009). „Charakterizace časové závislosti odhadů rychlosti mutace lidské mitochondriální DNA“. Molekulární biologie a evoluce. 26 (1): 217–30. doi:10.1093 / molbev / msn244. PMID  18984905.
  4. ^ Ho SY, Phillips MJ, Cooper A, Drummond AJ (červenec 2005). „Časová závislost odhadů molekulární rychlosti a systematické nadhodnocování nedávných časů divergence“. Molekulární biologie a evoluce. 22 (7): 1561–8. doi:10.1093 / molbev / msi145. PMID  15814826.