SYVN1 - SYVN1
E3 ubikvitin-protein ligáza synoviolin je enzym že u lidí je kódován SYVN1 gen.[5][6]
Funkce
Tento gen kóduje protein zapojený do endoplazmatické retikulum Degradace spojená s (ER). Kódovaný protein odstraňuje rozložené proteiny nahromaděné během ER stres, retrográdním transportem do cytosol z ER. Tento protein také používá ubikvitin-proteazomový systém pro další degradaci rozložených proteinů. Tento gen a gen L49 mitochondriálního ribozomálního proteinu používají ve svých příslušných 3 'UTR některé stejné genomové sekvence. Sekvenční analýza identifikovala dvě varianty transkriptu, které kódují různé izoformy.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162298 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024807 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Amano T, Yamasaki S, Yagishita N, Tsuchimochi K, Shin H, Kawahara K, Aratani S, Fujita H, Zhang L, Ikeda R, Fujii R, Miura N, Komiya S, Nishioka K, Maruyama I, Fukamizu A, Nakajima T (Říjen 2003). „Synoviolin / Hrd1, ubikvitinová ligáza E3, jako nový patogenní faktor pro artropatii“. Geny a vývoj. 17 (19): 2436–49. doi:10.1101 / gad.1096603. PMC 218080. PMID 12975321.
- ^ A b „Entrez Gene: SYVN1 inhibitor synoviální apoptózy 1, synoviolin“.
Další čtení
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (duben 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.
- Kaneko M, Ishiguro M, Niinuma Y, Uesugi M, Nomura Y (prosinec 2002). „Lidská HRD1 chrání před apoptózou vyvolanou stresem ER prostřednictvím degradace související s ER“. FEBS Dopisy. 532 (1–2): 147–52. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03660-8. PMID 12459480. S2CID 44570384.
- Nadav E, Shmueli A, Barr H, Gonen H, Ciechanover A, Reiss Y (březen 2003). „Nová savčí endoplazmatická retikula ubikvitinová ligáza homologní s kvasinkami Hrd1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 303 (1): 91–7. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00279-1. PMID 12646171.
- Kikkert M, Doolman R, Dai M, Avner R, Hassink G, van Voorden S, Thanedar S, Roitelman J, Chau V, Wiertz E (leden 2004). „Lidská HRD1 je ubikvitinová ligáza E3 podílející se na degradaci proteinů z endoplazmatického retikula“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (5): 3525–34. doi:10,1074 / jbc.M307453200. PMID 14593114.
- Lilley BN, Ploegh HL (říjen 2005). „Multiproteinové komplexy, které spojují dislokaci, ubikvitinaci a extrakci nesprávně složených proteinů z membrány endoplazmatického retikula“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (40): 14296–301. doi:10.1073 / pnas.0505014102. PMC 1242303. PMID 16186509.
- Ye Y, Shibata Y, Kikkert M, van Voorden S, Wiertz E, Rapoport TA (říjen 2005). „Nábor p97 ATPázy a ubikvitinových ligáz do místa retrotranslokace na membráně endoplazmatického retikula“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (40): 14132–8. doi:10.1073 / pnas.0505006102. PMC 1242302. PMID 16186510.
- Schulze A, Standera S, Buerger E, Kikkert M, van Voorden S, Wiertz E, Koning F, Kloetzel PM, Seeger M (prosinec 2005). „Protein HERP ubikvitinové domény tvoří komplex se složkami degradační dráhy spojené s endoplazmatickým retikulem“. Journal of Molecular Biology. 354 (5): 1021–7. doi:10.1016 / j.jmb.2005.10.020. PMID 16289116.
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
- Yamasaki S, Yagishita N, Tsuchimochi K, Kato Y, Sasaki T, Amano T, Beppu M, Aoki H, Nakamura H, Nishioka K, Nakajima T (červenec 2006). „Rezistence na stres endoplazmatického retikula je získanou buněčnou charakteristikou revmatoidních synoviálních buněk“. International Journal of Molecular Medicine. 18 (1): 113–7. doi:10,3892 / ijmm.18.1.113. PMID 16786162.
- Toh ML, Marotte H, Blond JL, Jhumka U, Eljaafari A, Mougin B, Miossec P (červenec 2006). „Nadměrná exprese synoviolinu v periferní krvi a synoviocytů od pacientů s revmatoidní artritidou a pokračující zvýšení u neodpovídajících na léčbu infliximabem“. Artritida a revmatismus. 54 (7): 2109–18. doi:10,1002 / čl. 21926. PMID 16802346.
- Arteaga MF, Wang L, Ravid T, Hochstrasser M, Canessa CM (červenec 2006). „Amfipatická spirála cílí na sérum a glukokortikoidy indukovanou kinázu 1 na endoplazmatické retikulum spojené s konjugačním aparátem na ubikvitin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (30): 11178–83. doi:10.1073 / pnas.0604816103. PMC 1544061. PMID 16847254.
- Omura T, Kaneko M, Okuma Y, Orba Y, Nagashima K, Takahashi R, Fujitani N, Matsumura S, Hata A, Kubota K, Murahashi K, Uehara T, Nomura Y (prosinec 2006). „Ubikvitin ligáza HRD1 podporuje degradaci Pael receptoru, substrátu Parkinu“. Journal of Neurochemistry. 99 (6): 1456–69. doi:10.1111 / j.1471-4159.2006.04155.x. hdl:2115/17141. PMID 17059562. S2CID 6256027.
- Yang H, Zhong X, Ballar P, Luo S, Shen Y, Rubinsztein DC, Monteiro MJ, Fang S (únor 2007). „Ubikvitin ligáza Hrd1 zvyšuje degradaci a potlačuje toxicitu huntingtinu expandovaného polyglutaminem“. Experimentální výzkum buněk. 313 (3): 538–50. doi:10.1016 / j.yexcr.2006.10.031. PMID 17141218.
- Yamasaki S, Yagishita N, Sasaki T, Nakazawa M, Kato Y, Yamadera T, Bae E, Toriyama S, Ikeda R, Zhang L, Fujitani K, Yoo E, Tsuchimochi K, Ohta T, Araya N, Fujita H, Aratani S , Eguchi K, Komiya S, Maruyama I, Higashi N, Sato M, Senoo H, Ochi T, Yokoyama S, Amano T, Kim J, Gay S, Fukamizu A, Nishioka K, Tanaka K, Nakajima T (leden 2007). „Cytoplazmatická destrukce p53 endoblazmatickým retikulárním ubikvitin ligázou Synoviolin'". Časopis EMBO. 26 (1): 113–22. doi:10.1038 / sj.emboj.7601490. PMC 1782373. PMID 17170702.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q86TM6 (E3 ubikvitin-protein ligáza synoviolin) na PDBe-KB.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |