SSMEM1 - SSMEM1

SSMEM1
Identifikátory
AliasySSMEM1, C7orf45, jednoprůchodový membránový protein bohatý na serin 1, jednoprůchodový membránový protein bohatý na serin 1
Externí IDMGI: 1922897 HomoloGene: 12615 Genové karty: SSMEM1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 7 (lidský)
Chr.Chromozom 7 (lidský)[1]
Chromozom 7 (lidský)
Genomické umístění pro SSMEM1
Genomické umístění pro SSMEM1
Kapela7q32.2Start130,206,344 bp[1]
Konec130,216,844 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

136263

75647

Ensembl

ENSG00000165120

ENSMUSG00000029784

UniProt

Q8WWF3

n / a

RefSeq (mRNA)

NM_145268

NM_027073
NM_029373

RefSeq (protein)

NP_660311

n / a

Místo (UCSC)Chr 7: 130,21 - 130,22 MbChr 6: 30,51 - 30,52 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Jednosložkový membránový protein bohatý na serin 1 je a protein že u lidí je kódován SSMEM1 gen.[5]

Gen

Struktura genu a intron-exonu byla nejprve předpovězena analýzou kompletní sekvence lidského chromozomu 7, přičemž její počáteční označení bylo C7orf45.[6][7] Lidské mRNA transkripty byly identifikovány pomocí dvou klonovacích cDNA ve velkém měřítku, amerického úsilí vyčerpaného Dana-Farber Cancer Institute a Harvard Medical School a celoživotního dlouhého japonského úsilí. Gen, kterému byl později přidělen oficiální symbol SSMEM1, se nachází na dlouhém rameni chromozom 7 (7q32.2) na sense strand u lidí.[8] Transkript lidské mRNA je dlouhý 1171 bp se třemi exony.[9]

Aliasy

U lidí je SSMEM1 také označován jako C7orf45.[8] Human SSMEM1 má název klonu FLJ40316.[8]

Výraz

U lidí je SSMEM1 vysoce exprimován ve varlatech.[10][ověření se nezdařilo ][11][12] U myší je SSMEM1 exprimován v mozku.[13]

Protein

U lidí jednosložková membrána bohatá na seriny protein 1 má délku 244 aminokyselin s a transmembránový oblast domény zahrnující aminokyseliny 35-55.[5] Tento protein má doménu neznámé funkce (DUF4636), která pokrývá téměř veškerý protein (aminokyseliny 1-243).[5] DUF4636 patří k pfam15468, který je součástí nadčeledi cl21285, který se nachází v eukaryotech a má obvykle délku 196 až 244 aminokyselin.[5] Lidský protein má a molekulární váha 28036 Da a izoelektrický bod 7,64.[5][14]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165120 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029784 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d E "jednoprůchodový membránový protein bohatý na serin 1 [Homo sapiens]". Protein. NCBI. 26. srpna 2016. NP_660311.1. Citováno 2016-12-16.
  6. ^ „Zobrazeno 9 782 kbp z Chr7, pozice 129 233 084 až 129 242 865“. Projekt anotace chromozomu 7. Červen 2004. Mezník nebo region: Gene: C7orf45 | NM_145268.2. Citováno 2016-12-16.
  7. ^ Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Human Chromosome 7: DNA Sequence and Biology“. Věda. 300 (5620): 767–772. Bibcode:2003Sci ... 300..767S. doi:10.1126 / science.1083423. PMC  2882961. PMID  12690205.
  8. ^ A b C "SSMEM1 jednosložkový membránový protein bohatý na serin 1 [Homo sapiens (člověk)]" ". Gen. NCBI. 6. prosince 2016. 136263. Citováno 2016-12-16.
  9. ^ "Homo sapiens serin bohatý jednoprůchodový membránový protein 1 (SSMEM1), mRNA". Nukleotid. NCBI. 26. srpna 2016. NM_145268.3. Citováno 2016-12-16.
  10. ^ „Patent Spojených států: 8586006 - Orgánově specifické proteiny a způsoby jejich použití“.
  11. ^ „Est Profile - Hs.351816“. UniGene. NCBI. 2016.
  12. ^ „GDS3834 / 4246“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2016-12-17.
  13. ^ "Gene Detail :: Allen Brain Atlas: Mouse Brain". mouse.brain-map.org. Citováno 2016-12-17.
  14. ^ „SSMEM1 (člověk)“. www.phosphosite.org. Citováno 2016-12-17.