SRGAP2 - SRGAP2 - Wikipedia

SRGAP2
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySRGAP2, ARHGAP34, FNBP2, SRGAP2A, SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase aktivující protein 2
Externí IDOMIM: 606524 MGI: 109605 HomoloGene: 52683 Genové karty: SRGAP2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 1 (lidský)
Chr.Chromozom 1 (lidský)[1]
Chromozom 1 (lidský)
Genomické umístění pro SRGAP2
Genomické umístění pro SRGAP2
Kapela1q32.1Start206,203,345 bp[1]
Konec206,464,443 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

23380

14270

Ensembl

ENSG00000266028

ENSMUSG00000026425

UniProt

O75044

Q91Z67

RefSeq (mRNA)

NM_001081011
NM_019520

RefSeq (protein)

NP_001074480

Místo (UCSC)Chr 1: 206,2 - 206,46 MbChr 1: 131,29 - 131,53 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

SLIT-ROBO Rho GTPase-aktivující protein 2 (srGAP2), také známý jako protein vázající formin 2 (FNBP2), je savčí protein že u lidí je kódován SRGAP2 gen.[5][6] Je zapojen do neuronální migrace a diferenciace[7] a hraje v synaptický vývoj,[8] mozková hmotnost a počet kortikální neurony.[9] Downregulace srGAP2 inhibuje odpuzování buněk od buněk a zvyšuje dobu kontaktu buněk a buněk.

SRGAP2 dimerizuje přes jeho F-BAR doména.[10] SRGAP2C, zkrácená verze nalezená na začátku homininy a lidé, kteří mají pouze doménu F-BAR, působí proti svému působení. Zpomaluje zrání některých neuronů a zvyšuje hustotu neuronální páteře.[10]

Vývoj

SRGAP2 je jedním z 23 genů, o nichž je známo, že jsou duplikovány u lidí, ale ne jiné primáti.[11] SRGAP2 byl duplikován třikrát v lidský genom za posledních 3,4 milionu let: volala jedna duplikace před 3,4 miliony let (mya) SRGAP2B, následovaný dvěma, které zkopírovaly SRGAP2B 2,4 mya do SRGAP2C a ~ 1 mya do SRGAP2D. Všechny tři duplicity jsou také přítomny v Denisovani a Neandertálci.[12] Jsou zkráceny stejným způsobem při zachování F-box doménu, ale vypustit RhoGAP a SH3 domén.[13] Všichni lidé mají SRGAP2C.[14] SRGAP2C inhibuje funkci rodové kopie, SRGAP2A, heterodimerizací a umožňuje rychlejší migraci neuronů interferencí s filopodia produkce a také zpomalení rychlosti synaptického zrání a zvýšení hustoty synapsí v mozková kůra.[8] SRGAP2B je vyjádřen na velmi nízkých úrovních a SRGAP2D je a pseudogen. Ne všichni lidé mají SRGAP2B nebo SRGAP2D.[13]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000266028 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026425 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Madura T, Yamashita T, Kubo T, Tsuji L, Hosokawa K, Tohyama M (duben 2004). "Změny v mRNA proteinu 2 aktivujícího GTPázu Slit-Robo po transekci lícního nervu". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 123 (1–2): 76–80. doi:10.1016 / j.molbrainres.2004.01.002. PMID  15046868.
  6. ^ Wong K, Ren XR, Huang YZ, Xie Y, Liu G, Saito H, Tang H, Wen L, Brady-Kalnay SM, Mei L, Wu JY, Xiong WC, Rao Y (říjen 2001). „Transdukce signálu při migraci neuronů: role proteinů aktivujících GTPázu a malé GTPázy Cdc42 v dráze Slit-Robo“. Buňka. 107 (2): 209–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00530-X. PMID  11672528.
  7. ^ Guerrier S, Coutinho-Budd J, Sassa T, Gresset A, Jordan NV, Chen K, Jin WL, Frost A, Polleux F (září 2009). „F-BAR doména srGAP2 indukuje membránové výčnělky potřebné pro migraci neuronů a morfogenezi“. Buňka. 138 (5): 990–1004. doi:10.1016 / j.cell.2009.06.047. PMC  2797480. PMID  19737524.
  8. ^ A b Charrier C, Joshi K, Coutinho-Budd J, Kim JE, Lambert N, de Marchena J, Jin WL, Vanderhaeghen P, Ghosh A, Sassa T, Polleux F (květen 2012). „Inhibice funkce SRGAP2 jeho lidsky specifickými paralogy vyvolává neotenii během zrání páteře“. Buňka. 149 (4): 923–35. doi:10.1016 / j.cell.2012.03.034. PMC  3357949. PMID  22559944.
  9. ^ Tiwary, BK (2016). „Vývoj genu SRGAP2 souvisí s inteligencí u savců“. Centrum biomedicíny. Karger. 1 (1). doi:10.1159/000443947.
  10. ^ A b Chang, Hsin-Yu. „Co je lidoop“. Blog InterPro. Citováno 27. března 2019.
  11. ^ Sudmant PH, Kitzman JO, Antonacci F, Alkan C, Malig M, Tsalenko A, Sampas N, Bruhn L, Shendure J, Eichler EE (říjen 2010). „Rozmanitost variací počtu lidských kopií a genů s více kopiemi“. Věda. 330 (6004): 641–6. Bibcode:2010Sci ... 330..641S. doi:10.1126 / science.1197005. PMC  3020103. PMID  21030649.
  12. ^ Martins, Pedro Tiago; Marí, Maties; Boeckx, Cedric (01.01.2018). „SRGAP2 a postupný vývoj moderní fakulty lidského jazyka“. Journal of Language Evolution. 3 (1): 67–78. doi:10.1093 / jole / lzx020. ISSN  2058-4571.
  13. ^ A b Sporny, M; Guez-Haddad, J; Kreusch, A; Shakartzi, S; Nezňanský, A; Kříž, A; Isupov, MN; Qualmann, B; Kessels, MM; Opatowsky, Y (1. června 2017). "Strukturální historie lidských proteinů SRGAP2". Molekulární biologie a evoluce. 34 (6): 1463–1478. doi:10,1093 / molbev / msx094. PMC  5435084. PMID  28333212.
  14. ^ Dennis MY, Nuttle X, Sudmant PH, Antonacci F, Graves TA, Nefedov M, Rosenfeld JA, Sajjadian S, Malig M, Kotkiewicz H, Curry CJ, Shafer S, Shaffer LG, de Jong PJ, Wilson RK, Eichler EE (květen 2012). "Vývoj lidských specifických neurálních genů SRGAP2 neúplnou segmentovou duplikací". Buňka. 149 (4): 912–22. doi:10.1016 / j.cell.2012.03.033. PMC  3365555. PMID  22559943. Shrnutí ležel – sciencenews.org.

externí odkazy