SPOCK1 - SPOCK1 - Wikipedia

SPOCK1
Identifikátory
Aliasy	SPOCK1, SPOCK, TESTICAN, TIC1, sparc / osteonectin, cwcv a kazalem podobné domény proteoglykan (testikan) 1, SPARC / osteonectin, cwcv a kazal jako domény proteoglycan 1, SPARC (osteonectin), cwcv a kazal podobné domény proteoglycan 1
Externí ID	OMIM: 602264 MGI: 105371 HomoloGene: 80193 Genové karty: SPOCK1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	137,598,379 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	57,908,332 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • aktivita inhibitoru endopeptidázy cysteinového typu; • aktivita inhibitoru metaloendopeptidázy; • aktivita inhibitoru endopeptidázy serinového typu; • vazba kolagenu; • vazba extracelulární matrice;
Buněčná složka	• cytoplazma; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • neuromuskulární spojení; • uzel Ranvier; • extracelulární oblast; • sarkoplazma; • extracelulární;
Biologický proces	• negativní regulace adheze buněk k substrátu; • neurogeneze; • negativní regulace vývoje projekce neuronů; • migrace neuronů; • vývoj nervového systému; • buněčná adheze; • regulace buněčného růstu; • diferenciace neuronů centrálního nervového systému; • signální transdukce; • negativní regulace aktivity endopeptidázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6695
	20745
	ENSG00000152377
	ENSMUSG00000056222
	Q08629
	Q62288
	NM_004598
	NM_001166463; NM_001166464; NM_001166465; NM_001166466; NM_009262
	NP_004589
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Testican-1 je protein že u lidí je kódován SPOCK1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje proteinové jádro semenné plazmy proteoglykan obsahující chondroitin- a heparan-sulfátové řetězce. Funkce proteinu je předmětem výzkumu, přestože pochází ze stejné rodiny glykoproteinů jako SPARC. Předpokládá se jeho podobnost s cysteinem typu tyropinu inhibitory proteázy naznačuje, že jeho funkce může souviset s inhibicí proteázy.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000152377 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056222 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Charbonnier F, Perin JP, Mattei MG, Camuzat A, Bonnet F, Gressin L, Alliel PM (červen 1998). "Genomická organizace lidského genu SPOCK a jeho chromozomální lokalizace na 5q31". Genomika. 48 (3): 377–80. doi:10.1006 / geno.1997.5199. PMID 9545645.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SPOCK1 sparc / osteonektin, cwcv a kazal-like domény proteoglykan (testikan) 1".

Další čtení

Périn JP, Alliel PM, Jollès P, Bonnet F (1994). "Proteoglykany v mužském reprodukčním traktu". EXS. 70: 191–7. doi:10.1007/978-3-0348-7545-5_11. ISBN 978-3-0348-7547-9. PMID 7507743.
Charbonnier F, Périn JP, Roussel G a kol. (1997). "[Klonování testikanu / SPOCKu u člověka a myši. Perspektivy neuromuskulární exprese v patologii]". C. R. Séances Soc. Biol. Fil. 191 (1): 127–33. PMID 9181134.
Alliel PM, Perin JP, Jollès P, Bonnet FJ (1993). „Testican, multidoménový testikulární proteoglykan připomínající modulátory sociálního chování buněk“. Eur. J. Biochem. 214 (1): 347–50. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17930.x. PMID 8389704.
Bonnet F, Périn JP, Charbonnier F a kol. (1996). „Struktura a buněčná distribuce testikátu myšího mozku. Sdružení s postsynaptickou oblastí pyramidových buněk hipokampu“. J. Biol. Chem. 271 (8): 4373–80. doi:10.1074 / jbc.271.8.4373. PMID 8626787.
Marr HS, Basalamah MA, Edgell CJ (1998). "Exprese endoteliálních buněk testikánské mRNA". Endotel. 5 (3): 209–19. doi:10.3109/10623329709053399. PMID 9272383.
Kohfeldt E, Maurer P, Vannahme C, Timpl R (1997). "Vlastnosti extracelulárního modulu vázajícího vápník proteoglykanového testikanu". FEBS Lett. 414 (3): 557–61. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 01070-3. PMID 9323035. S2CID 25552375.
Marr HS, Basalamah MA, Bouldin TW a kol. (2001). "Distribuce exprese varlat v lidském mozku". Cell Tissue Res. 302 (2): 139–44. doi:10,1007 / s004410000277. PMID 11131125. S2CID 9937680.
BaSalamah MA, Marr HS, Duncan AW, Edgell CJ (2001). "Testikan v lidské krvi". Biochem. Biophys. Res. Commun. 283 (5): 1083–90. doi:10.1006 / bbrc.2001.4900. PMID 11355883.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nakada M, Miyamori H, Yamashita J, Sato H (2003). „Testican 2 ruší inhibici matrixových metaloproteináz typu membrány jinými proteiny rodiny testikanu“. Cancer Res. 63 (12): 3364–9. PMID 12810672.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Schmutz J, Martin J, Terry A a kol. (2004). „Sekvence DNA a srovnávací analýza lidského chromozomu 5“. Příroda. 431 (7006): 268–74. doi:10.1038 / nature02919. PMID 15372022.
Prenzel KL, Warnecke-Eberz U, Xi H a kol. (2006). „Významná nadměrná exprese mRNA SPARC / osteonektin u rakoviny pankreatu ve srovnání s rakovinou Vaterovy papily“. Oncol. Rep. 15 (5): 1397–401. doi:10.3892 / nebo 15.5.1397. PMID 16596217.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000152377 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056222 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9545645-5] Charbonnier F, Perin JP, Mattei MG, Camuzat A, Bonnet F, Gressin L, Alliel PM (červen 1998). "Genomická organizace lidského genu SPOCK a jeho chromozomální lokalizace na 5q31". Genomika. 48 (3): 377–80. doi:10.1006 / geno.1997.5199. PMID 9545645.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: SPOCK1 sparc / osteonektin, cwcv a kazal-like domény proteoglykan (testikan) 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]