SMARCD1 - SMARCD1
SWI / SNF související s aktinem závislý regulátor závislý na aktinu chromatinové podrodiny D člen 1 je protein že u lidí je kódován SMARCD1 gen.[5][6][7][8]
Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů SWI / SNF, jejíž členové vykazují aktivity helikázy a ATPázy a předpokládá se, že regulují transkripci určitých genů změnou struktury chromatinu kolem těchto genů. Kódovaný protein je součástí velkého ATP-závislého komplexu remodelace chromatinu SNF / SWI a má sekvenční podobnost s kvasinkovým proteinem Swp73. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.[8]
Interakce
SMARCD1 bylo prokázáno komunikovat s Glukokortikoidový receptor.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000066117 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023018 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Wang W, Xue Y, Zhou S, Kuo A, Cairns BR, Crabtree GR (listopad 1996). „Rozmanitost a specializace savčích komplexů SWI / SNF“. Genes Dev. 10 (17): 2117–30. doi:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID 8804307.
- ^ Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Wang W, Crabtree GR, Francke U (září 1998). „V lidském genomu je rozptýleno pět SWI / SNF, matricově spojený, na aktinu závislý regulátor chromatinových (SMARC) genů.“ Genomika. 51 (1): 140–3. doi:10.1006 / geno.1998.5343. PMID 9693044.
- ^ A b Hsiao PW, Fryer CJ, Trotter KW, Wang W, Archer TK (srpen 2003). „BAF60a zprostředkovává kritické interakce mezi jadernými receptory a komplexem remodelace chromatinu BRG1 pro transaktivaci“. Mol Cell Biol. 23 (17): 6210–20. doi:10.1128 / MCB.23.17.6210-6220.2003. PMC 180928. PMID 12917342.
- ^ A b „Entrez Gene: SMARCD1 SWI / SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 1".
Další čtení
- Hillier LD, Lennon G, Becker M a kol. (1997). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
- Wang W, Côté J, Xue Y a kol. (1996). „Čištění a biochemická heterogenita savčího komplexu SWI-SNF“. EMBO J.. 15 (19): 5370–82. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.
- Cho H, Orphanides G, Sun X a kol. (1998). „Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které modifikují strukturu chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5355–63. doi:10.1128 / MCB.18.9.5355. PMC 109120. PMID 9710619.
- O'Neill D, Yang J, Erdjument-Bromage H a kol. (1999). "Tkáňově specifická a vývojově specifická vazba DNA vazbou na savčí komplex SWI / SNF spojený s přepínáním globálního genu lidského plodu na dospělého". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (2): 349–54. doi:10.1073 / pnas.96.2.349. PMC 15139. PMID 9892636.
- Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). "Rekonstituce komplexu remodelace jádra chromatinu z podjednotek SWI / SNF". Mol. Buňka. 3 (2): 247–53. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80315-9. PMID 10078207.
- Ito T, Yamauchi M, Nishina M a kol. (2001). „Identifikace komplexní podjednotky SWI.SNF BAF60a jako determinantu transaktivačního potenciálu dimerů Fos / Jun“. J. Biol. Chem. 276 (4): 2852–7. doi:10,1074 / jbc.M009633200. PMID 11053448.
- Xue Y, Canman JC, Lee CS a kol. (2001). „Komplex lidské remodelace SWI / SNF-B chromatinu souvisí s kvasinkami rsc a lokalizuje se na kinetochorech mitotických chromozomů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (24): 13015–20. doi:10.1073 / pnas.240208597. PMC 27170. PMID 11078522.
- Kato H, Tjernberg A, Zhang W a kol. (2002). „SYT se asociuje s lidskými komplexy SNF / SWI a C-koncová oblast svého fúzního partnera SSX1 cílí na histony“. J. Biol. Chem. 277 (7): 5498–505. doi:10,1074 / jbc.M108702200. PMID 11734557.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Nie Z, Yan Z, Chen EH a kol. (2003). „Nové komplexy pro remodelaci chromatinu SWI / SNF obsahují chromozomálního translokačního partnera se smíšenou linií leukémie“. Mol. Buňka. Biol. 23 (8): 2942–52. doi:10.1128 / MCB.23.8.2942-2952.2003. PMC 152562. PMID 12665591.
- Chien CY, Liu WK, Chou CK, Su JY (2003). "A20-vazebný protein ABIN-2 vykonává neočekávanou funkci při zprostředkování transkripční koaktivace". FEBS Lett. 543 (1–3): 55–60. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00401-0. PMID 12753905. S2CID 31400521.
- Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K a kol. (2003). „Komplex WINAC remodelační komplex WINAC se zaměřuje na jaderný receptor na promotory a je narušen Williamsovým syndromem“. Buňka. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Assmann EM, Alborghetti MR, Camargo ME, Kobarg J (2006). „Dimerizace FEZ1 a interakce s regulačními proteiny transkripce zahrnuje oblast coiled-coil“. J. Biol. Chem. 281 (15): 9869–81. doi:10,1074 / jbc.M513280200. PMID 16484223.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |