SLIT2 - SLIT2

SLIT2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2V70, 2V9S, 2V9T, 2WFH
Identifikátory
Aliasy	SLIT2SLIL3, Slit-2, ligand pro vedení štěrbiny 2
Externí ID	OMIM: 603746 MGI: 1315205 HomoloGene: 3516 Genové karty: SLIT2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	20,620,561 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	48,307,733 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba na heparin; • aktivita homodimerizace proteinu; • Aktivita inhibitoru GTPázy; • vazba laminin-1; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • Vazba kruhového objezdu; • vazba proteoglykanů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána; • extracelulární oblast; • povrch buňky; • extracelulární exosom; • buněčná membrána; • extracelulární;
Biologický proces	• negativní regulace fosforylace bílkovin; • negativní regulace chemokinem zprostředkované signální dráhy; • negativní regulace chemotaxe neutrofilů; • negativní regulace buněčné reakce na stimul růstového faktoru; • chemorepulze účastnící se migrace prekurzoru embryonálního čichového bulbu interneuronu; • diferenciace buněk; • vývoj močovodového pupenu; • negativní chemotaxe; • negativní regulace polymerace aktinových vláken; • negativní regulace transdukce signálu zprostředkovaného malými GTPázami; • negativní regulace vedení axonů gangliových buněk sítnice; • negativní regulace migrace mononukleárních buněk; • vedení kortikospinálního neuronu axonem přes míchu; • negativní regulace migrace buněk hladkého svalstva; • Kruhový objezd signální cesta; • pozitivní regulace axonogeneze; • vývoj nervového systému; • buněčná migrace zapojená do klíčení angiogeneze; • negativní regulace migrace endoteliálních buněk; • axonové vedení; • vývoj mnohobuněčných organismů; • chemotaxe; • negativní regulace chemotaxe buněk hladkého svalstva; • buněčná odpověď na hormonální stimul; • negativní regulace buněčné migrace; • negativní regulace chemotaxe monocytů; • negativní regulace buněčného růstu; • reakce na kortizol; • apoptotický proces zapojený do luteolýzy; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • indukce negativní chemotaxe; • buněčná odpověď na heparin; • vedení motorických neuronů axonem; • rozvětvená morfogeneze epiteliální trubice; • negativní regulace chemotaxe leukocytů; • chemorepulze podílející se na postnatální čichové bulbové migraci interneuronu; • prodloužení axonu zapojené do vedení axonu; • negativní regulace sestavy lamellipodia; • negativní regulace vaskulární permeability; • vedení axonů gangliových buněk sítnice; • GO: 0034259 negativní regulace aktivity GTPázy; • morfogeneze aortální chlopně; • morfogeneze plicní chlopně; • morfogeneze komorového septa;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9353
	20563
	ENSG00000145147
	ENSMUSG00000031558
	O94813
	Q9R1B9
	NM_001289135; NM_001289136; NM_004787
	NM_001291227; NM_001291228; NM_178804
	NP_001276064; NP_001276065; NP_004778
	NP_001278156; NP_001278157; NP_848919
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Štěrbinový homolog 2 protein je protein že u lidí je kódován SLIT2 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

SLIT2 bylo prokázáno komunikovat s Glypican 1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145147 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031558 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Itoh A; Miyabayashi T; Ohno M; Sakano S (únor 1999). „Klonování a exprese tří savčích homologů štěrbiny Drosophila naznačují možné role Slita při tvorbě a udržování nervového systému“. Brain Res Mol Brain Res. 62 (2): 175–86. doi:10.1016 / S0169-328X (98) 00224-1. PMID 9813312.
^ Chedotal A (únor 2008). "Štěrbiny a jejich receptory". Adv Exp Med Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 621: 65–80. doi:10.1007/978-0-387-76715-4_5. ISBN 978-0-387-76714-7. PMID 18269211.
^ „Entrez Gene: SLIT2 slit homolog 2 (Drosophila)“.
^ Ronca, F; Andersen JS; Paech V; Margolis R U (srpen 2001). "Charakterizace interakcí štěrbinového proteinu s glypican-1". J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (31): 29141–7. doi:10,1074 / jbc.M100240200. ISSN 0021-9258. PMID 11375980.

Další čtení

Wong K; Park HT; Wu JY; Rao Y (2003). "Štěrbinové proteiny: molekulární naváděcí podněty pro buňky od neuronů po leukocyty". Curr. Opin. Genet. Dev. 12 (5): 583–91. doi:10.1016 / S0959-437X (02) 00343-X. PMID 12200164.
Zhao XC; Zhang LM; Li Q; Tong DY; Ventilátor LC; P; Wu XY; Chen WM; Zhao P; Wang J. (2013). „Isofluranová následná úprava chrání primární kultury kortikálních neuronů před poškozením deprivací kyslíkem a glukózou prostřednictvím upregulace Slit2 / Robo1“. Brain Res. 1537: 283–9. doi:10.1016 / j.brainres.2013.08.036. PMC 3820100. PMID 23994690.
Wang KH, Brose K, Arnott D a kol. (1999). "Biochemické čištění savčího štěpného proteinu jako pozitivního regulátoru prodloužení a rozvětvení senzorických axonů". Buňka. 96 (6): 771–84. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80588-7. PMID 10102266. S2CID 16810644.
Brose K, Bland KS, Wang KH a kol. (1999). „Štěrbinové proteiny váží receptory Robo a mají evolučně konzervativní roli v odpudivém vedení axonů“. Buňka. 96 (6): 795–806. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80590-5. PMID 10102268. S2CID 16301178.
Li HS, Chen JH, Wu W a kol. (1999). „Štěrbina obratlovců, vylučovaný ligand pro kruhový objezd transmembránových proteinů, je repelentem pro axony čichové cibulky“. Buňka. 96 (6): 807–18. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80591-7. PMID 10102269.
Nguyen Ba-Charvet KT, Brose K, Marillat V, et al. (1999). „Chemorepulze zprostředkovaná Slit2 a kolaps vyvíjejících se axonů předního mozku“. Neuron. 22 (3): 463–73. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80702-3. PMID 10197527. S2CID 18663762.
Holmes GP, Negus K, Burridge L a kol. (1999). „Výrazné, ale překrývající se vzorce exprese dvou homologů štěrbiny obratlovců implikují funkční role ve vývoji CNS a organogenezi“. Mech. Dev. 79 (1–2): 57–72. doi:10.1016 / S0925-4773 (98) 00174-9. PMID 10349621. S2CID 6057216.
Liang Y, Annan RS, Carr SA a kol. (1999). "Savčí homology štěpného proteinu Drosophila jsou ligandy heparansulfátového proteoglykanu glypikanu-1 v mozku". J. Biol. Chem. 274 (25): 17885–92. doi:10.1074 / jbc.274.25.17885. PMID 10364234.
Wu W, Wong K, Chen J a kol. (1999). „Směrové vedení neuronální migrace v čichovém systému pomocí proteinu Slit“. Příroda. 400 (6742): 331–6. Bibcode:1999 Natur.400..331W. doi:10.1038/22477. PMC 2041931. PMID 10432110.
Georgas K, Burridge L, Smith K a kol. (2000). "Přiřazení lidského štěrbinového homologu SLIT2 k pásu lidského chromozomu 4p15.2". Cytogenet. Cell Genet. 86 (3–4): 246–7. doi:10.1159/000015351. PMID 10575218. S2CID 6028258.
Niclou SP; Jia L; Raper JA (2000). „Slit2 je repelent pro axony gangliových buněk sítnice“. J. Neurosci. 20 (13): 4962–74. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-13-04962.2000. PMC 6772294. PMID 10864954.
Zou Y; Stoeckli E; Chen H; Tessier-Lavigne M (2000). „Vytlačování axonů ze šedé hmoty: role štěrbinových a semaforinových proteinů ze střední linie a ventrální míchy“ (PDF). Buňka. 102 (3): 363–75. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00041-6. PMID 10975526. S2CID 14174593.
Chen JH, Wen L, Dupuis S a kol. (2001). „N-terminální oblasti bohaté na leucin ve Slitu jsou dostatečné k odpuzování čichových axonů bulbu a neuronů subventrikulární zóny“. J. Neurosci. 21 (5): 1548–56. doi:10.1523 / JNEUROSCI.21-05-01548.2001. PMC 6762944. PMID 11222645.
Stein E; Tessier-Lavigne M (2001). „Hierarchická organizace naváděcích receptorů: umlčení přitažlivosti netrinu štěpením prostřednictvím komplexu receptorů Robo / DCC“. Věda. 291 (5510): 1928–38. Bibcode:2001Sci ... 291.1928S. doi:10.1126 / science.1058445. PMID 11239147. S2CID 24626940.
Wu JY, Feng L, Park HT a kol. (2001). „Neuronový repelent Slit inhibuje chemotaxi leukocytů indukovanou chemotaktickými faktory“. Příroda. 410 (6831): 948–52. doi:10.1038/35073616. PMC 2072862. PMID 11309622.
Ronca F; Andersen JS; Paech V; Margolis RU (2001). "Charakterizace interakcí štěrbinového proteinu s glypican-1". J. Biol. Chem. 276 (31): 29141–7. doi:10,1074 / jbc.M100240200. PMID 11375980.
Nguyen Ba-Charvet KT, Brose K, Ma L a kol. (2001). „Rozmanitost a specifičnost působení proteolytických fragmentů Slit2 v axonovém vedení“. J. Neurosci. 21 (12): 4281–9. doi:10.1523 / JNEUROSCI.21-12-04281.2001. PMC 6762758. PMID 11404413.
Little M, Rumballe B, Georgas K a kol. (2003). "Zachována modularita a potenciál pro alternativní sestřih v myších a lidských genech Slit". Int. J. Dev. Biol. 46 (4): 385–91. PMID 12141424.
Dallol A, Da Silva NF, Viacava P a kol. (2002). „SLIT2, lidský homolog genu Drosophila Slit2, má tumor potlačující aktivitu a je často inaktivován při rakovině plic a prsu“. Cancer Res. 62 (20): 5874–80. PMID 12384551.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145147 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031558 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9813312-5] Itoh A; Miyabayashi T; Ohno M; Sakano S (únor 1999). „Klonování a exprese tří savčích homologů štěrbiny Drosophila naznačují možné role Slita při tvorbě a udržování nervového systému“. Brain Res Mol Brain Res. 62 (2): 175–86. doi:10.1016 / S0169-328X (98) 00224-1. PMID 9813312.

[pmid18269211-6] Chedotal A (únor 2008). "Štěrbiny a jejich receptory". Adv Exp Med Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 621: 65–80. doi:10.1007/978-0-387-76715-4_5. ISBN 978-0-387-76714-7. PMID 18269211.

[entrez-7] „Entrez Gene: SLIT2 slit homolog 2 (Drosophila)“.

[pmid11375980-8] Ronca, F; Andersen JS; Paech V; Margolis R U (srpen 2001). "Charakterizace interakcí štěrbinového proteinu s glypican-1". J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (31): 29141–7. doi:10,1074 / jbc.M100240200. ISSN 0021-9258. PMID 11375980.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]