Glypican 1 - Glypican 1

GPC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4ACR, 4AD7, 4BWE, 4YWT
Identifikátory
Aliasy	GPC1, glypican, glypican 1
Externí ID	OMIM: 600395 MGI: 1194891 HomoloGene: 20477 Genové karty: GPC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	240,468,076 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	92,860,779 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba fibroblastového růstového faktoru; • vazba proteoglykanu heparan sulfát; • vazba iontů mědi; • lamininová vazba;
Buněčná složka	• endozom; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • lysozomální lumen; • Golgiho lumen; • membránový vor; • ukotvená součást membrány; • extracelulární exosom; • extracelulární; • nukleoplazma; • cytosol; • buněčná membrána; • extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • vnitřní složka plazmatické membrány; • synapse; • ukotvená součást plazmatické membrány; • extracelulární matrix obsahující kolagen; • povrch buňky;
Biologický proces	• metabolický proces glykosaminoglykanu; • myelinová sestava; • heparan sulfát proteoglykan katabolický proces; • metabolický proces retinoidů; • axonové vedení; • negativní regulace signální dráhy receptoru fibroblastového růstového faktoru; • pozitivní regulace diferenciace buněk kosterního svalstva; • glykosaminoglykan katabolický proces; • proces biosyntézy glykosaminoglykanu; • Diferenciace Schwannových buněk; • migrace leukocytů; • regulace přenosu signálu; • migrace buněk; • regulace lokalizace proteinu na membránu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2817
	14733
	ENSG00000063660
	ENSMUSG00000034220
	P35052
	Q9QZF2
	NM_002081
	NM_016696
	NP_002072
	NP_057905
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Glypican-1 je protein že u lidí je kódován GPC1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Buněčný povrch heparan sulfát proteoglykany jsou složeny z membránového proteinového jádra substituovaného proměnným počtem heparan sulfátových řetězců. Členové glypican příbuzná integrální membránová proteoglykanová rodina (GRIPS) obsahuje jádrový protein ukotven k cytoplazmatické membráně prostřednictvím glykosylfosfatidylinositol vazba. Tyto proteiny mohou hrát roli v řízení buněčného dělení a regulace růstu.^[6]

Interakce

Glypican 1 bylo prokázáno komunikovat s SLIT2.^[7]

Klinický význam

Tento protein se podílí na nesprávném skládání normálu prion proteiny v buněčné membráně do infekční prionové formy.^[8]

V roce 2015 bylo oznámeno, že přítomnost tohoto proteinu v exosomy v krvi pacientů je schopen detekovat brzy rakovina slinivky s absolutní specificitou a citlivostí.^[9] Tento závěr je však sporný.^[10] a v novějších přehledech potenciálních markerů pro rakovinu pankreatu není Glypican 1 zmíněn.^[11]^[12]

Viz také

Glypican

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063660 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034220 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Vermeesch JR, Mertens G, David G, Marynen P (červenec 1995). „Přiřazení lidského glypikanového genu (GPC1) k 2q35-q37 pomocí fluorescenční in situ hybridizace“. Genomika. 25 (1): 327–9. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80152-C. PMID 7774946.
^ ^A ^b „Entrez Gene: GPC1 glypican 1“.
^ Ronca F, Andersen JS, Paech V, Margolis RU (srpen 2001). "Charakterizace interakcí štěrbinového proteinu s glypican-1". J. Biol. Chem. 276 (31): 29141–7. doi:10,1074 / jbc.M100240200. PMID 11375980.
^ Taylor DR, Whitehouse IJ, Hooper NM (listopad 2009). „Glypican-1 zprostředkovává asociaci prionového proteinu s lipidy a tvorbu izoformy choroby“. PLOS patogeny. 5 (11): e1000666. doi:10.1371 / journal.ppat.1000666. PMC 2773931. PMID 19936054.
^ Melo SA, Luecke LB, Kahlert C, Fernandez AF, Gammon ST, Kaye J, LeBleu VS, Mittendorf EA, Weitz J, Rahbari N, Reissfelder C, Pilarsky C, Fraga MF, Piwnica-Worms D, Kalluri R (červenec 2015) . „Glypican-1 identifikuje exosomy rakoviny a detekuje časnou rakovinu pankreatu“. Příroda. 523 (7559): 177–82. doi:10.1038 / příroda14581. PMC 4825698. PMID 26106858.
^ Diskuse na www.pubpeer.com; https://pubpeer.com/publications/70714D8ACB8F13164A2752B4335F38#fb119888
^ Balasenthil S, Huang Y, Liu S, Marsh T, Chen J, Stass SA, KuKuruga D, Brand R, Chen N, Frazier ML, Jack Lee J, Srivastava S, Sen S, McNeill Killary A (srpen 2017). „Panel plazmových biomarkerů k identifikaci chirurgicky resekovatelného karcinomu pankreatu v raném stadiu“. Journal of the National Cancer Institute. 109 (8). doi:10.1093 / jnci / djw341. PMC 6059209. PMID 28376184.
^ Chang JC, Kundranda M (březen 2017). „Nové diagnostické a prediktivní biomarkery u adenokarcinomu pankreatu“. International Journal of Molecular Sciences. 18 (3): 667. doi:10,3390 / ijms18030667. PMC 5372679. PMID 28335509.

Další čtení

Karthikeyan L; Maurel P; Rauch U; et al. (1992). "Klonování hlavního heparan sulfátového proteoglykanu z mozku a identifikace jako krysí forma glypikanu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 188 (1): 395–401. doi:10.1016 / 0006-291X (92) 92398-H. PMID 1417860.
David G; Lories V; Decock B; et al. (1991). "Molekulární klonování fosfatidylinositolem kotvené membrány heparan sulfát proteoglykanu z lidských plicních fibroblastů". J. Cell Biol. 111 (6 Pt 2): 3165–76. doi:10.1083 / jcb.111.6.3165. PMC 2116352. PMID 2148568.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Marujama K; et al. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kleeff J; Ishiwata T; Kumbasar A; et al. (1998). „Proteoglykan glypican-1 heparansulfát na povrchu buněk reguluje působení růstového faktoru v buňkách karcinomu pankreatu a je nadměrně exprimován u lidské rakoviny pankreatu“. J. Clin. Investovat. 102 (9): 1662–73. doi:10,1172 / JCI4105. PMC 509114. PMID 9802880.
Gengrinovitch S; Berman B; David G; et al. (1999). „Glypican-1 je VEGF165 vázající proteoglykan, který působí jako extracelulární chaperon pro VEGF165“. J. Biol. Chem. 274 (16): 10816–22. doi:10.1074 / jbc.274.16.10816. PMID 10196157.
Liang Y; Annan RS; Carr SA; et al. (1999). "Savčí homology štěpného proteinu Drosophila jsou ligandy heparansulfátového proteoglykanu glypikanu-1 v mozku". J. Biol. Chem. 274 (25): 17885–92. doi:10.1074 / jbc.274.25.17885. PMID 10364234.
Schofield KP, Gallagher JT, David G (2000). "Exprese proteinů proteoglykanového jádra ve stromě lidské kostní dřeně". Biochem. J. 343 Pt 3 (3): 663–8. doi:10.1042/0264-6021:3430663. PMC 1220599. PMID 10527946.
Karumanchi SA; Jha V; Ramchandran R; et al. (2001). „Buněčné povrchové glypikany jsou receptory endostatinu s nízkou afinitou“ (PDF). Mol. Buňka. 7 (4): 811–22. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00225-8. PMID 11336704.
Matsuda K; Marujama H; Guo F; et al. (2001). „Glypican-1 je v lidské rakovině prsu nadměrně exprimován a moduluje mitogenní účinky více růstových faktorů vázajících heparin v buňkách rakoviny prsu.“ Cancer Res. 61 (14): 5562–9. PMID 11454708.
Alvarez K, Fadic R, Brandan E (2002). „Rozšířená syntéza a diferenciální lokalizace heparansulfátových proteoglykanů u Duchennovy svalové dystrofie“. J. Cell. Biochem. 85 (4): 703–13. doi:10.1002 / jcb.10184. PMID 11968010. S2CID 20243469.
Ding K; Mani K; Cheng F; et al. (2002). „Na mědi závislé autoléčba glypican-1 heparansulfátu oxidem dusnatým odvozeným od vnitřních nitrosothiolů“. J. Biol. Chem. 277 (36): 33353–60. doi:10,1074 / jbc.M203383200. PMID 12084716.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Řemen M; Mani K; Jönsson M; et al. (2004). „Glypican-1 je nosičem absorpce polyaminu v buňkách savců: klíčová role oxidu dusnatého odvozeného od nitrosothiolu“. J. Biol. Chem. 278 (47): 47181–9. doi:10,1074 / jbc.M308325200. PMID 12972423.
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Watanabe N; Araki W; Chui DH; et al. (2004). „Glypican-1 jako Abeta vázající HSPG v lidském mozku: jeho lokalizace v doménách DIG a možné role v patogenezi Alzheimerovy choroby“. FASEB J.. 18 (9): 1013–5. doi:10.1096 / fj.03-1040fje. PMID 15084524. S2CID 83560098.
Li J; Kleeff J; Kayed H; et al. (2004). „Glypican-1 antisense transfekce moduluje signalizaci závislou na TGF-beta v buňkách rakoviny pankreatu Colo-357“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 320 (4): 1148–55. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.063. PMID 15249209.
Davies EJ; Blackhall FH; Shanks JH; et al. (2005). „Distribuce a klinický význam heparansulfátových proteoglykanů u rakoviny vaječníků“. Clin. Cancer Res. 10 (15): 5178–86. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0103. PMID 15297422.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063660 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034220 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7774946-5] Vermeesch JR, Mertens G, David G, Marynen P (červenec 1995). „Přiřazení lidského glypikanového genu (GPC1) k 2q35-q37 pomocí fluorescenční in situ hybridizace“. Genomika. 25 (1): 327–9. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80152-C. PMID 7774946.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: GPC1 glypican 1“.

[pmid11375980-7] Ronca F, Andersen JS, Paech V, Margolis RU (srpen 2001). "Charakterizace interakcí štěrbinového proteinu s glypican-1". J. Biol. Chem. 276 (31): 29141–7. doi:10,1074 / jbc.M100240200. PMID 11375980.

[Taylor_2009-8] Taylor DR, Whitehouse IJ, Hooper NM (listopad 2009). „Glypican-1 zprostředkovává asociaci prionového proteinu s lipidy a tvorbu izoformy choroby“. PLOS patogeny. 5 (11): e1000666. doi:10.1371 / journal.ppat.1000666. PMC 2773931. PMID 19936054.

[Melo_2015-9] Melo SA, Luecke LB, Kahlert C, Fernandez AF, Gammon ST, Kaye J, LeBleu VS, Mittendorf EA, Weitz J, Rahbari N, Reissfelder C, Pilarsky C, Fraga MF, Piwnica-Worms D, Kalluri R (červenec 2015) . „Glypican-1 identifikuje exosomy rakoviny a detekuje časnou rakovinu pankreatu“. Příroda. 523 (7559): 177–82. doi:10.1038 / příroda14581. PMC 4825698. PMID 26106858.

[10] Diskuse na www.pubpeer.com; https://pubpeer.com/publications/70714D8ACB8F13164A2752B4335F38#fb119888

[pmid28376184-11] Balasenthil S, Huang Y, Liu S, Marsh T, Chen J, Stass SA, KuKuruga D, Brand R, Chen N, Frazier ML, Jack Lee J, Srivastava S, Sen S, McNeill Killary A (srpen 2017). „Panel plazmových biomarkerů k identifikaci chirurgicky resekovatelného karcinomu pankreatu v raném stadiu“. Journal of the National Cancer Institute. 109 (8). doi:10.1093 / jnci / djw341. PMC 6059209. PMID 28376184.

[pmid28335509-12] Chang JC, Kundranda M (březen 2017). „Nové diagnostické a prediktivní biomarkery u adenokarcinomu pankreatu“. International Journal of Molecular Sciences. 18 (3): 667. doi:10,3390 / ijms18030667. PMC 5372679. PMID 28335509.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]