SH3RF1 - SH3RF1

SH3RF1
Identifikátory
Aliasy	SH3RF1, POSH, RNF142, SH3MD2, SH3 doména obsahující prsten 1
Externí ID	MGI: 1913066 HomoloGene: 10988 Genové karty: SH3RF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	169,270,956 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	61,396,071 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy; • Aktivita lešení MAP-kinázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perinukleární oblast cytoplazmy; • cytosol; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • lamellipodium;
Biologický proces	• negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • negativní regulace apoptotického procesu; • regulace JNK kaskády; • ubikvitinace bílkovin; • apoptotický proces; • migrace neuronů; • aktivace aktivity JUN kinázy; • regulace diferenciace CD4-pozitivních alfa-beta T buněk; • autoubiquitination bílkovin; • regulace proliferace CD-pozitivních alfa-beta T buněk; • pozitivní regulace JNK kaskády;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57630
	59009
	ENSG00000154447
	ENSMUSG00000031642
	Q7Z6J0
	Q69ZI1
	NM_020870
	NM_021506; NM_198678
	NP_065921
	NP_067481
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Předpokládaná E3 ubikvitin-protein ligáza SH3RF1 je enzym že u lidí je kódován SH3RF1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje protein obsahující prsten N-konce RING, čtyři domény SH3 a oblast zapojenou do vazby Rho GTPázy Rac. Prostřednictvím prstence RING bylo prokázáno, že kódovaný protein funguje jako ubikvitin-proteinová ligáza zapojená do třídění proteinů v trans-Golgiho síti. Kódovaný protein může také působit jako kostra pro signální dráhu c-Jun N-terminální kinázy, což usnadňuje vytvoření funkčního signalizačního modulu.^[6]

Interakce

SH3RF1 bylo prokázáno komunikovat s AKT2^[7] a MAP3K11.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154447 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031642 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tapon N, Nagata K, Lamarche N, hala A (duben 1998). „Nový racový cíl POSH je protein lešení obsahující SH3 zapojený do signálních drah JNK a NF-kappaB“. EMBO J.. 17 (5): 1395–404. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1395. PMC 1170487. PMID 9482736.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SH3RF1 SH3 doména obsahující prsteníček 1“.
^ ^A ^b Figueroa C, Tarras S, Taylor J, Vojtek AB (listopad 2003). „Akt2 negativně reguluje montáž signalizačního komplexu POSH-MLK-JNK“. J. Biol. Chem. 278 (48): 47922–7. doi:10,1074 / jbc.M307357200. PMID 14504284.

Další čtení

Lyons TR, Thorburn J, Ryan PW, Thorburn A, Anderson SM, Kassenbrock CK (2007). „Regulace proteinu pro-apoptotického lešení POSH Aktem“. J. Biol. Chem. 282 (30): 21987–97. doi:10,1074 / jbc.M704321200. PMID 17535800.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Alroy I, Tuvia S, Greener T, Gordon D, Barr HM, Taglicht D, Mandil-Levin R, Ben-Avraham D, Konforty D, Nir A, Levius O, Bicoviski V, Dori M, Cohen S, Yaar L, Erez O, Propheta-Meiran O, Koskas M, Caspi-Bachar E, Alchanati I, Sela-Brown A, Moskowitz H, Tessmer U, Schubert U, Reiss Y (2005). „Trans-Golgiho síťová lidská ubikvitin-protein ligáza POSH je nezbytná pro produkci HIV typu 1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (5): 1478–83. doi:10.1073 / pnas.0408717102. PMC 545085. PMID 15659549.
Figueroa C, Tarras S, Taylor J, Vojtek AB (2003). „Akt2 negativně reguluje montáž signalizačního komplexu POSH-MLK-JNK“. J. Biol. Chem. 278 (48): 47922–7. doi:10,1074 / jbc.M307357200. PMID 14504284.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa K, Hirosawa M, Ohara O (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (2): 143–50. doi:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID 10819331.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154447 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031642 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9482736-5] Tapon N, Nagata K, Lamarche N, hala A (duben 1998). „Nový racový cíl POSH je protein lešení obsahující SH3 zapojený do signálních drah JNK a NF-kappaB“. EMBO J.. 17 (5): 1395–404. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1395. PMC 1170487. PMID 9482736.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SH3RF1 SH3 doména obsahující prsteníček 1“.

[pmid14504284-7] A ^b Figueroa C, Tarras S, Taylor J, Vojtek AB (listopad 2003). „Akt2 negativně reguluje montáž signalizačního komplexu POSH-MLK-JNK“. J. Biol. Chem. 278 (48): 47922–7. doi:10,1074 / jbc.M307357200. PMID 14504284.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]