SH3BP5 - SH3BP5

SH3BP5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4H3B
Identifikátory
Aliasy	SH3BP5, SAB, SH3BP-5, protein vázající doménu SH3 5
Externí ID	OMIM: 605612 MGI: 1344391 HomoloGene: 23450 Genové karty: SH3BP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	15,341,368 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	31,436,078 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba domény SH3; • Aktivita výměnného faktoru rab guanyl-nukleotid; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondrie; • nukleoplazma; • jaderné těleso; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • membrána; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• signální transdukce; • negativní regulace aktivity protein tyrosin kinázy; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • negativní regulace aktivity proteinkinázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9467
	24056
	ENSG00000131370
	ENSMUSG00000021892
	O60239
	Q9Z131
	NM_001018009; NM_004844
	NM_011894; NM_001347585
	NP_001018009; NP_004835
	NP_001334514; NP_036024
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající SH3 doménu je protein že u lidí je kódován SH3BP5 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

SH3BP5 bylo prokázáno komunikovat s Brutonova tyrosinkináza^[5]^[6] a MAPK8.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131370 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021892 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Matsushita M; Yamadori T; Kato S; Takemoto Y; Inazawa J; Baba Y; Hashimoto S; Sekine S; Arai S; Kunikata T; Kurimoto M; Kishimoto T; Tsukada S (červen 1998). „Identifikace a charakterizace nového proteinu vázajícího doménu SH3, Sab, který se přednostně asociuje s Brutonovou tyrosin kinázou (BtK)“. Biochem Biophys Res Commun. 245 (2): 337–43. doi:10.1006 / bbrc.1998.8420. PMID 9571151.
^ ^A ^b Yamadori T; Baba Y; Matsushita M; Hashimoto S; Kurosaki M; Kurosaki T; Kishimoto T; Tsukada S (červen 1999). „Brutonova aktivita tyrosinkinázy je negativně regulována Sabem, proteinem vázajícím doménu Btk-SH3“. Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (11): 6341–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.6341Y. doi:10.1073 / pnas.96.11.6341. PMC 26883. PMID 10339589.
^ "Entrez Gene: SH3BP5 SH3-domain binding protein 5 (BTK-associated)" ".
^ Wiltshire, Carolyn; Matsushita Masato; Tsukada Satoshi; Gillespie David A F; Květen Gerhard H W (listopad 2002). "Nový c-Jun N-terminální kináza (JNK) interagující protein, Sab (SH3BP5), se asociuje s mitochondriemi". Biochem. J. Anglie. 367 (Pt 3): 577–85. doi:10.1042 / BJ20020553. ISSN 0264-6021. PMC 1222945. PMID 12167088.

Další čtení

Baba Y, Matsushita M, Matsuda Y a kol. (2000). „Přiřazení SH3BP5 / Sh3bp5 kódujícího sab, protein vázající doménu SH3, který se přednostně asociuje s Brutonovou tyrosinkinázou, k lidskému chromozomu 1q43 a myšímu chromozomu 14B hybridizací in situ“. Cytogenet. Cell Genet. 87 (3–4): 221–2. doi:10.1159/000015430. PMID 10702676. S2CID 41425074.
Wiltshire C, Matsushita M, Tsukada S a kol. (2002). "Nový c-Jun N-terminální kináza (JNK) interagující protein, Sab (SH3BP5), se asociuje s mitochondriemi". Biochem. J. 367 (Pt 3): 577–85. doi:10.1042 / BJ20020553. PMC 1222945. PMID 12167088.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Soud NW; Kuo I; Quigley O; Bogoyevitch MA (2004). „Fosforylace mitochondriálního proteinu Sab stresově aktivovanou proteinkinázou 3“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319 (1): 130–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.04.148. PMID 15158451.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiltshire C; Gillespie DA; Květen GH (2005). „Sab (SH3BP5), nový mitochondriálně lokalizovaný protein interagující s JNK“. Biochem. Soc. Trans. 32 (Pt 6): 1075–7. doi:10.1042 / BST0321075. PMID 15506969.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131370 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021892 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9571151-5] A ^b Matsushita M; Yamadori T; Kato S; Takemoto Y; Inazawa J; Baba Y; Hashimoto S; Sekine S; Arai S; Kunikata T; Kurimoto M; Kishimoto T; Tsukada S (červen 1998). „Identifikace a charakterizace nového proteinu vázajícího doménu SH3, Sab, který se přednostně asociuje s Brutonovou tyrosin kinázou (BtK)“. Biochem Biophys Res Commun. 245 (2): 337–43. doi:10.1006 / bbrc.1998.8420. PMID 9571151.

[pmid10339589-6] A ^b Yamadori T; Baba Y; Matsushita M; Hashimoto S; Kurosaki M; Kurosaki T; Kishimoto T; Tsukada S (červen 1999). „Brutonova aktivita tyrosinkinázy je negativně regulována Sabem, proteinem vázajícím doménu Btk-SH3“. Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (11): 6341–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.6341Y. doi:10.1073 / pnas.96.11.6341. PMC 26883. PMID 10339589.

[entrez-7] "Entrez Gene: SH3BP5 SH3-domain binding protein 5 (BTK-associated)" ".

[pmid12167088-8] Wiltshire, Carolyn; Matsushita Masato; Tsukada Satoshi; Gillespie David A F; Květen Gerhard H W (listopad 2002). "Nový c-Jun N-terminální kináza (JNK) interagující protein, Sab (SH3BP5), se asociuje s mitochondriemi". Biochem. J. Anglie. 367 (Pt 3): 577–85. doi:10.1042 / BJ20020553. ISSN 0264-6021. PMC 1222945. PMID 12167088.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]