SH3BGRL3 - SH3BGRL3

SH3BGRL3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1SJ6
Identifikátory
Aliasy	SH3BGRL3, HEL-S-297, SH3BP-1, TIP-B1, SH3 vázající na doménu protein bohatý na glutamát jako 3
Externí ID	OMIM: 615679 MGI: 1920973 HomoloGene: 41824 Genové karty: SH3BGRL3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	26,281,522 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	134,128,789 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita přenosu elektronů; • aktivita protein disulfid oxidoreduktázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • extracelulární exosom; • cytoplazma; • jaderné těleso;
Biologický proces	• oxidačně-redukční proces; • redoxní homeostáza buněk; • elektronový transportní řetězec;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	83442
	73723
	ENSG00000142669
	ENSMUSG00000028843
	Q9H299
	Q91VW3
	NM_031286
	NM_080559
	NP_112576
	NP_542126
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

SH3 protein vázající na doménu bohatý na kyselinu glutamovou 3 je protein že u lidí je kódován SH3BGRL3 gen.^[5]

10,5 kDa protein SH3 vázající protein podobný 3 bohaté na kyselinu glutamovou má izoelektrický bod 5,0. SH3 vázající na kyselinu glutamovou bohatou (SH3BGR ) gen se nachází v lidském chromozomu 21. Dva homologní geny, SH3BGRL a SH3BGRL3 jsou umístěny na chromozomu Xq13.3, respektive 1p34.3-35 a kódují malé proteiny podobné N-koncové oblasti proteinu SH3BGR.^[6] SH3BGRL3 protein vykazuje významnou podobnost s glutaredoxinem 1 z E-coli a předpokládá se, že všechny tři proteiny patří thioredoxin - jako rodina proteinů. Glutaredoxiny (GRX) jsou všudypřítomné oxidoreduktázy, které katalyzují redukci mnoha intracelulárních disulfidů proteinů a hrají důležitou roli v mnoha redoxních drahách. Bílkovině SH3BGRL3 však chybí enzymatická funkce glutaredoxinů a může hrát roli regulátoru redoxní aktivity.^[7]

Role v rakovině

Proteiny, jako je glutaredoxin a thioredoxin, jsou uváděny jako up-regulované u mnoha druhů rakoviny, jako je plic a pankreatu; podílejí se na zvýšené odolnosti rakovinných buněk vůči volným radikálům. Existuje jen málo současných důkazů, které přímo spojují SH3GRPL3 s přežitím v rakovinných buňkách, avšak protein byl nedávno identifikován jako up-regulovaný v glioblastoma multiforme ve srovnání s normální mozkovou tkání na proteomické analýze.^[8] Studie z akutní promyelocytární leukémie buněčné linie NB4 také uváděly up-regulaci proteinu. Naopak se uvádí, že související protein SH3BGRL je downregulován fibroblasty, lymfoidní buňky a slezina nádorové buňky transformované virovým onkogenem v-Rel.^[9] Společná exprese SH3BGRL s v-Rel v primárních slezinných lymfocytech snížila počet vytvořených kolonií o 76%. Xu a kol. uvádí protein SH3BGRPL3 jako posttranslační modifikaci 27 kDa faktor nekrózy nádorů alfa (TNF-α) inhibiční protein, TIP-B1. Tento protein se potenciálně podílí na rezistenci buněk vůči apoptóza -indukující účinek TNF-α.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000142669 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028843 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: SH3BGRL3 SH3 doména vázající protein bohatý na kyselinu glutamovou jako 3“.
^ Egeo A, Mazzocco M, Arrigo P, Vidal-Taboada JM, Oliva R, Pirola B, Giglio S, Rasore-Quartino A, Scartezzini P (červen 1998). „Identifikace a charakterizace nového lidského genu kódujícího malý protein s vysokou homologií k oblasti bohaté na prolin genu SH3BGR“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 247 (2): 302–6. doi:10.1006 / bbrc.1998.8763. PMID 9642120.
^ Mazzocco M, Maffei M, Egeo A, Vergano A, Arrigo P, Di Lisi R, Ghiotto F, Scartezzini P (květen 2002). „Identifikace nového lidského homologu genu SH3 vázajícího na kyselinu glutamovou bohatou (SH3BGR) zakládá novou rodinu vysoce konzervovaných malých proteinů souvisejících s nadrodinou thioredoxinu.“ Gen. 291 (1–2): 233–9. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00602-9. PMID 12095696.
^ Khalil AA, James P (únor 2007). „Objev biomarkerů: proteomický přístup k profilování rakoviny mozku“. Cancer Sci. 98 (2): 201–13. doi:10.1111 / j.1349-7006.2007.00374.x. PMID 17233837.
^ Majid SM, Liss AS, You M, Bose HR (únor 2006). „Potlačení SH3BGRL je důležité pro transformaci zprostředkovanou v-Rel“. Onkogen. 25 (5): 756–68. doi:10.1038 / sj.onc.1209107. PMID 16186799.
^ Xu C, Zheng P, Shen S, Xu Y, Wei L, Gao H, Wang S, Zhu C, Tang Y, Wu J, Zhang Q, Shi Y (květen 2005). "NMR struktura a regulovaná exprese v APL buňce lidského SH3BGRL3". FEBS Lett. 579 (13): 2788–94. doi:10.1016 / j.febslet.2005.04.011. PMID 15907482.

Další čtení

Xu C, Zheng P, Shen S a kol. (2005). "NMR struktura a regulovaná exprese v APL buňce lidského SH3BGRL3". FEBS Lett. 579 (13): 2788–94. doi:10.1016 / j.febslet.2005.04.011. PMID 15907482.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mazzocco M, Arrigo P, Egeo A a kol. (2001). „Nový lidský homolog genu SH3BGR kóduje malý protein podobný glutaredoxinu 1 z Escherichia coli.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 285 (2): 540–5. doi:10.1006 / bbrc.2001.5169. PMID 11444877.
Henn AD, Berleth ES, Mihich E, Ehrke MJ (2001). „Změny hladin cytosolického a membránového TNF inhibičního proteinu-B1 (TIP-B1) spojené s ochranou před cytotoxicitou vyvolanou TNF“. FASEB J.. 15 (7): 1315–7. doi:10.1096 / fj.00-0543fje. PMID 11344125.
Seo J, Kim M, Kim J (2001). „Identifikace nových genů odlišně exprimovaných v buňkách HL-60 indukovaných PMA pomocí mikročipů cDNA“. Mol. Buňky. 10 (6): 733–9. doi:10.1007 / s10059-000-0733-x. PMID 11211881.
Berleth ES, Henn AD, Gurtoo HL a kol. (2001). "Nový protein inhibující tumor nekrotizující faktor alfa, TIP-B1". Int. J. Immunopharmacol. 22 (12): 1137–42. doi:10.1016 / S0192-0561 (00) 00071-0. PMID 11137621.
Berleth ES, Nadadur S, Henn AD a kol. (1999). „Identifikace, charakterizace a klonování TIP-B1, nového proteinového inhibitoru lýzy indukované faktorem nekrotizující nádory“. Cancer Res. 59 (21): 5497–506. PMID 10554026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000142669 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028843 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: SH3BGRL3 SH3 doména vázající protein bohatý na kyselinu glutamovou jako 3“.

[pmid9642120-6] Egeo A, Mazzocco M, Arrigo P, Vidal-Taboada JM, Oliva R, Pirola B, Giglio S, Rasore-Quartino A, Scartezzini P (červen 1998). „Identifikace a charakterizace nového lidského genu kódujícího malý protein s vysokou homologií k oblasti bohaté na prolin genu SH3BGR“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 247 (2): 302–6. doi:10.1006 / bbrc.1998.8763. PMID 9642120.

[pmid12095696-7] Mazzocco M, Maffei M, Egeo A, Vergano A, Arrigo P, Di Lisi R, Ghiotto F, Scartezzini P (květen 2002). „Identifikace nového lidského homologu genu SH3 vázajícího na kyselinu glutamovou bohatou (SH3BGR) zakládá novou rodinu vysoce konzervovaných malých proteinů souvisejících s nadrodinou thioredoxinu.“ Gen. 291 (1–2): 233–9. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00602-9. PMID 12095696.

[pmid17233837-8] Khalil AA, James P (únor 2007). „Objev biomarkerů: proteomický přístup k profilování rakoviny mozku“. Cancer Sci. 98 (2): 201–13. doi:10.1111 / j.1349-7006.2007.00374.x. PMID 17233837.

[pmid16186799-9] Majid SM, Liss AS, You M, Bose HR (únor 2006). „Potlačení SH3BGRL je důležité pro transformaci zprostředkovanou v-Rel“. Onkogen. 25 (5): 756–68. doi:10.1038 / sj.onc.1209107. PMID 16186799.

[pmid15907482-10] Xu C, Zheng P, Shen S, Xu Y, Wei L, Gao H, Wang S, Zhu C, Tang Y, Wu J, Zhang Q, Shi Y (květen 2005). "NMR struktura a regulovaná exprese v APL buňce lidského SH3BGRL3". FEBS Lett. 579 (13): 2788–94. doi:10.1016 / j.febslet.2005.04.011. PMID 15907482.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]