SGTA - SGTA

SGTA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2VYI, 4CPG, 4BOH, 4GOE, 4GOF
Identifikátory
Aliasy	SGTA, SGT, alphaSGT, hSGT, malá tetratrikopeptidová repetice bohatá na glutamin obsahující alfa
Externí ID	OMIM: 603419 MGI: 1098703 HomoloGene: 31122 Genové karty: SGTA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	2,783,282 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	81,060,181 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba komplexu BAT3; • proteinová asociace; • identická vazba na protein; • GO: Aktivita molekulárního adaptéru 0032947;
Buněčná složka	• cytosol; • membrána; • buněčné jádro; • cytoplazma; • presynapse; • vnější složka membrány synaptických vezikul; • Komplex TRC;
Biologický proces	• pozitivní regulace katabolického procesu proteinu závislého na ubikvitinu závislého na ER; • GO: virový proces 0022415; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • negativní regulace katabolického procesu proteinu závislého na ubikvitinu závislého na ER; • negativní regulace ubikvitinace bílkovin účastnící se katabolického procesu proteinu závislého na ubikvitinu; • inzerce membránového proteinu zakotveného ocasem do membrány ER; • skládání proteinů zprostředkované chaperonem; • posttranslační cílení proteinu na membránu endoplazmatického retikula; • pozitivní regulace skládání proteinu zprostředkovaného chaperonem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6449
	52551
	ENSG00000104969
	ENSMUSG00000004937
	O43765
	Q8BJU0
	NM_003021
	NM_024499; NM_001358549; NM_001358550
	NP_003012
	NP_078775; NP_001345478; NP_001345479
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Malý glutamát-bohatý tetratrikopeptidový protein obsahující repetice alfa je protein že u lidí je kódován SGTA gen.^[5]^[6]^[7] SGTA ortology ^[8] byly také identifikovány v několika savci pro které jsou k dispozici úplná data genomu.

Funkce

Tento gen kóduje protein, který je schopen interakce s hlavním nestrukturálním proteinem parvoviru H-1 a proteinu příbuzného tepelnému šoku 70-kDa; jeho funkce však není známa. Protože je tento transkript všudypřítomně exprimován v různých tkáních, může tento protein sloužit jako úklidová funkce.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že SGTA komunikovat s Receptor růstového hormonu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104969 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004937 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kordes E, Savelyeva L, Schwab M, Rommelaere J, Jauniaux JC, Cziepluch C (srpen 1998). "Izolace a charakterizace lidského SGT a identifikace homologů v Saccharomyces cerevisiae a Caenorhabditis elegans". Genomika. 52 (1): 90–94. doi:10.1006 / geno.1998.5385. PMID 9740675.
^ ^A ^b Schantl JA, Roza M, De Jong AP, Strous GJ (srpen 2003). „Malý protein s obsahem tetratrikopeptidů bohatých na glutamin (SGT) interaguje s motivem endocytózy závislé na ubikvitinu (UbE) receptoru růstového hormonu.“. The Biochemical Journal. 373 (Pt 3): 855–863. doi:10.1042 / BJ20021591. PMC 1223544. PMID 12735788.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SGTA, malý glutamát bohatý na tetratrikopeptidové repetice (TPR), obsahující alfa“.
^ "OrthoMaM fylogenetický marker: sekvence kódující SGTA".

Další čtení

Roberts JD, Thapaliya A, Martínez-Lumbreras S, Krysztofinska EM, Isaacson RL (prosinec 2015). „Strukturální a funkční poznatky o malém, na glutaminu bohatém, tetratrikopeptidovém opakujícím se proteinu alfa“. Frontiers in Molecular Biosciences. 2: 71. doi:10.3389 / fmolb.2015.00071. PMC 4683186. PMID 26734616.
Heavner GA, Audhya T, Goldstein G (únor 1990). "Peptidové analogy thymopentinu rozlišují odlišné specificity receptoru thymopoietinu na dvou lidských T buněčných liniích". Regulační peptidy. 27 (2): 257–262. doi:10.1016 / 0167-0115 (90) 90044-W. PMID 2158125. S2CID 12562672.Geraghty RJ, Talbot KJ, Callahan M, Harper W, Panganiban AT (1994). Msgstr "Závislost typu buňky pro funkci Vpu". Journal of Medical Primatology. 23 (2–3): 146–150. doi:10.1111 / j.1600-0684.1994.tb00115.x. PMID 7966229. S2CID 20674152.
Cziepluch C, Kordes E, Poirey R, Grewenig A, Rommelaere J, Jauniaux JC (květen 1998). „Identifikace nového buněčného proteinu obsahujícího TPR, SGT, který interaguje s nestrukturálním proteinem NS1 parvoviru H-1“. Journal of Virology. 72 (5): 4149–4156. doi:10.1128 / JVI.72.5.4149-4156.1998. PMC 109644. PMID 9557704.
Callahan MA, Handley MA, Lee YH, Talbot KJ, Harper JW, Panganiban AT (červen 1998). „Funkční interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Vpu a Gag s novým členem rodiny proteinů opakujících se na tetratrikopeptid“. Journal of Virology. 72 (6): 5189–5197. doi:10.1128 / JVI.72.6.5189-5197.1998. PMC 110095. PMID 9573291.
Callahan MA, Handley MA, Lee YH, Talbot KJ, Harper JW, Panganiban AT (říjen 1998). „Funkční interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Vpu a Gag s novým členem rodiny proteinů opakujících se na tetratrikopeptid“. Journal of Virology. 72 (10): 8461. doi:10.1128 / JVI.72.10.8460c-8460c.1998. PMC 110251. PMID 9766974.
Liu FH, Wu SJ, Hu SM, Hsiao CD, Wang C (listopad 1999). „Specifická interakce příbuzného proteinu 70 kDa s tepelným šokem s opakováním tetratrikopeptidu“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (48): 34425–34432. doi:10.1074 / jbc.274.48.34425. PMID 10567422.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–1795. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–435. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–292. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Handley MA, Paddock S, Dall A, Panganiban AT (prosinec 2001). „Sdružení proteinu vázajícího na Vpu s mikrotubuly a redistribuce proteinu HIV-1 Gag závislého na Vpu“. Virologie. 291 (2): 198–207. doi:10.1006 / viro.2001.1166. PMID 11878889.
Angeletti PC, Walker D, Panganiban AT (červenec 2002). „Malý protein bohatý na glutamin / virový protein U-vázající protein je nový kochaperon, který ovlivňuje aktivitu proteinu 70 tepelného šoku“. Stres buněk a chaperony. 7 (3): 258–268. doi:10.1379 / 1466-1268 (2002) 007 <0258: SGRPVP> 2.0.CO; 2. PMC 514826. PMID 12482202.
Pai MT, Yang CS, Tzeng SR, Wang C, Cheng JW (srpen 2003). „Přiřazení rezonance 1H, 15N a 13C domény tetratrikopeptidové repetice (TPR) hSGT“. Journal of Biomolecular NMR. 26 (4): 381–382. doi:10.1023 / A: 1024029117511. PMID 12815268. S2CID 19544209.
Wang H, Zhang Q, Zhu D (listopad 2003). „hSGT interaguje s N-koncovou oblastí myostatinu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 311 (4): 877–883. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.10.080. PMID 14623262.
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–167. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Winnefeld M, Rommelaere J, Cziepluch C (únor 2004). „Lidský malý protein obsahující TPR bohatý na glutamin je nezbytný pro postup dělení buněk.“ Experimentální výzkum buněk. 293 (1): 43–57. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.09.028. PMID 14729056.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–12135. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104969 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004937 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9740675-5] Kordes E, Savelyeva L, Schwab M, Rommelaere J, Jauniaux JC, Cziepluch C (srpen 1998). "Izolace a charakterizace lidského SGT a identifikace homologů v Saccharomyces cerevisiae a Caenorhabditis elegans". Genomika. 52 (1): 90–94. doi:10.1006 / geno.1998.5385. PMID 9740675.

[pmid12735788-6] A ^b Schantl JA, Roza M, De Jong AP, Strous GJ (srpen 2003). „Malý protein s obsahem tetratrikopeptidů bohatých na glutamin (SGT) interaguje s motivem endocytózy závislé na ubikvitinu (UbE) receptoru růstového hormonu.“. The Biochemical Journal. 373 (Pt 3): 855–863. doi:10.1042 / BJ20021591. PMC 1223544. PMID 12735788.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SGTA, malý glutamát bohatý na tetratrikopeptidové repetice (TPR), obsahující alfa“.

[OrthoMaM-8] "OrthoMaM fylogenetický marker: sekvence kódující SGTA".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]