SFRP2 - SFRP2

SFRP2
Identifikátory
Aliasy	SFRP2FRP-2, SARP1, SDF-5, vylučovaný frizzlovaný příbuzný protein 2
Externí ID	OMIM: 604157 MGI: 108078 HomoloGene: 56438 Genové karty: SFRP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	153,789,083 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	83,774,316 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na fibronektin; • aktivita ligandu receptoru; • aktivita aktivátoru endopeptidázy; • integrinová vazba; • GO: aktivita aktivátoru enzymu 0010577; • Aktivita receptoru spřaženého s G-proteinem; • Vazba na Wnt-protein; • Aktivita receptoru aktivovaného Wnt;
Buněčná složka	• extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • extracelulární; • integrální součást membrány; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• buněčná odpověď na extracelulární stimul; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy; • Signální dráha Wnt zapojená do somitogeneze; • somitogeneze; • diferenciace buněk; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • vývoj mužských pohlavních žláz; • regulace ustavení rovinné polarity; • reakce na živiny; • organizace kolagenových vláken; • konvergentní prodloužení zapojené do prodloužení osy; • vývoj primárních mužských pohlavních znaků; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • negativní regulace specifikace osudu mezodermálních buněk; • buněčná odpověď na rentgen; • signalizace buňka-buňka; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • morfogeneze kostí; • proliferace krvetvorných buněk; • vývoj chondrocytů; • embryonální číslice morfogeneze; • morfogeneze výtokového traktu; • morfogeneze levé srdeční komory; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na poškození DNA; • Wnt signální cesta; • negativní regulace genové exprese; • vývoj sklerotomu; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu; • pozitivní regulace angiogeneze; • dráha polarity rovinných buněk zapojená do uzavření neurální trubice; • negativní regulace signální dráhy BMP; • vývoj mnohobuněčných organismů; • negativní regulace apoptotického procesu buněk srdečního svalu; • regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace buněčného růstu; • uzavření neurální trubice; • negativní regulace fosforylace peptidyl-tyrosinu; • negativní regulace buněčné migrace; • pozitivní regulace diferenciace osteoblastů; • regulace signální dráhy Wnt; • vývoj chrupavky; • regulace buněčné proliferace; • regulace dělení kmenových buněk; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy prostřednictvím receptorů domény smrti; • negativní regulace buněčného růstu; • vývoj neurální trubice; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • negativní regulace proliferace epiteliálních buněk; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • větvení účastnící se morfogeneze krevních cév; • postanální morfogeneze ocasu; • negativní regulace vývoje dermatomu; • negativní regulace dráhy polarity rovinných buněk zapojené do prodloužení osy; • pozitivní regulace buněčné adheze zprostředkované integrinem; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace aktivity JUN kinázy; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk; • negativní regulace přechodu z epitelu na mezenchym; • reakce na drogu; • negativní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • morfogeneze trávicího traktu; • specifikace předního / zadního vzoru; • apoptotický proces; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • regulace diferenciace dopaminergních neuronů středního mozku; • regulace vývoje neuronové projekce; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • nekanonická signální cesta Wnt; • regulace aktivity receptoru; • kanonická signální cesta Wnt;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6423
	20319
	ENSG00000145423
	ENSMUSG00000027996
	Q96HF1
	P97299
	NM_003013
	NM_009144
	NP_003004
	NP_033170
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vylučovaný krepovitý protein 2 je protein že u lidí je kódován SFRP2 gen.^[5]^[6]Tento gen kóduje člena rodiny SFRP, který obsahuje a cystein -rich doména homologní k domnělému Wnt-vazebnému místu Frizzled bílkoviny. SFRP fungují jako rozpustné modulátory Wnt signalizace. Methylace tohoto genu je potenciálním markerem pro přítomnost kolorektální karcinom.^[6]

Rakovina

SFRP2 gen byl detekován postupně nadměrně exprimován v Lidsky papillomavirus -pozitivní neoplastické keratinocyty odvozeno z děložního čípku preneoplastické léze na různých úrovních malignity.^[7] Z tohoto důvodu je tento gen pravděpodobně spojen s tumorigenezí a může být potenciálním prognostickým markerem pro děložní děložní hrdlo. preneoplastické léze postup.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145423 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027996 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Melkonyan HS, Chang WC, Shapiro JP, Mahadevappa M, Fitzpatrick PA, Kiefer MC, Tomei LD, Umansky SR (leden 1998). „SARP: Rodina vylučovaných proteinů souvisejících s apoptózou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (25): 13636–41. doi:10.1073 / pnas.94.25.13636. PMC 28358. PMID 9391078.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SFRP2 secernovaný frizzled-related protein 2“.
^ ^A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

Další čtení

Rattner A, Hsieh JC, Smallwood PM a kol. (1997). „Rodina vylučovaných proteinů obsahuje homologii s doménou vázající se na ligand bohatou na cysteiny zkadeřených receptorů.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (7): 2859–63. doi:10.1073 / pnas.94.7.2859. PMC 20287. PMID 9096311.
Hu E, Zhu Y, Fredrickson T a kol. (1998). "Tkáně omezená exprese dvou lidských Frzbs v preadipocytech a pankreatu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 247 (2): 287–93. doi:10.1006 / bbrc.1998.8784. PMID 9642118.
Lescher B, Haenig B, Kispert A (1999). „sFRP-2 je cílem signální dráhy Wnt-4 ve vyvíjející se metanefrické ledvině“. Dev. Dyn. 213 (4): 440–51. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0177 (199812) 213: 4 <440 :: AID-AJA9> 3.0.CO; 2-6. PMID 9853965.
Chang JT, Esumi N, Moore K a kol. (1999). „Klonování a charakterizace vylučovaného proteinu souvisejícího s frizzlováním, který je exprimován pigmentovým epitelem sítnice“. Hučení. Mol. Genet. 8 (4): 575–83. doi:10,1093 / hmg / 8,4,575. PMID 10072424.
Lee CS, Buttitta LA, May NR, et al. (2000). „SHH-N zvyšuje regulaci Sfrp2, aby zprostředkovala jeho konkurenční interakci s WNT1 a WNT4 v somitické mezodermě“. Rozvoj. 127 (1): 109–18. PMID 10654605.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Brophy PD, Lang KM, Dressler GR (2004). „Sekretovaný frizovaný příbuzný protein 2 (SFRP2) gen je cílem transkripčního faktoru Pax2“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52401–5. doi:10,1074 / jbc.M305614200. PMID 14561758.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lee JL, Lin CT, Chueh LL, Chang CJ (2004). „Autokrinní / parakrinní sekrece Frizzled-příbuzný protein 2 indukuje buněčnou rezistenci na apoptózu: možný mechanismus prsní tumorigeneze“. J. Biol. Chem. 279 (15): 14602–9. doi:10,1074 / jbc.M309008200. PMID 14709558.
Müller HM, Oberwalder M, Fiegl H a kol. (2004). „Změny methylace ve fekální DNA: marker pro screening kolorektálního karcinomu?“. Lanceta. 363 (9417): 1283–5. doi:10.1016 / S0140-6736 (04) 16002-9. PMID 15094274. S2CID 22608605.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Zhang Z, Henzel WJ (2005). „Predikce signálního peptidu na základě analýzy experimentálně ověřených štěpných míst“. Protein Sci. 13 (10): 2819–24. doi:10.1110 / ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). „Signální sekvence a lapač klíčových slov in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA s oligopohraničením“. DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Clément G, Braunschweig R, Pasquier N a kol. (2006). „Změny signální dráhy Wnt během neoplastické progrese Barrettova jícnu“. Onkogen. 25 (21): 3084–92. doi:10.1038 / sj.onc.1209338. PMID 16407829.
Urakami S, Shiina H, Enokida H a kol. (2006). „Kombinovaná analýza hypermethylovaných genů rodiny Wnt-antagonistů jako nový panel epigenetických biomarkerů pro detekci rakoviny močového měchýře“. Clin. Cancer Res. 12 (7 Pt 1): 2109–16. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2468. PMID 16609023.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Huang ZH, Li LH, Yang F, Wang JF (2007). „Detekce aberantní metylace ve fekální DNA jako nástroj molekulárního screeningu pro kolorektální karcinom a prekancerózní léze“. Svět J. Gastroenterol. 13 (6): 950–4. doi:10,3748 / wjg.v13.i6.950. PMC 4065936. PMID 17352030.
Veeck J, Noetzel E, Bektas N, Jost E, Hartmann A, Knuchel R, Dahl E (2008). „Hypermethylace promotoru genu SFRP2 je velmi častou alterací a nádorově specifickým epigenetickým markerem u lidské rakoviny prsu“. Mol Cancer. 7 (83): 83. doi:10.1186/1476-4598-7-83. PMC 2613402. PMID 18990230.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145423 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027996 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9391078-5] Melkonyan HS, Chang WC, Shapiro JP, Mahadevappa M, Fitzpatrick PA, Kiefer MC, Tomei LD, Umansky SR (leden 1998). „SARP: Rodina vylučovaných proteinů souvisejících s apoptózou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (25): 13636–41. doi:10.1073 / pnas.94.25.13636. PMC 28358. PMID 9391078.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SFRP2 secernovaný frizzled-related protein 2“.

[Rotondo_2015-7] A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]