SF3B14 - SF3B14

SF3B6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2F9D, 2F9J, 2FHO, 3LQV
Identifikátory
Aliasy	SF3B6, HSPC175, Ht006, P14, SAP14, SAP14a, SF3B14, SF3B14a, CGI-110, spojovací faktor 3b podjednotka 6
Externí ID	OMIM: 607835 MGI: 1913305 HomoloGene: 9360 Genové karty: SF3B6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	24,076,373 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	4,827,659 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • mRNA vazba;
Buněčná složka	• katalytický krok 2 spliceosom; • Spliceozomální komplex typu U12; • Spliceozomální komplex typu U2; • prekatalytický spliceosom; • buněčné jádro; • U2 snRNP; • nukleoplazma; • spliceosomální komplex;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Zpracování mRNA; • tvorba blastocyst; • Sestřih RNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51639
	66055
	ENSG00000115128
	ENSMUSG00000037361
	Q9Y3B4
	P59708
	NM_016047
	NM_025323
	NP_057131
	NP_079599
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor sestřihu 3B, podjednotka 14 kDa, také známý jako SF3B14, je člověk gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje proteinovou podjednotku 14 kDa komplexu sestřihového faktoru 3b. Faktor sestřihu 3b se asociuje s malými nukleárními ribonukleoproteinovými komplexy U2 a U11 / U12 spliceosomů (U2 snRNP). Tento protein 14 kDa interaguje přímo s podjednotkou 1 komplexu sestřihu faktoru 3b. Tento 14 kDa protein také interaguje přímo s adenosinem, který provádí první transesterifikační krok sestřihu v místě odbočky pre-mRNA.^[5]

Interakce

SF3B14 bylo prokázáno komunikovat s SF3B1.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115128 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037361 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SF3B14 spojovací faktor 3B, 14 kDa podjednotka“.
^ Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (srpen 2001). „Nový protein snRNP U2 a U11 / U12, který se asociuje s místem pobočky pre-mRNA“. EMBO J.. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.
^ Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). "Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box". EMBO J.. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.

Další čtení

Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R „Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). "Vytvoření knihoven exprese proteinů v celém genomu pomocí náhodné aktivace genové exprese". Nat. Biotechnol. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (2001). „Nový protein snRNP U2 a U11 / U12, který se asociuje s místem pobočky pre-mRNA“. EMBO J.. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.
Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (2002). "Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box". EMBO J.. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.
Golas MM, Sander B, Will CL, Lührmann R, Stark H (2003). "Molekulární architektura multiproteinového sestřihového faktoru SF3b". Věda. 300 (5621): 980–4. doi:10.1126 / science.1084155. PMID 12738865. S2CID 31046270.
Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (2004). „Lidský 18S U11 / U12 snRNP obsahuje sadu nových proteinů, které nebyly nalezeny ve spliceozomu závislém na U2“. RNA. 10 (6): 929–41. doi:10,1261 / rna.7320604. PMC 1370585. PMID 15146077.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115128 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037361 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: SF3B14 spojovací faktor 3B, 14 kDa podjednotka“.

[pmid11500380-6] Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (srpen 2001). „Nový protein snRNP U2 a U11 / U12, který se asociuje s místem pobočky pre-mRNA“. EMBO J.. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.

[pmid12234937-7] Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). "Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box". EMBO J.. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]