SETD5 - SETD5 - Wikipedia

SETD5
Identifikátory
AliasySETD5, Doména SET obsahující 5
Externí IDOMIM: 615743 MGI: 1920145 HomoloGene: 12485 Genové karty: SETD5
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[1]
Chromozom 3 (lidský)
Genomické umístění pro SETD5
Genomické umístění pro SETD5
Kapela3p25.3Start9,397,615 bp[1]
Konec9,479,240 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001080517
NM_001292043
NM_018187
NM_001349451

NM_028385
NM_173005

RefSeq (protein)

NP_001073986
NP_001278972
NP_001336380

NP_082661
NP_766593

Místo (UCSC)Chr 3: 9,4 - 9,48 MbChr 6: 113,08 - 113,15 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

SET doména obsahující 5 je protein že u lidí je kódováno SETD5 gen.[5]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce SETD5. Podmíněný knockout myš linka volala Setd5tm1a (EUCOMM) Wtsi byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.[6] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka[7] k určení účinků vypuštění.[8][9][10][11] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace[12]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168137 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034269 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrez Gene: SET doména obsahující 5“. Citováno 2013-10-07.
  6. ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  7. ^ A b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
  8. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  9. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  10. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  11. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  12. ^ A b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.