SEPX1 - SEPX1

MSRB1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3MAO
Identifikátory
Aliasy	MSRB1, SELR, SELX, SEPX1, SepR, HSPC270, methioninsulfoxidreduktáza B1
Externí ID	OMIM: 606216 MGI: 1351642 HomoloGene: 8455 Genové karty: MSRB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	1,943,326 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	24,742,778 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita oxidoreduktázy, působící na sírnou skupinu dárců, disulfid jako akceptor; • aktivita oxidoreduktázy; • aktinová vazba; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • aktivita methionin-R-sulfoxidreduktázy; • aktivita peptid-methionin (R) -S-oxid reduktáza; • Aktivita L-methionin- (R) -S-oxid reduktázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • cytoskelet; • buněčné jádro; • aktinový cytoskelet; • buněčná složka;
Biologický proces	• proces imunitního systému; • polymerace aktinových vláken; • vrozený imunitní systém; • oxidačně-redukční proces; • reakce na oxidační stres; • oprava bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51734
	27361
	ENSG00000198736
	ENSMUSG00000075705
	Q9NZV6
	Q9JLC3
	NM_016332; NM_001382264; NM_001382265
	NM_013759; NM_001346668
	NP_057416; NP_001369193; NP_001369194
	NP_001333597; NP_038787
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Methionin-R-sulfoxidreduktáza B1 je enzym že u lidí je kódován SEPX1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje selenoprotein, který na svém aktivním místě obsahuje zbytek selenocysteinu (Sec). Selenocystein je kódován kodonem UGA, který normálně signalizuje ukončení translace. 3 'UTR selenoproteinových genů má společnou strukturu kmenové smyčky, sekvenci inzerce sek (SECIS), která je nezbytná pro rozpoznání UGA spíše jako Sec kodon než jako stop signál. Tento protein patří k methioninsulfoxid rodina reduktázy B (MsrB) a je exprimována v různých tkáních dospělých a plodů.^[6]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198736 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000075705 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lescure A, Gautheret D, Carbon P, Krol A (únor 2000). „Nové selenoproteiny identifikované in silico a in vivo pomocí konzervovaného strukturního motivu RNA“. J Biol Chem. 274 (53): 38147–54. doi:10.1074 / jbc.274.53.38147. PMID 10608886.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SEPX1 selenoprotein X, 1“.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Kryukov GV, Kryukov VM, Gladyshev VN (1999). „Nové savčí proteiny obsahující selenocystein identifikované pomocí algoritmu, který hledá prvky sekvence pro vložení selenocysteinu“. J. Biol. Chem. 274 (48): 33888–97. doi:10.1074 / jbc.274.48.33888. PMID 10567350.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C a kol. (2001). "Sekvence, struktura a patologie plně anotovaného terminálu 2 Mb krátkého ramene lidského chromozomu 16". Hučení. Mol. Genet. 10 (4): 339–52. doi:10,1093 / hmg / 10,4,339. PMID 11157797.
Moskovitz J, Singh VK, Requena J a kol. (2002). „Čištění a charakterizace methioninsulfoxidreduktáz z myší a Staphylococcus aureus a stereospecifičnost jejich substrátu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290 (1): 62–5. doi:10.1006 / bbrc.2001.6171. PMID 11779133.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kim HY, Gladyshev VN (2004). „Redukce methioninsulfoxidu u savců: charakterizace methionin-R-sulfoxidreduktáz“. Mol. Biol. Buňka. 15 (3): 1055–64. doi:10,1091 / mbc.E03-08-0629. PMC 363075. PMID 14699060.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198736 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000075705 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10608886-5] Lescure A, Gautheret D, Carbon P, Krol A (únor 2000). „Nové selenoproteiny identifikované in silico a in vivo pomocí konzervovaného strukturního motivu RNA“. J Biol Chem. 274 (53): 38147–54. doi:10.1074 / jbc.274.53.38147. PMID 10608886.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SEPX1 selenoprotein X, 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]