SEPP1 - SEPP1

SELENOP
Identifikátory
Aliasy	SELENOP, SELP, SeP, SEPP, SEPP1, selenoprotein P, plazma, 1, selenoprotein P
Externí ID	OMIM: 601484 MGI: 894288 HomoloGene: 3945 Genové karty: SELENOP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	42,887,392 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	3,280,508 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba selenu;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • lumen hustého granulí trombocytů; • extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• vývoj mozku; • post-embryonální vývoj; • sexuální reprodukce; • reakce na oxidační stres; • pohybové chování; • metabolický proces sloučeniny selenu; • degranulace krevních destiček; • růst; • reakce na iont selenu; • regulace růstu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6414
	20363
	ENSG00000250722
	ENSMUSG00000064373
	P49908
	P70274
	NM_005410; NM_001085486; NM_001093726
	NM_001042613; NM_001042614; NM_009155
	NP_001078955; NP_001087195; NP_005401
	NP_001036078; NP_001036079; NP_033181
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Selenoprotein P je protein že u lidí je kódován SEPP1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje a selenoprotein obsahující více selenocystein (Sec) zbytky, které jsou kódovány kodonem UGA, který normálně signalizuje ukončení translace. 3 'UTR selenoproteinových genů má společnou strukturu kmenové smyčky, sekvenci inzerce sec (SECIS), která je nezbytná pro rozpoznání UGA spíše jako Sec kodon než jako stop signál. Tento selenoprotein je extracelulární glykoprotein, a je neobvyklý v tom, že obsahuje 9 sek. zbytků (člověk, potkan, myš - viz Burk a Hill 2009) na polypeptid. Je to heparin - vazebný protein, který se zdá být asociován s endotelovými buňkami a předpokládá se, že funguje jako antioxidant v extracelulárním prostoru. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících buď stejnou nebo odlišnou izoformu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000250722 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000064373 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hill KE, Lloyd RS, Burk RF (únor 1993). "Konzervované nukleotidové sekvence v otevřeném čtecím rámci a 3 'nepřekládaná oblast selenoproteinové P mRNA". Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (2): 537–41. doi:10.1073 / pnas.90.2.537. PMC 45698. PMID 8421687.
^ ^A ^b "Entrezův gen: SEPP1 selenoprotein P, plazma, 1".

Další čtení

Burk RF, Hill KE (1994). „Selenoprotein P. Extracelulární glykoprotein bohatý na selen“. J. Nutr. 124 (10): 1891–7. doi:10.1093 / jn / 124.10.1891. PMID 7931697.
Mostert V (2000). "Selenoprotein P: vlastnosti, funkce a regulace". Oblouk. Biochem. Biophys. 376 (2): 433–8. doi:10.1006 / abbi.2000.1735. PMID 10775431.
Hill KE, Lloyd RS, Yang JG a kol. (1991). "CDNA pro krysí selenoprotein P obsahuje 10 TGA kodonů v otevřeném čtecím rámci". J. Biol. Chem. 266 (16): 10050–3. PMID 2037562.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Akesson B, Bellew T, Burk RF (1994). "Čištění selenoproteinu P z lidské plazmy". Biochim. Biophys. Acta. 1204 (2): 243–9. doi:10.1016/0167-4838(94)90014-0. PMID 8142465.
Hill KE, Dasouki M, Phillips JA, Burk RF (1997). "Gen lidského selenoproteinu P se mapuje na 5q31". Genomika. 36 (3): 550–1. doi:10.1006 / geno.1996.0505. PMID 8884283.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Mostert V, Lombeck I, Abel J (1998). "Nová metoda čištění selenoproteinu P z lidské plazmy". Oblouk. Biochem. Biophys. 357 (2): 326–30. doi:10.1006 / abbi.1998.0809. PMID 9735174.
Saito Y, Hayashi T, Tanaka A a kol. (1999). "Selenoprotein P v lidské plazmě jako extracelulární fosfolipid hydroperoxid glutathionperoxidáza. Izolace a enzymatická charakterizace lidského selenoproteinu p". J. Biol. Chem. 274 (5): 2866–71. doi:10.1074 / jbc.274.5.2866. PMID 9915822.
Koyama H, Omura K, Ejima A a kol. (1999). „Separace proteinů obsahujících selen v lidské a myší plazmě pomocí tandemových vysoce výkonných kolon pro kapalinovou chromatografii spojených s indukčně vázanou plazmatickou hmotnostní spektrometrií“. Anální. Biochem. 267 (1): 84–91. doi:10.1006 / abio.1998.2949. PMID 9918658.
Arteel GE, Franken S, Kappler J, Sies H (2000). "Vazba selenoproteinu P na heparin: charakterizace rezonancí povrchového plazmonu". Biol. Chem. 381 (3): 265–8. doi:10.1515 / BC.2000.034. PMID 10782998. S2CID 36448244.
Hondal RJ, Ma S, Caprioli RM a kol. (2001). "Heparin vázající histidinové a lysinové zbytky potkaního selenoproteinu P". J. Biol. Chem. 276 (19): 15823–31. doi:10,1074 / jbc.M010405200. PMID 11278668.
Nishimura K, Matsumiya K, Tsujimura A a kol. (2001). „Sdružení selenoproteinu P s produkcí testosteronu v kultivovaných Leydigových buňkách“. Oblouk. Androl. 47 (1): 67–76. doi:10.1080/01485010152104026. PMID 11442337.
Al-Taie OH, Seufert J, Mörk H a kol. (2003). „Složitá struktura opakování DNA v promotoru selenoproteinu P obsahuje funkčně relevantní polymorfismus a je geneticky nestabilní za podmínek nedostatku opravy nesouladu“. Eur. J. Hum. Genet. 10 (9): 499–504. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200811. PMID 12173025.
Saito Y, Takahashi K (2003). "Charakterizace selenoproteinu P jako proteinu dodávajícího selen". Eur. J. Biochem. 269 (22): 5746–51. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03298.x. PMID 12423375.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000250722 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000064373 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8421687-5] Hill KE, Lloyd RS, Burk RF (únor 1993). "Konzervované nukleotidové sekvence v otevřeném čtecím rámci a 3 'nepřekládaná oblast selenoproteinové P mRNA". Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (2): 537–41. doi:10.1073 / pnas.90.2.537. PMC 45698. PMID 8421687.

[entrez-6] A ^b "Entrezův gen: SEPP1 selenoprotein P, plazma, 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]