SENP6 - SENP6

SENP6
Identifikátory
Aliasy	SENP6, SSP1, SUSP1, SUMO1 / sentrin specifická peptidáza 6, SUMO specifická peptidáza 6
Externí ID	OMIM: 605003 MGI: 1922075 HomoloGene: 9196 Genové karty: SENP6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	75,718,281 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	80,144,953 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy; • aktivita peptidázy cysteinového typu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • SUMO-specifická aktivita endopeptidázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • cytoplazma;
Biologický proces	• desumoylace proteinů; • modifikace bílkovin malým odstraněním bílkovin; • regulace sestavy vřetena; • proteinová sumoylace; • proteolýza; • regulace sestavy kinetochore;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26054
	215351
	ENSG00000112701
	ENSMUSG00000034252
	Q9GZR1
	Q6P7W0
	NM_001100409; NM_001304792; NM_015571
	NM_146003; NM_001311110
	NP_001093879; NP_001291721; NP_056386
	NP_001298039; NP_666115
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteáza specifická pro sentrin 6 je enzym že u lidí je kódován SENP6 gen.^[5]

Funkce

Molekuly podobné ubikvitinu (UBL), jako např SUMO1, strukturálně souvisí s ubikvitin a mohou být ligovány do cílových proteinů podobným způsobem jako ubikvitin. Kovalentní připojení UBL však nevede k degradaci modifikovaných proteinů. Úpravy SUMO1 se podílejí na cílení na RANGAP1 do komplex jaderných pórů, jakož i při stabilizaci I-kappa-B-alfa (NFKBIA; MIM 164008) z degradace 26S proteazom. Stejně jako ubikvitin jsou UBL syntetizovány jako prekurzorové proteiny, přičemž 1 nebo více aminokyselin následuje po C-konci glycin -glycinové zbytky zralého proteinu UBL. Ocasní sekvence prekurzorů UBL tedy musí být odstraněny UBL-specifickými proteázami, jako je SENP6, před jejich konjugací s cílovými proteiny

Viz také

malý modifikátor související s ubikvitinem 1

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112701 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034252 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: SENP6 SUMO1 / sentrin specifická peptidáza 6“.

Další čtení

Mikolajczyk J, Drag M, Békés M, Cao JT, Ronai Z, Salvesen GS (září 2007). „Malé proteázy specifické pro ubikvitin (SUMO): profilování specifik a aktivit lidských SENP“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (36): 26217–24. doi:10,1074 / jbc.M702444200. PMID 17591783.
Drag M, Mikolajczyk J, Krishnakumar IM, Huang Z, Salvesen GS (leden 2008). „Profilování aktivity lidských deSUMOylačních enzymů (SENP) se syntetickými substráty naznačuje neočekávanou specifičnost dvou nově charakterizovaných členů rodiny“. The Biochemical Journal. 409 (2): 461–9. doi:10.1042 / BJ20070940. PMID 17916063. S2CID 12234952.
Yeh ET, Gong L, Kamitani T (květen 2000). „Proteiny podobné ubikvitinu: nová vína v nových lahvích“. Gen. 248 (1–2): 1–14. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00139-6. PMID 10806345.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (říjen 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
Kim KI, Baek SH, Jeon YJ, Nishimori S, Suzuki T, Uchida S, Shimbara N, Saitoh H, Tanaka K, Chung CH (květen 2000). „Nová proteáza specifická pro SUMO-1, SUSP1, která je vysoce exprimována v reprodukčních orgánech“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (19): 14102–6. doi:10.1074 / jbc.275.19.14102. PMID 10799485.
Goodson ML, Hong Y, Rogers R, Matunis MJ, Park-Sarge OK, Sarge KD (květen 2001). „Modifikace Sumo-1 reguluje vazebnou aktivitu DNA transkripčního faktoru 2 tepelného šoku, transkripčního faktoru spojeného s jaderným tělem promyelocytární leukémie“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (21): 18513–8. doi:10,1074 / jbc.M008066200. PMID 11278381.
Tojo M, Matsuzaki K, Minami T, Honda Y, Yasuda H, Chiba T, Saya H, Fujii-Kuriyama Y, Nakao M (listopad 2002). „Jaderný transportér receptoru arylových uhlovodíků je modulován konjugačním systémem SUMO-1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (48): 46576–85. doi:10,1074 / jbc.M205987200. PMID 12354770.
Bailey D, O'Hare P (leden 2004). „Charakterizace lokalizace a proteolytické aktivity proteázy specifické pro SUMO, SENP1“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (1): 692–703. doi:10,1074 / jbc.M306195200. PMID 14563852.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Choi SJ, Chung SS, Rho EJ, Lee HW, Lee MH, Choi HS, Seol JH, Baek SH, Bang OS, Chung CH (říjen 2006). „Negativní modulace transkripční aktivity RXRalfa malou modifikací související s ubikvitinem (SUMO) a její obrácení pomocí SUMO-specifické proteázy SUSP1“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (41): 30669–77. doi:10,1074 / jbc.M604033200. PMID 16912044.
Mukhopadhyay D, Ayaydin F, Kolli N, Tan SH, Anan T, Kametaka A, Azuma Y, Wilkinson KD, Dasso M (září 2006). „SUSP1 antagonizuje tvorbu vysoce konjugovaných druhů SUMO2 / 3“ (PDF). The Journal of Cell Biology. 174 (7): 939–49. doi:10.1083 / jcb.200510103. PMC 2064386. PMID 17000875.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112701 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034252 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: SENP6 SUMO1 / sentrin specifická peptidáza 6“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]