SECISBP2 - SECISBP2

SECISBP2
Identifikátory
Aliasy	SECISBP2SBP2, vazebný protein SECIS 2
Externí ID	OMIM: 607693 MGI: 1922670 HomoloGene: 11415 Genové karty: SECISBP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	89,359,663 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	51,684,044 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• mRNA 3'-UTR vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • vazba sekvence inzerce selenocysteinu; • vazba ribonukleoproteinového komplexu;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • mitochondrie; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• biosyntéza bílkovin; • vývoj striatum; • vývoj neuronů; • negativní regulace jaderně transkribovaného mRNA katabolického procesu, nesmysl zprostředkovaný rozpad; • začlenění selenocysteinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79048
	75420
	ENSG00000187742
	ENSMUSG00000035139
	Q96T21
	n / a
NM_001282688; NM_001282689; NM_001282690; NM_024077; NM_001354696;
	NM_001354697; NM_001354698; NM_001354702
	NM_029279; NM_001308448
NP_001269617; NP_001269618; NP_001269619; NP_076982; NP_001341625;
	NP_001341626; NP_001341627; NP_001341631
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vazebný protein SECIS 2 (běžně označované jako SBP2) je protein že u lidí je kódován SECISBP2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Začlenění selenocystein do proteinu vyžaduje společné působení prvku mRNA, který se nazývá sekvence inzerce sec (SECIS ), faktor prodlužování translace specifický pro selenocystein a vazebný protein SECIS. S těmito prvky na místě může být kodon UGA dekódován jako selenocystein. SBP2 je jaderný protein, který funguje jako vazebný protein SECIS, ale experimentální důkazy naznačují, že SBP2 je cytoplazmatický.^[6]

Klinický význam

Mutace v tomto genu byly spojeny se snížením aktivity specifického tyroxinu deiodinase enzym obsahující selenocystein a abnormální hormon štítné žlázy metabolismus.^[6]

Viz také

Rezistence na hormony štítné žlázy

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000187742 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035139 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
^ ^A ^b ^C "Entrez Gene: SECISBP2 SECIS vazebný protein 2".

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Copeland PR, Fletcher JE, Carlson BA, Hatfield DL, Driscoll DM (leden 2000). „Pro translaci savčích selenoproteinových mRNA je nutný nový protein vázající RNA, SBP2.“. Časopis EMBO. 19 (2): 306–14. doi:10.1093 / emboj / 19.2.306. PMC 305564. PMID 10637234.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Low SC, Grundner-Culemann E, Harney JW, Berry MJ (prosinec 2000). „Interakce SECIS-SBP2 určují účinnost začlenění selenocysteinu a hierarchii selenoproteinů“. Časopis EMBO. 19 (24): 6882–90. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6882. PMC 305907. PMID 11118223.
Lescure A, Allmang C, Yamada K, Carbon P, Krol A (květen 2002). "cDNA klonování, expresní vzorec a RNA vazebná analýza lidského vazebného proteinu selenocysteinového inzertu (SECIS) 2". Gen. 291 (1–2): 279–85. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00629-7. PMID 12095701.
Allmang C, Carbon P, Krol A (říjen 2002). „Proteiny SBP2 a 15,5 kD / Snu13p sdílejí stejnou vazebnou doménu RNA: identifikace aminokyselin SBP2 důležitých pro vazbu SECIS RNA“. RNA. 8 (10): 1308–18. doi:10.1017 / S1355838202020034. PMC 1370339. PMID 12403468.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Dumitrescu AM, Liao XH, Abdullah MS, Lado-Abeal J, Majed FA, Moeller LC, Boran G, Schomburg L, Weiss RE, Refetoff S (listopad 2005). "Mutace v SECISBP2 vedou k abnormálnímu metabolismu hormonů štítné žlázy". Genetika přírody. 37 (11): 1247–52. doi:10.1038 / ng1654. PMID 16228000. S2CID 35631638.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Papp LV, Lu J, Striebel F, Kennedy D, Holmgren A, Khanna KK (červenec 2006). „Redoxní stav SECIS vázajícího proteinu 2 řídí jeho lokalizaci a funkci začlenění selenocysteinu“. Molekulární a buněčná biologie. 26 (13): 4895–910. doi:10.1128 / MCB.02284-05. PMC 1489162. PMID 16782878.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000187742 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035139 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11230166-5] Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.

[entrez-6] A ^b ^C "Entrez Gene: SECISBP2 SECIS vazebný protein 2".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]