SEC24D - SEC24D

SEC24D
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3EFO, 3EG9
Identifikátory
Aliasy	SEC24D, CLCRP2, SEC24 homolog D, složka komplexu povlaku COPII
Externí ID	OMIM: 607186 MGI: 1916858 HomoloGene: 40986 Genové karty: SEC24D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	118,838,683 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	123,365,641 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • SNARE vazba; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • endoplazmatické retikulum; • Kabát vezikuly COPII; • cytosol; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • zpracování antigenu a prezentace peptidového antigenu prostřednictvím MHC I. třídy; • v embryonálním vývoji dělohy; • Povlak vezikul COPII; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • transport zprostředkovaný vezikuly; • ER na transport zprostředkovaný vezikulemi Golgi; • nakládání nákladu do vezikuly potažené COPII;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9871
	69608
	ENSG00000150961
	ENSMUSG00000039234
	O94855
	n / a
	NM_014822; NM_001318066
	NM_027135
	NP_001304995; NP_055637
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteinový transportní protein Sec24D je protein že u lidí je kódován SEC24D gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem je členem podrodiny SEC24 rodiny SEC23 / SEC24, která se podílí na obchodování s vezikuly. Kódovaný protein má podobnost s droždí Sec24p součást COPII. COPII je komplex obalového proteinu odpovědný za pučení vezikul z ER. Role tohoto genového produktu se podílí na formování vezikuly a také na výběru a koncentraci nákladu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150961 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039234 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
^ Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (duben 1999). "Proteiny Sec24 a třídění na endoplazmatickém retikulu". J Biol Chem. 274 (12): 7833–40. doi:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID 10075675.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SEC24D SEC24 příbuzná genová rodina, člen D (S. cerevisiae)".

Další čtení

Tang BL, Kausalya J, Low DY a kol. (1999). "Rodina savčích proteinů homologních s kvasinkami Sec24p". Biochem. Biophys. Res. Commun. 258 (3): 679–84. doi:10.1006 / bbrc.1999.0574. PMID 10329445.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Watson P, Forster R, Palmer KJ a kol. (2005). „Spojení výstupu ER s mikrotubuly přímou interakcí COPII s dynaktinem“. Nat. Cell Biol. 7 (1): 48–55. doi:10.1038 / ncb1206. PMC 1592520. PMID 15580264.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Farhan H, Reiterer V, Korkhov VM a kol. (2007). „Koncentrativní export z endoplazmatického retikula transportéru kyseliny gama-aminomáselné 1 vyžaduje vazbu na SEC24D“. J. Biol. Chem. 282 (10): 7679–89. doi:10,1074 / jbc.M609720200. PMID 17210573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150961 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039234 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9872452-5] Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.

[pmid10075675-6] Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (duben 1999). "Proteiny Sec24 a třídění na endoplazmatickém retikulu". J Biol Chem. 274 (12): 7833–40. doi:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID 10075675.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: SEC24D SEC24 příbuzná genová rodina, člen D (S. cerevisiae)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]