Riboswitch SAM-IV - SAM-IV riboswitch

Riboswitch S-adenosyl methionin (SAM),
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence SAM-IV
Identifikátory
Symbol	SAM-IV
Rfam	RF00634 CL00012
Další údaje
RNA typ	Cis-reg; riboswitch
Domény	Bakterie
TAK	SO: 0005836
PDB struktur	PDBe

Riboswitche SAM-IV jsou jakési riboswitch který konkrétně váže S-adenosylmethionin (SAM),^[1] kofaktor používaný v mnoha methylačních reakcích. Původně identifikováno uživatelem bioinformatika,^[2] Riboswitche SAM-IV jsou z velké části omezeny na Actinomycetales, objednávka Bakterie. Zachované vlastnosti riboswitche SAM-IV a experimenty naznačují, že pravděpodobně sdílejí podobné vazebné místo SAM s jinou třídou riboswitchů vázajících SAM zvané Riboswitche SAM-I. Lešení těchto dvou typů riboswitchů se však zdají být zcela odlišná.

Viz také

Reference

^ Weinberg Z, Regulski EE, Hammond MC a kol. (2008). „Jádro aptameru riboswitche SAM-IV napodobuje vazebné místo ligandu riboswitche SAM-I“. RNA. 14 (5): 822–828. doi:10,1261 / rna.988608. PMC 2327355. PMID 18369181.
^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z a kol. (2007). „Identifikace 22 kandidátských strukturovaných RNA v bakteriích pomocí komparativního genomického potrubí CMfinder“. Nucleic Acids Res. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC 1950547. PMID 17621584.

externí odkazy

Stránka pro SAM-IV_riboswitch v Rfam

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Weinberg Z, Regulski EE, Hammond MC a kol. (2008). „Jádro aptameru riboswitche SAM-IV napodobuje vazebné místo ligandu riboswitche SAM-I“. RNA. 14 (5): 822–828. doi:10,1261 / rna.988608. PMC 2327355. PMID 18369181.

[2] Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z a kol. (2007). „Identifikace 22 kandidátských strukturovaných RNA v bakteriích pomocí komparativního genomického potrubí CMfinder“. Nucleic Acids Res. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC 1950547. PMID 17621584.

[1]

[2]