Motiv SAM-Chlorobi RNA - SAM-Chlorobi RNA motif
| RNA SAM-Chlorobi | |
|---|---|
 Konsensuální sekundární struktura RNA SAM-Chlorobi | |
| Identifikátory | |
| Symbol | RNA SAM-Chlorobi |
| Rfam | RF01724 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Cis-regulační prvek |
| Domény | Chlorobi |
| PDB struktur | PDBe |
The Motiv SAM-Chlorobi RNA je konzervovaný RNA struktura, která byla identifikována bioinformatika.[1] RNA se nacházejí pouze v bakterie klasifikován jako v rámci kmen Chlorobi. Tyto RNA jsou vždy v 5 'nepřekládané oblasti z operony které obsahují metK a ahcY geny. metK geny kódují methionin adenosyltransferáza, který syntetizuje S-adenosyl methionin (SAM) a ahcY geny kódují S-adenosylhomocystein hydroláza, které degradují související metabolit S-adenosyl-L-homocystein (SAH). Ve skutečnosti vše předpovězeno metK a ahcY genům v bakteriích Chlorobi od roku 2010 předcházejí předpokládané RNA SAM-Chlorobi.[1] Předpovězeno promotér sekvence se trvale nacházejí proti proudu od RNA SAM-Chlorobi,[1] a tyto promotorové sekvence naznačují, že RNA SAM-Chlorobi jsou skutečně přepsal jako RNA. Promotorové sekvence jsou obvykle spojeny se silnou transkripcí ve kmenech Chlorobi a Bacteroidetes, ale nejsou používány většinou rodů bakterií. Umístění RNA SAM-Chlorobi naznačuje, že se podílejí na regulaci metK / aHcY operon neznámým mechanismem.
Reference
- ^ A b C Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |