RevCen - RevCen - Wikipedia
| RevCen | |
|---|---|
 Zachovaná sekundární struktura RNA RevCen. | |
| Identifikátory | |
| Symbol | RevCen |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; pre-miRNA |
| Domény | Schizosaccharomyces |
| PDB struktur | PDBe |
RevCen je rodina nekódující RNA nalezen v Schizosaccharomyces. Je to megastruktura obsahující několik siRNA které používají RNAi cesta k regulaci heterochromatin formace. Dlouhý přepis RNA tvoří a sekundární struktura s několika kmenové smyčky které zpracovává hráč v kostky do siRNA. Tato siRNA pak iniciuje tvorbu heterochromatinu na centromery z štěpné droždí.[1] Analýza Northern blot potvrdilo, že siRNA byly produkovány z velké struktury RNA RevCen in vivo. Stejně jako u všech siRNA, enzymu hráč v kostky je zodpovědný za disekci dsRNA do 21nt úsek dvouvláknové RNA. Lidský rekombinantní dicer enzym zpracoval strukturu RevCen in vitro, ačkoli stejná aktivita kvasinek Dcr1 nebyla potvrzena.[1]
Jedná se o jiný mechanismus než ten, který zahrnuje dobře pochopené RITS (RNA vyvolaná iniciace transkripce umlčování genů ) komplexní.[2][3] Bylo navrženo, že oba mechanismy spolupracují, přičemž struktura RevCen potenciálně funguje jako záložní systém, když dojde ke ztrátě dvouvláknových prekurzorů siRNA generovaných Rdp1.[1]
Reference
- ^ A b C Djupedal I, Kos-Braun IC, Mosher RA a kol. (Prosinec 2009). „Analýza malé RNA ve štěpných kvasinkách; centromerické siRNA jsou potenciálně generovány prostřednictvím strukturované RNA“. EMBO J.. 28 (24): 3832–3844. doi:10.1038 / emboj.2009.351. PMC 2797062. PMID 19942857.
- ^ Sugiyama T, Cam H, Verdel A, Moazed D, Grewal SI (leden 2005). „RNA-dependentní RNA polymeráza je nezbytnou součástí samonabíjecí smyčky spojující heterochromatinovou sestavu s produkcí siRNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (1): 152–157. doi:10.1073 / pnas.0407641102. PMC 544066. PMID 15615848.
- ^ Verdel A, Jia S, Gerber S a kol. (Leden 2004). "RNAi zprostředkované cílení heterochromatinu komplexem RITS". Věda. 303 (5658): 672–676. doi:10.1126 / science.1093686. PMC 3244756. PMID 14704433.
Další čtení
- Vavasseur; et al. (2008). „Sestava heterochromatinu a umlčování transkripčních genů pod kontrolou nukleárních RNAi: poučení z štěpných kvasinek“. RNA a regulace genové exprese: skrytá vrstva složitosti. Norfolk: Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-25-7.
- Sigova A, Rhind N, Zamore PD (říjen 2004). „Jediný protein Argonaute zprostředkovává transkripční i posttranskripční umlčování u Schizosaccharomyces pombe“. Genes Dev. 18 (19): 2359–2367. doi:10.1101 / gad.1218004. PMC 522986. PMID 15371329. Citováno 2010-08-17.
- Steiner NC, Hahnenberger KM, Clarke L (srpen 1993). „Centromery štěpných kvasinek Schizosaccharomyces pombe jsou vysoce variabilní genetická místa“. Mol. Buňka. Biol. 13 (8): 4578–4587. doi:10.1128 / MCB.13.8.4578. PMC 360078. PMID 8336703.
- Takahashi K, Murakami S, Chikashige Y, Niwa O, Yanagida M (březen 1991). "Velké množství genů tRNA je symetricky umístěno v centromerech štěpných kvasinek". J. Mol. Biol. 218 (1): 13–17. doi:10.1016/0022-2836(91)90867-6. PMID 2002498.