Raoultella planticola - Raoultella planticola

Raoultella planticola
Raoultella planticola na citrátovém agaru.jpg
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Gammaproteobakterie
Objednat:
Enterobacterales
Rodina:
Enterobacteriaceae
Rod:
Raoultella
Druh:
R. planticola
Binomické jméno
Raoultella planticola
Bagley a kol. 1982[1]
Synonyma

Klebsiella planticola,[2][3][4][5][6][7][8] Klebsiella trevisanii[9]

Raoultella planticola je Gramnegativní[10] bakterie z rod Raoultella.[5][11][12][13][14][15][16] R. planticola je docela podobný vzhled jako Klebsiella pneumoniae a musí být identifikovány na základě růstových návyků nebo analýzy DNA. Bylo identifikováno několik kmenů.[17][18] R. planticola bylo zjištěno, že komplikoval alespoň jeden případ závažného stavu pankreatitida.[19]

Kmeny

A kmen z Raoultella planticolaBylo zjištěno, že Cd-1 roste anaerobně při vysokém obsahu vody kadmium koncentrace a sraženiny nerozpustné sulfid kademnatý. Tento kmen byl izolován z redukce sedimentů solných bažin a může být užitečný v bioremediace kadmia z exponovaných půd.[20]

Taxonomická reklasifikace

Raoultella planticola byl dříve klasifikován jako součást rodu Klebsiella. To bylo překlasifikováno spolu s několika dalšími Klebsiella druhů v roce 2001.[21]

Genetická úprava

Na konci 80. let R. planticola byl geneticky modifikován vložením a plazmid z Zymomonas mobilis. Tento plazmid kóduje enzym pyruvát dekarboxyláza který spolu s alkohol dehydrogenáza již přítomné v bakteriích umožňují jeho produkci ethanol. Bakterie již produkují ethanol při metabolizaci hexóz a pentóz, ale velmi neúčinně. R. planticola byl vybrán pro příjem tohoto genu, protože již měl metabolické cesty k rozpadu pentózových cukrů, jako je xylóza, která je hlavní složkou zemědělských a lesních zbytků.[22][23] Výsledky ukázaly, že geneticky modifikovaný kmen mohl produkovat ethanol, ale byl usmrcen při koncentracích ethanolu vyšších než 5%. Modifikovaný kmen také produkoval více ethanolu při nižším pH (5,4) a produkce ethanolu se snižovala se zvyšujícím se pH.[22]

Na počátku 90. let se biotechnologická společnost pustila do řešení problému: jak bezpečně zničit zbytky plodin. Zbytky některých plodin obsahují rostlinné patogeny. Hoření se příležitostně používá ke zničení zbytků a patogenů, jedná se však o riziko požáru a může být nebezpečné pro životní prostředí. Tato společnost si to uvědomila, protože R. planticola je agresivní a hojná půdní bakterie, mohla by být geneticky modifikována, aby zničila zbytky plodiny a také vytvořila ethanol.

Testování tohoto procesu se však omezilo na sterilní půdu. Ph.D. výzkum prováděný v Oregonská státní univerzita, kontrolován Elaine Ingham, získal vzorek geneticky upravený organismus za posouzení ekologických účinků prostřednictvím německého institutu pro biotechnologie a jeho testování v nesterilní (běžné) půdě zjistilo, že modifikované bakterie způsobily hromadnou smrt rostlin z výroby ethanolu.[24][25][26] R. planticola je všudypřítomný a roste v kořenových systémech všech druhů rostlin všude.[25] Proto někteří[SZO? ] spekulovali, že bez nezávislého testu by geneticky modifikované bakterie mohl být zaveden do přírody a poté by se mohl rozšířit a kontaminovat biosféru tam, kde by způsobil celosvětovou smrt rostlin.[27][25]

V epizodě „Pyramida na konci světa "z BBC televizní show Doktor kdo Doktor zastaví geneticky modifikovaný kmen R. Planticola způsobit celosvětový úhyn rostlin a zvířat podobný scénáři, o kterém někteří vědci spekulovali.

Klam tvrzení o GMO

Veřejné svědectví o tvrzení Inghama a dalších o „celosvětové smrti rostlin“ přitahovalo pozornost vědecké komunity. Nepodařilo se jim najít žádné důkazy o tom, že doktorka Inghamová předložila svá tvrzení o ohrožení života suchozemských rostlin k vědeckému zveřejnění v recenzovaném časopise, přičemž nebyly nalezeny žádné důkazy, které by naznačovaly, že US EPA nebo americké ministerstvo zemědělství přezkoumaly nebo schválily jakékoli zkoušky pro SDF20[je zapotřebí objasnění ]. Dále bylo zjištěno, že SDF20 produkoval v půdě 20 mikrogramů alkoholu na mililiter alkoholu, což je několik setkrát nižší množství, než je nutné pro ovlivnění růstu rostlin.[28]

Elaine Inghamová se veřejně omluvila za podání nepravdivých tvrzení o ekologických dopadech GMO.[29]

The Strana zelených Nového Zélandu vydal veřejnou omluvu za zavádějící prohlášení a uznává, že citovaný výzkum nebyl nikdy publikován.[30]

Reference

  1. ^ Podrobnosti záznamu jmenné banky. Ubio.org (2003-04-28). Citováno 2011-10-21.
  2. ^ Podrobnosti záznamu jmenné banky. Ubio.org (2005-09-22). Citováno 2011-10-21.
  3. ^ Prohlížeč taxonomie (Raoultella planticola). Ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2011-10-21.
  4. ^ Klebsiella srov. planticola B43 - Encyklopedie života. EOL (2011-09-28). Citováno 2011-10-21.
  5. ^ A b „Roční kontrolní seznam 2010 :: Podrobnosti o druzích“. Katalog života. Citováno 2012-05-07.
  6. ^ Podrobnosti záznamu jmenné banky. Ubio.org (2003-04-28). Citováno 2011-10-21.
  7. ^ Smlouva o používání dat - portál GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Citováno 2011-10-21.
  8. ^ Smlouva o používání dat - portál GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Citováno 2011-10-21.
  9. ^ Raoultella planticola. Thelabrat.com. Citováno 2011-10-21.
  10. ^ Bagley, Susan T .; Seidler, Ramon J .; Brenner, Don J. (březen 1981). „Klebsiella planticola sp. Nov .: Nový druh enterobacteriaceae vyskytující se primárně v neklinických prostředích“. Současná mikrobiologie. 6 (2): 105–109. doi:10.1007 / BF01569013.
  11. ^ Raoultella planticola. Zipcodezoo.com (06.04.2009). Citováno 2011-10-21.
  12. ^ Smlouva o používání dat - portál GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Citováno 2011-10-21.
  13. ^ Smlouva o používání dat - portál GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Citováno 2011-10-21.
  14. ^ Podrobnosti záznamu jmenné banky. Ubio.org (2005-09-22). Citováno 2011-10-21.
  15. ^ NLBIF: Raoultella planticola (Bagley et al. 1982) Drancourt et al. 2001. Nlbif.nl. Citováno 2011-10-21.
  16. ^ Raoultella planticola - Encyclopedia of Life. EOL. Citováno 2011-10-21.
  17. ^ Raoultella planticola (Klebsiella planticola). Uniprot.org. Citováno 2011-10-21.
  18. ^ Pas taxonu Raoultella planticola. StrainInfo. Citováno 2011-10-21.
  19. ^ Alves MS, Riley LW, Moreira BM (květen 2007). „Případ těžké pankreatitidy komplikovaný Raoultella planticola infekce". J. Med. Microbiol. 56 (Pt 5): 696–8. doi:10,1099 / jmm. 0,46889-0. PMID  17446297.
  20. ^ Sharma, P. K .; Balkwill, D. L .; Frenkel, A .; Vairavamurthy, M. A. (1. července 2000). „Nový kmen Klebsiella planticola (Cd-1) roste anaerobně při vysokých koncentracích kadmia a vysráží sulfid kademnatý“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 66 (7): 3083–3087. doi:10.1128 / AEM.66.7.3083-3087.2000. PMC  92115. PMID  10877810.
  21. ^ Drancourt, M; Bollet, C; Carta, A; Rousselier, P (2001). „Fylogenetické analýzy druhů Klebsiella vymezují Klebsiella A raoultella gen. nov., s popisem Raoultella ornithinolytica comb. Listopad, Raoultella terrigena comb. Listopad a Raoultella planticola comb. Listopad". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (Pt 3): 925–32. doi:10.1099/00207713-51-3-925. PMID  11411716.
  22. ^ A b Tolan, JS; Finn, RK (září 1987). "Fermentace d-xylózy na ethanol pomocí geneticky modifikované Klebsiella planticola". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 53 (9): 2039–44. PMC  204054. PMID  16347427.
  23. ^ Feldmann, Sigrun; Sprenger, Georg A .; Sahm, Hermann (srpen 1989). „Produkce ethanolu z xylózy s mutantem pyruvát-formiát-lyáza z Klebsiella planticola nesoucí gen pyruvát-dekarboxylázy ze Zymomonas mobilis“. Aplikovaná mikrobiologie a biotechnologie. 31 (2): 152–157. doi:10.1007 / BF00262454.
  24. ^ Holmes, Michael T (1995). Ekologické hodnocení po přidání geneticky upravené Klebsiella planticola SDF20 do půdy (Ph.D.). Oregonská státní univerzita. hdl:1957/34510.
  25. ^ A b C Elaine Ingham (Zima 1999). „Dobré úmysly a technické organizace, které zabíjejí pšenici“. Syntéza / regenerace. Č. 18. Citováno 2015-11-24.
  26. ^ Holmes, M. T .; Ingham, E. R.; Doyle, J. D .; Hendricks, C. W. (01.01.1999). "Účinky Klebsiella planticola SDF20 o půdní biotě a růstu pšenice v písčité půdě ". Aplikovaná ekologie půdy. 11 (1): 67–78. doi:10.1016 / S0929-1393 (98) 00129-2.
  27. ^ „Klebsiella planticola - monstrum se změnou genů, které se téměř dostalo pryč“. Státní univerzita v San Francisku. Citováno 2015-11-24.
  28. ^ Porterfield, Andrew (06.09.2016). „Slyšel jsi o GMO, které téměř zničilo celý život?“. genetickýliteracyprojekt.org. Projekt genetické gramotnosti. Citováno 6. září 2016.
  29. ^ Fletcher, Liz (2001). „Nový Zéland GMO debakl podkopává zelenou lobby“. Přírodní biotechnologie. Příroda. 19 (4): 292. doi:10.1038/86618. PMID  11283556.
  30. ^ Aotearoa, Strana zelených z. „Dodatek k důkazům předloženým Královské vyšetřovací komisi pro genetické modifikace“. gen.ch. Citováno 6. října 2016.

Další čtení

externí odkazy