Ranajit Chakraborty - Ranajit Chakraborty

Ranajit Chakraborty
Ranajit Chakraborty.jpg
Chakraborty, ca. 2008
narozený
Ranajit Chakraborty

(1946-04-17)17.dubna 1946
Baranagore (Západní Bengálsko ), Indie
Zemřel23. září 2018(2018-09-23) (ve věku 72)
hodnota pevnosti, Texas, Spojené státy
Národnostamerický
Alma materIndický statistický institut
Manžel (y)Dr. Bandana M. Chakraborty
Vědecká kariéra
PoleLidská genetika
Populační genetika
Forenzní genetika
InstituceUniversity of Texas Health Science Center v Houstonu
University of Cincinnati
University of North Texas
Doktorský poradceC. R. Rao

Ranajit Chakraborty (17. dubna 1946 - 23. září 2018) byl člověk a populace genetik.[1] V době své smrti působil jako ředitel Centra pro výpočetní genomiku na Ústavu aplikované genetiky a profesor na Ústavu forenzní a vyšetřovací genetiky na Ústavu aplikované genetiky. University of North Texas Health Science Center v hodnota pevnosti, Texas.[1] Mezi jeho vědecké příspěvky patří studie v lidská genetika, populační genetika, genetická epidemiologie, statistická genetika, a forenzní genetika.

raný život a vzdělávání

Ranajit Chakraborty se narodil v roce Baranagore (Západní Bengálsko ), Indie. Na jeho dokončení studia na střední škole v roce 1963 mu byla udělena první třída s vyznamenáním certifikát od rady pro střední vzdělávání v Západním Bengálsku. V roce 1967 získal titul bakaláře statistiky (s vyznamenáním) na Indický statistický institut, Kalkata O rok později získal titul Master of Statistics (specializace Matematická genetika a Pokročilá pravděpodobnost). V roce 1971 získal titul Ph.D. v Biostatistika z Indický statistický institut.[1] Vedoucím jeho disertační práce byl C. R. Rao, FRS. Předtím, než získal svou první akademickou pozici ve funkci držitele titulu, působil Chakraborty jako vědecký pracovník a vedoucí vědecký pracovník v Indickém statistickém institutu, hostující lektor statistiky na Indický institut managementu a hostující konzultant v datovém referenčním centru Světová zdravotnická organizace na University of Hawaii v Honolulu.

Akademická kariéra

V roce 1973 se Chakraborty připojil k fakultě Centra pro demografickou a populační genetiku, které je nyní Centrem lidské genetiky, při University of Texas Health Science Center v Houstonu. V letech 1996 až 2001 působil na Vysoké škole veřejného zdraví jako profesor Allana Kinga. V roce 2001 se stal profesorem a ředitelem Centra pro informace o genomu Robert A. Kehoe v Lékařské centrum University of Cincinnati v Cincinnati, Ohio. V roce 2009 vstoupil Chakraborty do oddělení forenzní a vyšetřovací genetiky, University of North Texas Health Science Center, hodnota pevnosti, Texas.

Kromě svých hlavních akademických jmen působil po celou dobu své kariéry Chakraborty v různých funkcích na fakultách University of Houston, Stanfordská Univerzita, University of Stockholm, Michiganská univerzita, Rice University, a Universidad de Chile.

Vědecké příspěvky

Ranajit Chakraborty napsal šest knih a více než 600 vědeckých článků.[2][3][4] Tři z nich se staly citační klasikou.[5]

Příspěvky Chakrabortyho do výzkumu byly ve třech hlavních oblastech. Během první fáze své profesionální kariéry přispěl k rozvoji populační genetika a molekulární evoluce. Ve spolupráci s Masatoshi Nei Takeo Maruyama a Paul Fuerst studovali mimo jiné účinky úzkých míst na genetickou variabilitu,[3] rozdělení frekvencí alel,[6] a distribuce heterozygotnosti jednoho lokusu.[7] Přispěl také k vývoji dvou hlavních modelů mutací v populační genetice: the model nekonečných alel[8] a model postupné mutace.[9] Ranajit Chakraborty poskytl velké množství metodických příspěvků k populační genetice, jako je použití počtu vzácných alel na místo k odhadu rychlostí mutací.[10]

Druhou oblastí, do které významně přispěl, byla lidská genetika a lidské epidemiologie. Mimo jiné studoval účinky pokrevní příbuznost a pokrevní manželství genetická zátěž,[11] genetika obezity,[12] onemocnění žlučníku,[13] a diabetes typu II.[14]

Jeho třetí oblastí zájmu výzkumu byla forenzní genetika, tj. Použití údajů o DNA a genetické metodologie v procesu identifikace jednotlivce zpočátku v trestních a občanských věcech a později při určování etnických předků a vztahů. Jeden z hlavních příspěvků Dr. Chakrabortyho k metodologii identifikace pomocí údajů DNA se týkal výběru kontrolních skupin pro vyloučení chyb v identifikaci a pro výpočet přesné pravděpodobnosti těchto dvou typů chyb (falešně pozitivní a falešně negativní). Rovněž přispěl ke studiu mikrobiální forenzní analýzy, tj. Rychlé identifikace bakteriálních látek používaných v bioterorismu a biokriminalitě.[15]

V roce 1991 Ranajit Chakraborty a Kenneth Kidd publikoval jeden z prvních článků o užitečnosti údajů o DNA ve forenzní oblasti.[16] Důležitost tohoto dokumentu v rychlém přijetí metod založených na DNA právním systémem byla často komentována.[17]

Vědecké společnosti, služby a vyznamenání

Dr. Chakraborty byl členem nebo doživotním členem tuctu vědeckých společností, mezi nimi Mezinárodní asociace lidských biologů, Indická společnost lidské genetiky, Americká společnost lidské genetiky, The Genetická společnost Ameriky, Americká společnost přírodovědců, Sigma Xi a Mezinárodní asociace pro otisky prstů DNA. Působil jako člen správní rady American Dermatoglyphics Association (1986-1890), viceprezident Indické společnosti pro lidskou ekologii (1990) a viceprezident (1998-1999) a prezident (1999-2000) the Americká asociace antropologické genetiky. V roce 2001 se stal čestným doživotním členem chorvatského sdružení antropologické genetiky a v roce 2003 se stal zahraničním spolupracovníkem Chilská akademie věd.

Veřejná služba

Vývoj identifikačních metod založených na datech DNA na konci 80. let upozornil veřejnost a vládu na velkou část práce Dr. Chakarbortyho. V roce 1995 se stal členem podvýboru pro DNA státu New York a v období 1995–2000 působil jako člen amerického vládního Národního poradního výboru pro DNA. V obou případech Chakraborty pomohl vyvinout zásady pro používání DNA a schválil metodiky a statistické nástroje v identifikačních postupech.

V roce 1995 Chakraborty a Dan Hartl svědčil pro stíhání v Případ vraždy O. J. Simpsona.

V roce 1998 byl Chakraborty oceněn Federální úřad pro vyšetřování Cena za „úsilí o výzkum ve forenzní DNA během desetiletí DNA 1989–1998“. V roce 2001 se Dr. Chakraborty stal členem poradního výboru ve společnosti Celera Genomics jednat s 9/11 identifikace oběti mtDNA markery. V roce 2002 se Chakraborty stal členem Pracovní skupiny bakteriální forenzní genetiky na FBI Academy.

Chakraborty svědčil v letech 2012–2014 Frye standard Slyšení před brooklynským soudcem Markem Dwyerem za účelem stanovení platnosti a přípustnosti metody široce používané hlavním lékařem v New Yorku k identifikaci osob na základě vzorků obsahujících směsi krve od různých lidí. Jeho svědectví bylo zásadní při reorganizaci newyorských protokolů pro takovéto identifikace a pro znovuotevření mnoha případů dříve rozhodovaných na základě chybné metody.[18]

Reference

  1. ^ A b C „In Memoriam - Dr. Ranajit Chakraborty“ (PDF). MEZINÁRODNÍ KOMISE O RADIOLOGICKÉ OCHRANĚ. 28. září 2018. Citováno 4. listopadu 2018.
  2. ^ Chakraborty R, Shaw MW, Schull WJ. 1974. Vyloučení otcovství: Současný stav techniky. Dopoledne. J. Hum. Genet. 26: 477-488.
  3. ^ A b Nei M, Maruyama T, Chakraborty R. 1975. Efekt úzkého hrdla a genetická variabilita v populacích. Evoluce 29: 1-10.
  4. ^ Nei M, Fuerst PA, Chakraborty R. 1976. Testování hypotézy neutrální mutace distribucí heterozygotnosti jednoho lokusu Nature 262: 491-493.
  5. ^ http://garfield.library.upenn.edu/classics1989/A1989CB63700001.pdf
  6. ^ Chakraborty R, Fuerst PA, Nei M. 1980. Statistické studie polymorfismu proteinů v přírodních populacích. III. Rozdělení frekvencí alel a počet alel na lokus. Genetics 94: 1039-1063.
  7. ^ Nei M, Fuerst PA, Chakraborty R. 1976. Testování hypotézy neutrální mutace distribucí heterozygotnosti jednoho lokusu. Nature 262: 491-4913.
  8. ^ Nei M, Chakraborty R, Fuerst PA. 1976. Nekonečný model alely s různou rychlostí mutace. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 73: 4164-4168.
  9. ^ Chakraborty R, Nei M. 1977. Účinky úzkého hrdla na průměrnou heterozygotnost a genetickou vzdálenost s modelem postupné mutace. Evoluce 31: 347-356.
  10. ^ Chakraborty R. 1981. Očekávaný počet vzácných alel na lokus ve vzorku a odhad rychlosti mutací. Dopoledne. J. Hum. Genet. 33: 481-484.
  11. ^ Chakraborty R, Chakravarti A. 1977. O pokrevních manželstvích a genetické zátěži. Hučení. Genet. 36: 47-54.
  12. ^ Karns R a kol. 2013. Modelování metabolického syndromu prostřednictvím strukturních rovnic metabolických vlastností, komorbidních onemocnění a variant GWAS. Obezita 21: E745-754.
  13. ^ Hanis CL, Chakraborty R, Ferrell RE, Schull WJ. 1986. Odhady individuálních příměsí: asociace chorob a individuální riziko cukrovky a onemocnění žlučníku mezi Američany Mexičana v okrese Starr v Texasu. Dopoledne. J. Phys. Anthropol. 70: 433-441.
  14. ^ Hanis CL a kol. 1996 Genomové hledání lidských genů pro diabetes bez závislosti na inzulínu (typu 2) odhalilo hlavní lokus citlivosti na chromozomu 2. Nat. Genet. 13: 161-166.
  15. ^ Budowle B a kol. 2008. Kritéria pro validaci metod v mikrobiální forenzní praxi. Appl. Environ. Microbiol. 74: 5599–5607.
  16. ^ Chakraborty R, Kidd KK. 1991. Užitečnost typizace DNA ve forenzní práci. Science 254: 1735-1739.
  17. ^ Giannelli PC. 1998. Příběh DNA: Alternativní pohled. Journal of Criminal Law and Criminology 88: 380-422.
  18. ^ Lauren Kirchner. 2017. Stopy kriminality: Jak byly znehodnoceny newyorské techniky DNA. https://www.nytimes.com/2017/09/04/nyregion/dna-analysis-evidence-new-york-disputed-techniques.html